记一次使用gephi绘图报内存溢出错误解决办法

最新推荐文章于 2024-01-31 11:30:00 发布

S u again.

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文章标签： java

本文链接：https://blog.csdn.net/suagain/article/details/125179200

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在使用Gephi进行微生物网络图分析时遇到内存溢出错误。通过搜索，发现大部分解决方案是增加JVM内存配置。但我的gephi.conf默认配置已经很高，于是尝试减小内存分配，将J-Xmx从11G改为8192M，问题得到解决。反其道而行之，有时也能成功解决不寻常的问题。

摘要由CSDN通过智能技术生成

使用gephi进行微生物网络图分析的时候，报内存溢出，这里是报错原图
博客里面搜索只有一篇帖子还是Mac的，只好通过其他方式搜索，大多都是修改gephi安装目录下的/etc/gephi.conf配置文件如下配置

# command line switches
default_options=“–branding gephi -J-Xms64m -J-Xmx512m -J-Xverify:none -J-Dsun.java2d.noddraw=true-J-Dsun.awt.noerasebackground=true-J-Dnetbeans.indexing.noFileRefresh=true -J-Dplugin.manager.check.interval=EVERY_DAY”

将里面的J-Xmx512m改为你想要的大小，例如J-Xmx1024m就是1G的内存了。

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weixin_30323179的博客

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Gephi运行问题

gfoguijlnkl的博客

05-10

1137

求教各位大神，安装Gephi后，打开报错如下，是我哪里安装出了问题啊，界面上什么都没得，运行自带的示例也不行

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内存溢出

Gem_0104的博客

01-26

465

内存溢出(out of memory) ：是指程序在申请内存时，没有足够的内存空间供其使用，出现out of memory(OOM)那就是内存溢出。内存溢出也就是内存不够用。 内存溢出原因: 1.Android系统为每个应用程序申请到的内存有限,一般为16M或者24M 也有98M 221M等,我们可以在清单文件中进行配置,android:largeheap = “true” 从而给APP申请更大的内存空间; 2.当应用程序产生的内存泄漏较多时,就会使程序所需要的内存超出系统分配的内存空间,导致内存溢出; 内

遇到内存溢出的解决办法

super005的专栏

08-10

990

昨天在模拟器上给gallery放入图片的时候，出现java.lang.OutOfMemoryError: bitmap size exceeds VM budget 异常，图像大小超过了RAM内存。 模拟器RAM比较小，只有8M内存，当我放入的大量的图片（每个100多K左右），就出现上面的原因。由于每张图片先前是压缩的情况。放入到 Bitmap的时候，大小会变大，导致超出RAM内存，具体解决办法如下： //解决加载图片 内存溢出的问题<b

Mac下Gephi报内存溢出的错误修改方法

wang_306的专栏

03-18

3986

网上一般能搜到gephi报内存溢出的错误修改方法，就是改/etc/gephi.conf这个文件，但是mac下的这个文件是处在 /Applications/Gephi.app/Contents/Resources/gephi/etc下的，与其他系统的不同。至于修改方法都是一样的： # command line switches default_options=“–branding gephi -J-...

修改gephi最大内存的方法

JiangLongShen的博客

04-04

3932

1.找到gephi的安装文件。 2.打开根目录下etc/gehi.conf 3将如下代码： command line switches default_options=“–branding gephi -J-Xms64m -J***-Xmx512m*** -J-Xverify:none -J-Dsun.java2d.noddraw=true-J-Dsun.awt.noerasebackground...

Gephi启动报错JVM creation failed解决办法

SunCherryDream的专栏

01-04

2370

使用Gephi做可视化，由于图中边比较多，2002个点的文件达到了18M多，然后启动Gephi后显示内存不足，建议增大启动内存，点增大内存启动后，Gephi启动就报错，显示JVM creation failed。启动控制台监视启动过程，显示如下信息 Error occurred during initialization of VM Could not reserve enough spa

gephi绘图工具

03-12

Gephi是一款强大的开源图形化网络分析和可视化软件，它为研究人员、数据分析师以及设计师提供了一个灵活的平台，用于探索和理解复杂的数据网络。在社会学、信息科学、计算机科学等多个领域，Gephi被广泛应用于揭示...

Gephi使用教程

12-23

Gephi是一款功能强大的开源和免费的网络分析和可视化软件，它被广泛应用于社交网络分析、生物网络研究、数据可视化等领域。Gephi的一个核心特点就是能够提供丰富的网络分析和可视化功能，即使对于初学者而言，也能够...

gephi0.10.1

06-10

1、可以根据excel存储的邻接矩阵生成图数据结构的节点拓扑形式，进行可视化 2、可以用于实体关系图的绘制

修改Gephi最大内存的方法

neuqxzy的专栏

04-15

9804

修改Gephi最大内存的方法： 1、找到Gephi的安装文件 2、打开根目录下etc/gehi.conf 3、将如下代码： # command line switchesdefault_options=“–branding gephi -J-Xms64m -J-Xmx512m -J-Xverify:none -J-Dsun.java2d.noddraw=true

Gephi弹出JVM Creation failed

漫游学海之旅

09-13

2659

问题：启动gephi时，弹出“JVM creation failed”错误 解决办法：打开gephi 的配置文件 gephi.conf 文件将图修改中红色方框部分为-J-Xmx512m 或者改为 -J-Xmx256m

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Gephi启动错误：Cannot load even default layout, using internally predefined

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