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python模拟登陆爬取webserver 输出结果
#科研过程中,有时候需要批量爬取Webserver预测得到的静态(动态)数据。以磷酸化位点信息为例,用python实现其过程。import reimport urllibimport numpy as npfrom bs4 import BeautifulSoupdef crawl_web_phosp(seq_all): url = "http://www.dabi.te...原创 2019-10-24 15:23:40 · 196 阅读 · 0 评论 -
【python】实现网络简单爬虫
转自:https://blog.csdn.net/feit2417/article/details/85925586转载 2019-09-24 15:34:20 · 160 阅读 · 0 评论 -
python统计学习方面的包--statsmodels
转自:https://blog.csdn.net/qq_41518277/article/details/80275280statsmodels与scikit-learn比较,statsmodels包含经典统计学和经济计量学的算法。包括如下子模块:回归模型:线性回归,广义线性模型,健壮线性模型,线性混合效应模型等等。方差分析(ANOVA)。时间序列分析:AR,ARMA,ARIM...转载 2019-09-24 10:12:15 · 1732 阅读 · 0 评论 -
python 中subprocess.Popen()详解
转自:https://www.jianshu.com/p/9d4e4cf06d23##################################################################################################python中的subprocess.Popen()使用从python2.4版本开始,可以用subproces...转载 2019-08-19 09:40:16 · 114991 阅读 · 0 评论 -
python 绘制ROC图像
# -*- coding: utf-8 -*-import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn import svm, datasets from sklearn.metrics import roc_curve, auc ###计算roc和auc from sklearn import cross...原创 2019-03-03 15:46:37 · 1140 阅读 · 1 评论 -
python绘制折线图(多条)
# encoding=utf-8from matplotlib import pyplotimport matplotlib.pyplot as pltnames = range(8,21)names = [str(x) for x in list(names)]x = range(len(names))y_train = [0.840,0.839,0.834,0.832,0.8...原创 2019-01-07 10:14:43 · 59744 阅读 · 2 评论 -
110道python面试笔试题汇总
数据分析系列教程插播一篇面试题教程,最近公众号新来了不少朋友,这几天不少粉丝留言说问我有没有python面试题,其实之前分享过一些面试题,今天统一再给大家分享一遍,也希望能帮助此时仍在找工作的同学,尽快找到工作,该文110道面试题全部来自于大家笔试面试时候拍照后发到群里求助的题目,并自己一道一道亲自做了,大部分题目属于巩固基本python知识点的题目,希望对基本知识不熟悉的同学,能认真做一遍,肯定...转载 2019-01-01 10:17:40 · 367 阅读 · 0 评论 -
Python 与 IPython 的区别(转载)
转自:https://blog.csdn.net/ztf312/article/details/78677093转载 2018-12-20 09:51:48 · 3434 阅读 · 0 评论 -
提供给开发者 10 款最好的 Python IDE
转自:https://www.oschina.net/news/57468/best-python-ide-for-developersPython 非常易学,强大的编程语言。Python 包括高效高级的数据结构,提供简单且高效的面向对象编程。Python 的学习过程少不了 IDE 或者代码编辑器,或者集成的开发编辑器(IDE)。这些 Python 开发工具帮助开发者加快使用 Python...转载 2018-11-30 11:22:13 · 123 阅读 · 0 评论 -
用python获取复杂度的P值
#coding:utf-8import osimport matplotlib.pyplot as pltplt.switch_backend('agg')path = os.getcwd()f_fasta = open(path+'/fac_cpx.txt','r')list_data = []for line in f_fasta.readlines(): line = l...原创 2018-10-08 18:19:49 · 1043 阅读 · 0 评论 -
python绘制多因子变量箱图
# -*- coding: utf-8 -*-import pandas as pdimport seaborn as sns#from scipy import statsimport matplotlib.pyplot as plt#from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPagese_i='TAD'def plot_bo...原创 2018-10-08 07:26:41 · 2433 阅读 · 0 评论 -
Python脚本提取氨基酸序列的 阿贝尔复杂度
def get_set_number(a): #get Abe_cpx combination not the rank a_2 = [] for i in range(len(a)): a[i] = sorted(a[i]) a[i] = ''.join(a[i]) a_2.append(a[i]) a_2_set ...原创 2018-10-07 13:37:50 · 836 阅读 · 0 评论 -
Python脚本提取氨基酸序列的 因子复杂度
定义 函数如下:def fac_cpx(w): keep_str = [] for j in range(len(w)+1): for i in range(len(w)-j+1): keep_str.append(w[i:i+j]) keep_str = list...原创 2018-10-07 10:09:00 · 1225 阅读 · 0 评论 -
python 绘制密度散点图
#coding : utf-8import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npplt.switch_backend('agg')###Make the locical cpx_num###def loc_n(N,seq_num_name): #the type of seq_num_name is str n = N-1 f_...原创 2018-10-12 15:59:46 · 6467 阅读 · 2 评论 -
用Python绘制ROC曲线
# 如果Anaconda中没有安装sklearn包,需要先导入sklearn包等import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom sklearn import svm, datasetsfrom sklearn.metrics import roc_curve, auc ###计算roc和aucfrom sklearn im...转载 2018-09-19 16:13:32 · 2412 阅读 · 0 评论 -
用python脚本将DNA序列的.fa文件格式转换为.npy
#.fa 文件转换为 .npy之后作为DL学习的原始数据# from .fa gettig npy(train/valid/test)import os import numpy as nppath = os.getcwd()#################get the ENHANCER proper .fa file#################enh_list = ...原创 2018-09-16 09:38:45 · 1051 阅读 · 0 评论