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【转载】[特征向量在线提取工具Pse-in-One 2.0
1、Pse-In-One 简单介绍机器学习分类算法方法主要依赖于根据蛋白质的结构以及功能特性构建的特征集合,通过构造具有辨别性的特征集合来达到令人满意的分类结果,但是使用一个能够反映序列模式信息并能够保持关键序列信息的离散模型或向量是一个困难的任务。通过特征提取工具帮助科研工作者进行特征提取,自动生成需要的特征将会带来很大的便捷。Pse-In-One 便是一种能够按照用户定义的特征生成特征向量...转载 2020-01-17 10:47:20 · 1445 阅读 · 0 评论 -
TCGA-命名小介
#TCGA是生信或者医学行业常见的公共数据库,在TCGA中,一个患者可能会对应多个样本,如TCGA-A6-6650可以得到3个样本数据:TCGA-A6-6650-01A-11R-1774-07TCGA-A6-6650-01A-11R-A278-07TCGA-A6-6650-01B-02R-A277-07大家知道一般在做TCGA数据分析的时候样本名实际上只保留到前四个元素(以”-“分割...转载 2019-11-14 10:43:17 · 645 阅读 · 1 评论 -
哪些期刊最喜欢生信类SCI文章(1~5分)?
转自:https://www.sohu.com/a/237572866_652735 今天来讲讲大家最关心的1~5分生信类的SCI文章发表情况。为什么说大家最关心1~5分的呢?因为首先,这类文章属于article,被单位所认可和接受。然后1分以下的SCI文章可以说大家都不缺少,甚至可以偏激地认为“一文不值”,而5分以上SCI呢,又太难了,好不容易有个OT(Oncotarget)可以灌灌...转载 2018-11-13 08:48:25 · 15616 阅读 · 0 评论 -
Linux下查看已安装软件
linux安装软件的方式比较多,总结起来有如下几类:第1类、rpm包安装的,可以用rpm -qa看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep “软件或者包的名字”。 rpm -qa | grep"package's name" 第2类、deb包安装的,可以用dpkg -l能看到。如果是查找指定软件包,用dpkg -l | ...原创 2019-08-04 12:13:53 · 36977 阅读 · 0 评论 -
全基因组关联分析(GWAS)常见问题(工具,概念,脚本)
转自:https://blog.csdn.net/weixin_34409703/article/details/86399803vcftoolsplink的主要功能:数据处理,质量控制的基本统计,群体分层分析,单位点的基本关联分析,家系数据的传递不平衡检验,多点连锁分析,单倍体关联分析,拷贝数变异分析,Meta分析等等。首先必须了解plink的三种格式:bed、fam和b...转载 2019-08-02 14:28:12 · 9922 阅读 · 0 评论 -
全基因组关联分析(GWAS)实现途径之一
转自:简书;链接:https://www.jianshu.com/p/bf7e67680414#################################################写在前面:本文为自己在学习过程中看过各类资料后整理做的笔记,纯属方便自己学习以及后期回顾,也希望有幸能帮助到和我一样的小白们,各位大神如果发现有错误即使纠正,我们共同学习!特别感谢所有我阅读过的各类...转载 2019-08-02 15:06:27 · 6417 阅读 · 0 评论