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田田田�
这个作者很懒,什么都没留下…
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R语言学习笔记
在这里记录下学习R过程中的一些小问题一,rnorm(10, mean = 0, sd = 1) # 正态分布的随机数二,R read.table()读取数据过程中row.names=1与row.names=NULL参数的区别(直接看例子就能明白):eg:data_matrix = "KO1;KO2;KO3;WT1;WT2;WT3Gene1;1.3;1.2;1.4;3.1;3.2;3.3Gene2;1.1;1.9;1.6;2.3;2.2;2.1Gene3;16.8;17.0;18.0;33.0;原创 2022-03-15 16:55:49 · 304 阅读 · 0 评论 -
把一个文件两列合并为一列
比如:把一个文件第一列和第二列通过“:”合并为第一列,并打印出整行:awk '{$1=$1":"$2;print $0}' file > out file原创 2020-12-25 09:37:02 · 583 阅读 · 0 评论 -
annovar 注释非人类基因
来自一个生信小白探索了两天此软件的结果:1,首先第一步,我建议看教程还是做不到的话再看看annovar的官方网站!!!!非常重要,我按照网上教程做了一天,没太多用,但是我了解了大概过程,认识了几个命令,对后面理解也是挺有用的。2,需要下载物种的fasta文件,此步骤不需要在此下载,在ucsc ,ensemble网站都可以自行下载。3,开始使用annovar下载我们需要的基因注释文件:(我们总共需要三个文件就行,样本的fasta文件sample.fa, .txt后缀的注释文件,以及vcf文件。)①原创 2020-12-23 21:36:40 · 976 阅读 · 2 评论