sxj19930803的博客

原创 snpEff如何创建自己的数据库

snpEff是最常见的vcf格式注释工具，在使用过程中我们常常需要使用自己的数据库进行配置。一、snpEff提供的可供下载的数据库：      通过运行以下命令： java -jar snpEff.jar databases      得到可下载的数据库列表，若没有可用的，则需要自己进行编译。二、编译生成自己的数据库：（1）修改配置文件snpEff.config，