snpEff如何创建自己的数据库

snpEff是最常见的vcf格式注释工具，在使用过程中我们常常需要使用自己的数据库进行配置。

一、snpEff提供的可供下载的数据库：

      通过运行以下命令：

      java -jar snpEff.jar databases

      得到可下载的数据库列表，若没有可用的，则需要自己进行编译。

二、编译生成自己的数据库：

（1）修改配置文件snpEff.config，以Citrus物种的Clementina_182文件配置为例：

         gedit snpEff.config，加入以下两行：