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原创 用python编写统计fasta格式的序列的长度脚本

如果用perl来编写统计fasta序列的长度脚本,很简单的几行代码就可以搞定,但是想了想,觉得用python写更时候处理大的文件,尤其是想用python实现多线程处理。因此,就有了用python来编写最初版的统计fasta序列长度的脚本的想法。 运行方法:nohup python stat_length.py input.fasta > input.len &运行结果:>Aquca_0

2015-09-30 22:22:24 9318 1

原创 用python统计scaffold的N50等信息

最近用python编写了统计scaffoldN50和contigN50等信息的脚本。运行结果截图如下:源代码如下:#!/usr/bin/env python#func: cal N50,N60,N70,N80,N90,finalimport os,sysimport operatorimport datetimeimport refrom optpars

2015-09-30 22:12:43 6434

转载 【转】python经典面试题目

Python是如何进行内存管理的? http://developer.51cto.com/art/201007/213585.htm (没看懂) 什么是lambda函数?它有什么好处? http://www.kuqin.com/diveinto_python_document/apihelper_lambda.html 解释一下python的 and-or 语法 h

2015-09-11 23:31:58 619

空空如也

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