R：访问数据库管理系统

    R中有多种面向关系型数据库管理系统（DBMS）的接口，包括Microsoft SQL Server、Microsoft、Access、MySQL、Oracle、PostgreSQL、DB2、Sybase、Teradata以及SQLite。其中一些包通过原生的数据库驱动来提供访问功能，另一些则是通过ODBC或JDBC来实现访问的。使用R来访问存储在外部数据库中的数据是一种分析大数据集的有效手段，并且能够发挥SQL和R各自的优势。

 

►ODBC接口

    在R中通过RODBC包访问一个数据库也许是最流行的方式，这种方式允许R连接到任意一种拥有ODBC驱动的数据库，其实几乎就是市面上的所有数据库。第一步是针对你的系统和数据库类型安装和配置合适的ODBC驱动——它们并不是R的一部分。针对选择的数据库安装并配置好驱动后，安装RODBC包。

RODBC包中主要的函数及说明

函数	描述
odbcConnect( dsn, uid="", pwd="" )	建立一个到ODBC数据库的连接
sqlFetch( channel, sqltable )	读取ODBC数据库中的某个表到一个数据框中
sqlQuery( channel, query )	向ODBC数据库提交一个查询并返回结果
sqlSave( channel, mydf, tablename = sqtable, append=FALSE )	将数据框写入或更新(append=TRUE)到ODBC数据库的某个表中
sqlDrop( channel, sqtable )	删除ODBC数据库中的某个表
close( channel )	关闭连接

 

    RODBC包允许R和一个通过ODBC连接的SQL数据库之间进行双向通信。这就意味着你不仅可以读取数据库中的数据到R中，同时也可以使用R修改数据库中的内容。

    假设你想将某个数据库中的两个表（Crime和Punishment）分别导入为R中的两个名为crimedat和pundat的数据框，可以通过如下代码完成这个任务：

> library( RODBC )

> myconn <- odbcConnect( "mydsn", uid="Rob", pwd="aardvark" )

> crimedat <- sqlFetch( myconn, Crime )

> pundat <- sqlQuery( myconn, "select * from Punishment" )

> close( myconn )

    这里首先载入了RODBC包，并通过一个已注册的数据源名称（mydsn）和用户名（rob）以及密码（aardvark）打开了一个ODBC数据库连接。连接字符串被传递给sqlFetch，它将Crime表复制到R数据框crimedat中。然后我们对Punishment表执行了SQL语句select并将结果保存到数据框pundat中。最后，我们关闭了连接。

    函数sqlQuery()非常强大，因为其中可以插入任意的有效SQL语句。这种灵活性赋予了你选择指定变量、对数据取子集、创建新变量，以及重编码和重命名现有变量的能力。

 

►DBI相关包

    DBI包为访问数据库提供了一个通用且一致的客户端接口。构建于这个框架之上的RJDBC包提供了通过JDBC驱动访问数据库的方案。使用时请确保安装了针对你的系统和数据库的必要JDBC驱动。其他有用的、基于DBI的包有RMySQL、ROracle、RPostgreSQL和RSQLite。这些包都为对应的数据库提供了原生的数据库驱动，但可能不是在所有系统上都可用。详情请参阅CRAN（http://cran.r-project.org）上的相应文档。