caffe 数据库LMDB的读写

读写的图片都是灰度图，rgb图类似

一、读数据（图片的channel是2，其实是两张图片）：

Datum是caffe里定义的一种存数据的结构。所以使用它时必须在开头import caffe。

它的属性有：

channels：图片的通道。如彩色图用3，灰度图用1.但是也许你想把它定义中其他数字，让它每个通道都是一个单张的图，这个例子就是2，每个通道是一张灰度图。

height：图片（即data）的高

width：图片（即data）的宽

data：图片的数据（像素值）

label：图片的label。如caffe的mnist里label是0~9的数字。

import sys
sys.path.insert(0,"../../python")#为了import caffe
import numpy as np
import lmdb
import caffe
import argparse
from matplotlib import pyplot

if __name__ == '__main__':
    parse = argparse.ArgumentParser()
    parse.add_argument('--lmdbpath')
    args = parse.parse_args()
 
    env = lmdb.open(args.lmdbpath, readonly=True)
    with env.begin() as txn:
        cursor = txn.cursor()
        for key, value in cursor:
            #print(key,len(value))#value是string类型
            print 'key: ',key
               datum = caffe.proto.caffe_pb2.Datum()#datum类型
               datum.ParseFromString(value)#转成datum
               flat_x = np.fromstring(datum.data, dtype=np.uint8)#转成numpy类型
               x = flat_x.reshape(datum.channels, datum.height, datum.width)#reshape大小
               y = datum.label#图片的label
            fig = pyplot.figure()#把两张图片显示出来
            ax = fig.add_subplot(121)
            ax.imshow(x[0], cmap='gray')
            ax = fig.add_subplot(122)
            ax.imshow(x[1], cmap='gray')
            pyplot.show()

二、写LMDB数据库（例子中把两张图片作为一张图的两个channel）：

caffe，以及faster rcnn写lmdb时都习惯把图片的名字写到txt文件中，通过txt去加载图片。思路大概如此。

我这个例子txt存的是：图片1名字   图片2名字    label

例如mnist的例子可以是：图片名字   label（代表这张图是0~9的哪个数字）

import numpy as np
import lmdb
import Image as img
from skimage import io
import sys,os
sys.path.insert(0, '../../python')
import caffe
import argparse
import random

def load_txt(txt, shuffle):
    if txt == None:
        print "txtpath!!!"
        exit(0)
    if not os.path.exists(txt):
         print "the txt is't exists"
         exit(0)
    flag = 0
    file_content = []
    txt_file = open(txt, 'r')
    for line in open(txt, 'r'):
        line = txt_file.readline()
        list = line.split()
        file_content.append([list[0], list[1], list[2]])
        flag += 1 
    if not shuffle == None:<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">#为了打乱数据顺序</span>
        random.shuffle(file_content)
    return file_content

def add_argu(parse):
    parse.add_argument('--txt')
    parse.add_argument('--lmdb')
    parse.add_argument('--shuffle')#为了打乱数据顺序
    parse.add_argument('--picpath')
    return parse.parse_args() 

if __name__ == '__main__':
    parse = argparse.ArgumentParser()
    args = add_argu(parse)

    content = []  
    content = load_txt(args.txt, args.shuffle)#加载图片名字和label
    print 'total: ', len(content)
    env = lmdb.Environment(args.lmdb, map_size=int(1e12))
    
    with env.begin(write=True) as txn:
        # txn is a Transaction object
        for i in range(len(content)):
            datum = caffe.proto.caffe_pb2.Datum()
            pic_path1 = args.picpath + '/' +  content[i][0]
            pic_path2 = args.picpath + '/' + content[i][1]
            label = int(content[i][2])
            img_file1 = io.imread(pic_path1)
            img_file2 = io.imread(pic_path2)
            datum.channels = 2#channels
            datum.height = img_file1.shape[0]#height
            datum.width = img_file1.shape[1]#width
            data = np.zeros((2,  img_file1.shape[0],  img_file2.shape[1]), dtype=np.uint8)#初始化data
            data[0] = img_file1
            data[1] = img_file2
            datum.data = data.tostring() #data
            datum.label = int(label)#label
            str_id = "%08d" %(i) + "_" + content[i][0] #'{:08}'.format(i)   #顺序+图片名字作为key
            
            # The encode is only essential in Python 3
            txn.put(str_id.encode('ascii'), datum.SerializeToString())
            

注意：数据库的读是按照key的排序读的，key的顺序并不是按照写的顺序，是字典序。所以写数据库时key必须重新写，如果把图片名字作为key读数据库出来的图片就是按照图片的字典序（不是写的顺序）。str_id是key