基于Python/MNE处理fnirs数据

功能性近红外光谱技术在脑科学领域被广泛应用，市面上也已经有了许多基于MATLAB的优秀工具包及相关教程，如：homer、nirs_spm等。而本次教程将基于Python的MNE库对fNIRS数据进行处理。

本次教程基于：https://mne.tools/stable/auto_tutorials/preprocessing/70_fnirs_processing.html

教程所用代码、数据可通过链接下载，也可在茗创科技公众号后台回复关键词：MNE-FNIRS获取本次教程所用的工具、代码、数据。

课前准备

Anaconda下载安装（windows，64位系统）

主链接：https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.11-Windows-x86_64.exe

备用链接（该链接下载限速1000kb/s，仅在主链接无法访问时使用）：

http://1.14.108.54:8888/#s/7t2FaqPA

请按照默认选项安装，需要注意：

一定要勾选以下选项：

（如果忘记勾选，卸载软件后重新安装即可）

安装完毕后在开始菜单（左下角的windows图表

）找到

和

，两个都可以顺利打开证明安装成功。

打开Spyder

代码讲解实操

对于有Python基础的同学此步并不复杂，但此次课程面向零基础小白，将会逐步运行代码及讲解代码含义。

（1）载入软件库及fnirs数据

运行此次脚本前应加载好所需模块。

import numpy as np

如运行以上语句，左下角提示无某模块时（类似下图），

则通过anaconda powershell prompt载入相应模块。

可通过conda或pip或wheel语句载入模块。

成功后再运行代码无报错提示。

如果你先前未下载示例数据，可通过代码下载，运行代码：

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