看病不求医，基于HAI在JupyterLab中用U-Net实现病灶识别

从医生到AI

在肿瘤医院的阅片室里，王医生正聚精会神地盯着CT影像。她需要从数百张断层扫描图中，手工勾画出患者肺部的肿瘤区域。这项工作不仅耗时费力，更要求医生保持高度专注——一个细微的漏判就可能影响治疗方案的选择。这样的场景每天都在全球各大医院上演，直到AI技术的出现带来转机。

医学图像分割技术通过深度学习算法，可以自动识别影像中的特定解剖结构或病变区域。其中，U-Net模型因其在生物医学图像分割中的卓越表现，已成为该领域的标准工具。让我们通过一个完整的案例，了解如何在JupyterLab环境中构建并应用这个"AI医生助手"。

环境配置与数据准备

2.1 环境配置

在JupyterLab中新建Python笔记本，执行以下命令安装依赖库：

!pip install tensorflow keras numpy matplotlib opencv-python scikit-image

2.2 数据获取与预处理

我们使用公开的ISIC皮肤病变数据集进行演示。这个数据集包含皮肤镜图像及对应的病灶标注图：

下载地址如下：（PS: 真实数据服务器跑不动，所以用的模拟数据，有能力的同学可以测试下真实数据哦。）

https://isic-challenge-data.s3.amazonaws.com/2016/ISBI2016_ISIC_Part2B_Training_Data.zip

https://challenge.isic-archive.com/data/

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from skimage import io, transform
from sklearn.model_selection import train_test_split
import zipfile

# 下载示例数据集（实际使用时替换为真实数据）
!wget https://isic-challenge-data.s3.amazonaws.com/2016/ISBI2016_ISIC_Part2B_Training_Data.zip  

# 解压数据集
with zipfile.ZipFile('ISBI2016_ISIC_Part2B_Training_Data.zip', 'r') as zip_ref:
    zip_ref.extractall('dataset')

# def download_and_extract_dataset():
    # 下载数据集
    # dataset_url = "https://isic-challenge-data.s3.amazonaws.com/2016/ISBI2016_ISIC_Part2B_Training_Data.zip  "
    # os.system(f"wget {dataset_url}")
    
    # 解压数据集
    # with zipfile.ZipFile('ISBI2016_ISIC_Part2B_Training_Data.zip', 'r') as zip_ref:
    #     zip_ref.extractall('dataset')

# 下载并解压数据集
# download_and_extract_dataset()

# 加载数据
def load_dataset():
    images = []
    masks = []
    
    # 生成模拟数据（实际应加载真实数据）
    for i in range(200):
        img = np.random.rand(256, 256)  # 模拟灰度图像
        mask = np.zeros((256, 256))
        mask[50:150, 50:150] = 1  # 模拟方形病灶
        images.append(img)
        masks.append(mask)
    
    return np.array(images), np.array(masks)

X, y = load_dataset()

# 数据可视化示例
plt.figure(figsize=(10,4))
plt.subplot(1,2,1)
plt.imshow(X[0], cmap='gray')
plt.title('原始图像')
plt.subplot(1,2,2)
plt.imshow(y[0], cmap='gray')
plt.title('标注图像')
plt.show()

构建U-Net

3.1 模型架构解析