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原创 【生物信息学】使用genome 作为ref时,由bam格式 or pileup格式 计算 depth 的 cpp程序
主要是首次测试 map引用指针,构建多重map。main.cpp#include #include #include #include #include #include #include #include #include #include #include #include "depth.h"using namespace std;void usage()
2014-01-22 02:42:34 1729
原创 HMM model 例子 Biased coins
输入$ head toss1.txtHTHTTHTHTTH for 正面, T for 反面。可能是正常的 coin,可能是biased coin(HT 的概率非0.5 0.5),二者按照一定几率转换,几率不知道。输出TIME TOSS P(FAIR) P(BIAS) MLSTATE1 H
2014-01-22 02:21:11 1277
转载 C++map容器里的所有内容以二进制方式保存与读取到文件
原地址 http://www.chinadmd.com/file/w6wscter3u6osooaapvco63u_2.html读写二进制文件。 Class 用法.将map存进二进制文件,高速读写。#include #include #include #include using namespace std;class STUDENT{ publi
2014-01-14 14:22:58 4447 1
原创 【生物信息学】使用mRNA作为ref时,由bam格式计算rpkm 的 cpp程序
main.cpp#include #include #include #include #include #include #include #include #include #include #include #include "rpkm.h"using namespace std;void usage(){ cout " << endl;
2014-01-08 02:21:12 2343
原创 一个c++的动态规划算法
main.cpp实现动态规划,最短路径。main.cpp#include #include #include #include #include #include #include #include #include #include #include #include "Matrix615.h"using namespace std;void usage
2014-01-07 02:40:16 687
空空如也
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