基因数据压缩算法(ACTG) C++

        基因数据压缩算法是一个初级的数据压缩算法,基因数据如下所示"ATAGATGCAT",如果使用标准的ASCII编码(每个字符1个字节),这个基因字符串的流长度是10*8=80位。

        这些字符是由4种不同的字符组成,所有我们可以使用双位编码压缩,比如 A:00, C:01, T:10, G11,压缩之后我们就可以在一个字节存放4个基因字符了,当数据比较大时,压缩效率为25%。


完整代码

#include <iostream>
#include <string>
using namespace std;

void PrintBits(const char *pstr, int width = 1);

// ACTG A:00, C:01, T:10, G11
class Dna
{
public:
	Dna() : sizes(0) {}
	Dna(const char *str);

	void AddCompress(const char c) { Compress(c); }
	void AddCompress(const char *pstr);
	string Expand();

	int Size() const { return sizes; }
	string Data() const { return data; }
	string Compress() const { return compressData; }
	void PrintCompressData() { PrintBits(compressData.c_str()); }
	void PrintCompressData(int 
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