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perl
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lmenjoy
生物信息菜鸟一枚
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Perl中"—>"箭头的意义及用法
看师兄的程序,里面用了很多箭头->。很长时间没有使用perl编程了,很多基本概念忘记了。在网上搜了很久,终于找到比较靠谱的答案。cited from http://write.blog.csdn.net/postedit flw的回答。有部分增改。-> 有两种用法,都和解引用有关。 第一种用法,就是解引用。 根据 -> 后面跟的符号的不同,解不同类型的引用,转载 2016-04-05 21:57:03 · 11290 阅读 · 1 评论 -
perl中split分割字符串用法坑人的一些细节!!
好多天没有在这里记录啦。今天发现一个佷值得跟大家分享的小经验!如题!1、注意split,若以字符串最前面的一个字符作为分隔符的话,分割得到的数组的第一个是空白!!!!而不是后面的东西!这个坑了我好久好久!eg:>TRINITY_DN36413_c0_g1_i1_2,我要去掉“>”,试过用$_=~s/^>(TRINITY_DN\d+_c\d+g_\d+_i\d+)/$1/,但是匹配总是出问题原创 2016-04-14 21:07:09 · 6030 阅读 · 0 评论 -
annovar对人类基因组和非人类基因组variants注释流程
部分翻译:Hui Y, Kai W. Genomic variant annotation and prioritization with ANNOVAR and wANNOVAR[J]. Nature Protocols, 2015, 10(10).此文只是用于作者和所有初接触annovar软件者分享交流。更深入学习请仔细阅读全文。转载请注明。ANNOVAR是一个perl编写的命令行工具翻译 2016-04-27 16:38:17 · 14386 阅读 · 0 评论