nii与nii.gz格式的关系

最新推荐文章于 2024-02-27 15:10:36 发布

落难Coder

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分类专栏：图像配准文章标签： python 图像配准

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区别

标准NIfTI图像的扩展名是.nii，包含了头文件及图像资料。由于NIfTI格式和Analyze格式的关系，因此NIfTI格式也可使用独立的图像文件[.img]和头文件[.hdr]。单独的.nii格式文件的优势就是可以用标准的压缩软件[如gzip]，而且一些分析软件包[比如FSL]可以直接读取和写入压缩的.nii文件[扩展名为.nii.gz]。

读取

import matplotlib
from matplotlib import pylab as plt
import nibabel as nib
from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D
 
file = ''    #你的nii或者nii.gz文件路径
img = nib.load(file)    
 
print(img)
print(img.header['db_name'])    #输出nii的头文件
 
width, height, queue = img.dataobj.shape
 
OrthoSlicer3D(img.dataobj).show()
 
num = 1
for i in range(0, queue, 10):
    img_arr = img.dataobj[:,:,i]
    plt.subplot(5,4,num)
    plt.imshow(img_arr, cmap='gray')
    num += 1
 
plt.show()