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原创 python自然语言处理:有效信息的提取

最近跑了3D CNN,实现MRI的分割及分类。训练过程中将准确率等自动保存成一个txt文件,该文件有64M多,想要从中提取有用信息比如Mean accuracy、sensitivity、specificity和mean dsc等,人工筛选太繁琐,所以想到用python编程来实现。去请教了一位研究自然语言处理的计算机系的师兄,实现代码如下: # -*- coding: utf-8 -*- # @Ti...

2018-04-24 09:22:06 4518 1

原创 Boxplot(箱形图或盒图)的介绍和使用

一、介绍盒图是在1977年由美国的统计学家约翰·图基(John Tukey)发明的。它由五个数值点组成:最小值(min),下四分位数(Q1),中位数(median),上四分位数(Q3),最大值(max)。也可以往盒图里面加入平均值(mean)。如上图。下四分位数、中位数、上四分位数组成一个“带有隔间的盒子”。上四分位数到最大值之间建立一条延伸线,这个延伸线成为“胡须(whisker)”。由...

2018-04-11 16:35:36 97111 4

转载 Batch Normolization原理介绍

一、在深度学习中,由于问题的复杂性,我们往往会使用较深层数的网络进行训练,在这个过程中,我们需要去尝试不同的学习率、初始化参数方法(例如Xavier初始化)等方式来帮助我们的模型加速收敛。深度神经网络之所以如此难训练,其中一个重要原因就是网络中层与层之间存在高度的关联性与耦合性。我们规定左侧为神经网络的底层,右侧为神经网络的上层。那么网络中层与层之间的关联性会导致如下的状况:随着训练的进行,网络中...

2018-03-27 11:17:21 2209

原创 医学图像处理:Ubuntu16.04安装freesurfer教程

freesurfer是一个处理大脑3D数据影像的软件,用起来非常方便。安装教程如下:我的ubuntu系统是16.04,其他版本亦可作为参考。1.下载所需软件包在官网上下载安装包,链接:点击打开链接。下载需要12个小时左右。获取licence,在官网点击打开链接上注册一下,填写自己的邮箱,提交之后会收到一个邮件。打开附件,复制附件信息,新建一个licence.txt,将内容粘贴到该txt文件中。收到...

2018-03-13 17:04:26 20470 21

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