医学图像处理：Ubuntu16.04安装freesurfer教程

最新推荐文章于 2025-03-13 13:23:51 发布
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分类专栏： 软件安装 文章标签： 医学图像
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本文提供了一步一步在Ubuntu16.04上安装医学图像处理工具Freesurfer的详细教程。从下载安装包、获取许可证、解压安装到环境配置，以及解决可能出现的问题，最后给出了软件的使用示例。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

freesurfer是一个处理大脑3D数据影像的软件，用起来非常方便。安装教程如下：

我的ubuntu系统是16.04，其他版本亦可作为参考。

1.下载所需软件包

在官网上下载安装包，链接：点击打开链接。下载需要12个小时左右。

获取licence，在官网点击打开链接上注册一下，填写自己的邮箱，提交之后会收到一个邮件。打开附件，复制附件信息，新建一个licence.txt,将内容粘贴到该txt文件中。


收到的邮件如下



2.安装包复制与解压

将下载的软件包复制到/usr/local下，要保证有足够大的空间。在ubuntu系统下打开命令窗口，输入

sudo cp 安装包名字 /usr/local

这里安装包名字不仅要是全称，还要将位置信息打上去（如果你进的是该安装包目录下就不用了）。

解压

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2. vim ~/.bashrc最后添加以下命令。解压安装完后进行以下操作。3. source一下。
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ubuntu12.04下安装freesurfer必备来两个安装文件 ##**这里必须要说明一点，linux下的权限控制是非常严格的，基本上你放进usr/local 里的软件你没有权利在里边进行任何写的操作，所以建议把usr/local下边的freesurfer文件夹拷贝到home目录下面，这个目录下可以各种操作，其实freesurfer官方是建议安装到usr/local下的，但是我吃亏了。。。所以建议非linux大神，还是省事一些，放在home下边，跟desktop并列的目录下。然后你需要将 /etc/profile 中最后添加的那一行位置信息做相应的更改。log out**
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本指南适用于大部分Ubuntu版本，并提供了适配多个版本的方法，方便以后扩展。
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找到适合自己系统的版本，我下载的是tar.gz文件，其他的文件应该只是压缩方式不同。====================注册=======================================配置======================================下载===================（.bashrc文件是隐藏文件，可以在图形界面中显示隐藏文件，双击进入修改；找到主目录下的.bashrc文件，打开它，把下面的代码添加到文件末尾。有其他报错的话，应该都是这样处理。
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1.下载freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tar.gz 2.sudo mv freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tar.gz /usr/local 3. cd /usr/local sudo tar xzvf freesurfer-Linux-centos6_x86_64-stable-pub-v6.0.0.tar.gz 4.提前下载好license（官方申请：ht..
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请注意，本教程仅涵盖了freesurfer的安装过程，并未涉及其具体用法。您可以参考freesurfer官方文档和教程来了解更多关于如何使用freesurfer进行医学图像处理的信息。本文将详细介绍在Ubuntu操作系统上安装freesurfer的步骤和相应的源代码。在安装freesurfer之前，我们需要从官方网站下载最新版本的软件包。安装完成后，我们需要配置一些环境变量，以便系统能够正确识别和访问freesurfer。如果输出显示了freesurfer的帮助信息，则说明安装成功。
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