本文介绍了R语言中的sva包在处理测序数据批次效应方面的应用。内容包括sva包的安装、虚拟变量的概念及其在回归分析中的作用，以及sva函数的详细使用，如num. sv、sva、f.pvalue和ComBat等。通过这些函数，可以评估和消除批次间的环境或生物学差异，实现多批次数据的合并。
在很多实验的时候都会遇到不同批次的数据整合的情况，那么今天就给大家介绍一个测序数据的批次数据分析的R包sva。首先我们看下包的安装，以及内置数据的安装：
BiocManager::install('bladderbatch')
BiocManager::install('sva')
接下来我们看个体外概念虚拟变量，是人为设定的用于将分类变量引入回归模型中的方法，也就是说分类变量的类型数量就是虚拟变量的变量数。通常情况下，回归分析，逐步回归，分层回归，Logistic回归，PLS回归等这类影响关系研究的方法时，才可能涉及到虚拟变量设置。其它分析方法并不会涉及。公式如下：
最低0.47元/天 解锁文章
6961
被折叠的 条评论
为什么被折叠?
到【灌水乐园】发言
