ROC曲线是临床中常用的统计分析之一,R中可以绘制ROC曲线的包也有很多,
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pROC
包就是其中的佼佼者。 pROC包可以计算AUC和95%置信区间,可以可视化、平滑和比较ROC曲线。 今天来学习下怎么使用
pROC
包来
绘制平滑ROC曲线。
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1. 安装和加载R包
2. 读取内置数据集
3. 拟合平滑ROC对象
4. 平滑ROC曲线的方法
5. 先绘制1条平滑曲线
6. 再添加1条ROC曲线
7. 添加图例
1. 安装和加载R包
install.packages("pROC") # 安装pROC包library(pROC) # 加载pROC包
2. 读取内置数据集
使用pROC包自带的aSAH
数据集来演示。该数据集包括了113例动脉瘤蛛网膜下腔出血患者的临床和实验室资料。
data(aSAH) # 加载内置数据集
View(aSAH) # 查看数据集