绘制平滑曲线_手把手教你绘制平滑ROC曲线

ROC曲线是临床中常用的统计分析之一,R中可以绘制ROC曲线的包也有很多, pROC 包就是其中的佼佼者。 pROC包可以计算AUC和95%置信区间,可以可视化、平滑和比较ROC曲线。 今天来学习下怎么使用 pROC 包来 绘制平滑ROC曲线
目  录
  • 1. 安装和加载R包

  • 2. 读取内置数据集

  • 3. 拟合平滑ROC对象

  • 4. 平滑ROC曲线的方法

  • 5. 先绘制1条平滑曲线

  • 6. 再添加1条ROC曲线

  • 7. 添加图例


1. 安装和加载R包

install.packages("pROC") # 安装pROC包library(pROC) # 加载pROC包

2. 读取内置数据集

使用pROC包自带的 aSAH数据集来演示。该数据集包括了113例动脉瘤蛛网膜下腔出血患者的临床和实验室资料。
data(aSAH)   # 加载内置数据集
View(aSAH)   # 查看数据集
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好的,我可以回答您的问题。您可以按照以下步骤在sklearn中绘制ROC曲线: 1. 准备数据:首先,您需要准备测试数据集和训练数据集。您还需要使用训练数据集来训练逻辑回归模型。 2. 训练模型:使用训练数据集训练逻辑回归模型。您可以使用以下代码: ``` from sklearn.linear_model import LogisticRegression # 创建逻辑回归对象 lr = LogisticRegression() # 使用训练数据集来训练模型 lr.fit(X_train, y_train) ``` 3. 预测概率:使用测试数据集来预测类别概率。您可以使用以下代码: ``` # 预测测试数据集的类别概率 y_pred_proba = lr.predict_proba(X_test)[:,1] ``` 4. 计算ROC曲线数据:计算真阳性率(TPR)和假阳性率(FPR)。您可以使用以下代码: ``` from sklearn.metrics import roc_curve, auc # 计算ROC曲线数据 fpr,tpr,thresholds = roc_curve(y_test, y_pred_proba) roc_auc = auc(fpr,tpr) ``` 5. 绘制ROC曲线:使用Matplotlib库绘制ROC曲线。您可以使用以下代码: ``` import matplotlib.pyplot as plt # 绘制ROC曲线 plt.title('Receiver Operating Characteristic') plt.plot(fpr, tpr, 'b', label = 'AUC = %0.2f' % roc_auc) plt.legend(loc = 'lower right') plt.plot([0, 1], [0, 1],'r--') plt.xlim([0, 1]) plt.ylim([0, 1]) plt.ylabel('True Positive Rate') plt.xlabel('False Positive Rate') plt.show() ``` 这是在sklearn中绘制ROC曲线的简单步骤。同时,您还可以使用KS曲线来评估模型性能。
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