kdbp是什么文件_DNAbp(kp)与蛋白质D(KD)间的转换关系

本文介绍了DNA大小用bp或kp表示,蛋白质大小用D或KD表示,并提供了DNA、蛋白质的大小估算方法,以及两者之间的转换关系。例如,14.4kD蛋白质含有131个氨基酸,对应396bp的DNA序列。同时,文章还给出了核酸和蛋白质浓度、质量、摩尔数的换算公式。
摘要由CSDN通过智能技术生成

DNA的大小以bp或kp来反映核苷酸的个数多少,蛋白质的大小以D或KD来反映其分子量的高低

氨基酸平均分子质量为120,也就是120D

(DNA序列长度/3)*120可以估算蛋白的大小,一般几十KD的蛋白都为小分子

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(基础:20种氨基酸的平均分子量为138.,小分子氨基酸出现的频率较大因此加权平均分子量为128,在此基础上减去一分子被脱去的水分子量,即128-18=110。所以“氨基酸残基”的平均分子量通常按110计算。)

根据上述 14.4kD蛋白质的氨基酸数目为

(14400/110=)131 个 因此其基因长度为(131X3 +3=)396 bp (所加的那个3 是指终止密码 别忘了哦)

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核酸、蛋白质的各种换算

分光光度值与核酸浓度的换算

1 A260 unit dsDNA=50 μg/ml

1 A260 unit ssDNA=33 μg/ml

1 A260 unit ssRNA=40 μg/ml

蛋白质质量与摩尔数的转换

100 pmol的100 kDa蛋白分子=10 μg

100 pmol的50 kDa蛋白分子=5 μg

100 pmol的10 kDa蛋白分子=1 μg

100 pmol的1 kDa蛋白分子=100 ng

DNA分子质量与摩尔数

1 μg of 1000 bp DNA = 1.52 pmol(3.03 pmol of ends)

1 μg of pBR322 DNA = 0.36 pmol DNA

1 pmol of 1000 bp DNA = 0.66 μg

1 pmol of pBR322 DNA = 2.8 μg

蛋白质/DNA之间的转换

1 kb的DNA可编码333个氨基酸=37 kDa的蛋白分子

270 bp的DNA= 10 kDa的蛋白分子

810 bp的DNA= 30 kDa的蛋白分子

2.7 kb的DNA= 100 kDa的蛋白分子

DNA分子质量与摩尔数的换算公式

对于dsDNA 分子

将pmol转换为μg

pmol×N×(660 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg

将μg转换为pmol

μg×(106pg/1 μg)× (pmol/660 pg)×(1/N) = pmol

其中 N 是核酸碱基对数,660 pg/pmol 是每对碱基的平均分子量(MW)。

一个氨基酸的平均分子量=100 Daltons(道尔顿)

Daltons(Da) kilo是原子质量单位的另一名称,千道尔顿

Dalton (kD)即为1000 道尔顿 。因此,质量为46 kD的蛋白质是每摩尔分子46000克的分子。

对于ssDNA 分子

将pmol转换为μg

pmol×N×(330 pg/pmol×(1 μg/106pg) = μg

将μg 转换为pmol

μg×(106pg/1 μg)×(pmol/330 pg)×(1/N) = pmol

其中 N 是核酸碱基数,330 pg/pmol

是每个碱基的平均分子量(MW)。

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