python入门有多简单_Python入门到底有多简单(一):数据读写与输出

651c1a216a176f2698c5369122874c7f.png很多人觉得数据分析入门很难,但随着B站和公众号上的学习资源越来越多,学习数据分析已经变得非常简单。以下面为例,从一张规则的表格中,根据门水平名称,生成对物种门水平的表格文件。

导入pandas包

In [1]:import pandas as pd

读取数据读取文本文件pd.read_table,读取excel文件,可以用df = pd.read_excel("*.xlsx",sheet_name="*")。In [2]:df = pd.read_table("subsample_otu.tax.0.03.xls")如下图所示,门水平有12个门的数据。

查看待拆分的门

In [3]:df["phylum"].unique()

Out[3]:array(["Acidobacteria", "Actinobacteria", "Armatimonadetes","Bacteroidetes", "Chloroflexi", "Firmicutes", "Fusobacteria","Gemmatimonadetes", "Planctomycetes", "Proteobacteria","Spirochaetes", "Synergistetes"], dtype=object)

生成Excel文件

根据门水平名称,提取对应门水平的信息,并生成以门水平名称命名的Excel文件。

In [4]:for i in df["phylum"].unique():df[df["phylum"]==i].to_excel(i+".xls",index=False)

Out[4]:

e802143553884e1213334ade6da655d7.png

往期相关链接:

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2、R进阶

【绘图进阶】之带连线的箱体图绘制(8);

【绘图进阶】之配对箱体图绘制(七);

【绘图进阶】之通路与菌的相关性分析热图(六);

【绘图进阶】之lefse定制化绘图(五);

【绘图进阶】之六种带中心点的PCA 图和三维PCA图绘制(四);

【绘图进阶】之交互式可删减分组和显示样品名的PCA 图(三);

【绘图进阶】之绘制PCA biplot图(二);

【进阶篇绘图】之带P值的箱体图、小提琴图绘制(一);

3、数据提交

3分钟学会微生物多样性云平台数据分析;

3分钟学会CHIP-seq类实验测序数据可视化 —IGV的使用手册;

10分钟搞定多样性数据提交,最快半天内获取登录号,史上最全的多样性原始数据提交教程;

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4、表达谱分析表达谱分析(二)通路富集分析和基因互作网络图绘制;如何对GEO数据进行差异分析;miRNA靶基因预测软件__miRWalk 3.0;

5、医学数据分析KING: 样本亲缘关系鉴定工具;【WGS服务升级】人工智能软件SpliceAI助力解读罕见和未确诊疾病中的非编码突变;隐性疾病trio家系别忽视单亲二倍体现象——天昊数据分析助力临床疾病诊断新添UPD(单亲二倍体)可视化分析工具;【昊工具】Oh My God! 太好用了吧!疾病或表型的关键基因查询数据库,我不允许你不知道Phenolyzer;天昊客户服务中心手机/微信号:18964693703

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QQ号:1040471849

作者:大熊

审核:有才

来源:天昊生信团

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