大脑构造图与功能解析_ 5万多个脑核磁共振图像!人类大脑皮层大脑遗传结构全解析...

撰文 | 十一月

责编 | 兮

大脑皮层是我们复杂认知能力的基础。人类大脑皮层总表面积(Surface area)和厚度(Thickness)的遗传多样性与神经学、心理学以及行为学上的多种表型息息相关,而以上两种数据可以通过核磁共振成像技术进行人体体内的测量(图1)。多脑回动物大脑皮层折叠的显著特点是可以分为脑回和脑沟区域。放射单元假说(Radial unit hypothesis)提出皮层表面积的扩增受到神经祖细胞增殖的驱动,而大脑皮层的厚度则由神经细胞的分裂数目所决定【1】。通过双胞胎和家庭谱系脑部成像研究,说明大脑皮层的总表面积和厚度是高度可遗传的,而且会受到多种遗传因子的影响【2-4】。但是,关于常见的遗传变异是如何影响人类皮质表面积和厚度等数据的了解还并不清楚。

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图1 大脑皮层的两种功能数据表征:总表面积与厚度

2020年3月20日,澳大利亚昆士兰医学研究院Sarah E. Medland研究组、美国北卡罗莱纳大学教堂山分校Jason L. Stein研究组、南加州大学Paul M. Thompson研究组以及增强神经影像遗传学荟萃分析联盟 (ENIGMA) -遗传学工作组等多个研究组、多位科学家跨领域强强合作在Science上发表文章The genetic architecture of

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实现对 MR-brain.bmp 图像进行梯度运算并分割出皮层的步骤如下: 1. 首先读取 MR-brain.bmp 图像并将其转换为灰度图像。 2. 构造合适的结构元素,可以选择不同大小和形状的结构元素进行尝试,以得到最佳效果。 3. 对灰度图像进行膨胀和腐蚀操作,得到梯度幅值图像。 4. 对梯度幅值图像进行二值化处理,得到二值图像。 5. 对二值图像进行形态学开运算,去除小的噪点。 6. 对处理后的二值图像进行连通区域分析,得到皮层区域。 7. 将皮层区域用不同颜色标记或分割出来。 以下是 C++ 代码实现: ```cpp #include <iostream> #include <opencv2/opencv.hpp> using namespace std; using namespace cv; int main() { Mat img = imread("MR-brain.bmp", IMREAD_GRAYSCALE); if (img.empty()) { cout << "Failed to open image." << endl; return -1; } Mat element = getStructuringElement(MORPH_RECT, Size(3, 3)); Mat dilate_img, erode_img, gradient_img, bin_img, opening_img, label_img; dilate(img, dilate_img, element); erode(img, erode_img, element); subtract(dilate_img, erode_img, gradient_img); threshold(gradient_img, bin_img, 0, 255, THRESH_BINARY | THRESH_OTSU); morphologyEx(bin_img, opening_img, MORPH_OPEN, element); int n_labels = connectedComponents(opening_img, label_img); for (int i = 1; i < n_labels; i++) { Mat temp_img = Mat::zeros(img.size(), CV_8UC1); for (int x = 0; x < img.rows; x++) { for (int y = 0; y < img.cols; y++) { if (label_img.at<int>(x, y) == i) { temp_img.at<uchar>(x, y) = 255; } } } imshow("Brain Cortex", temp_img); waitKey(0); } return 0; } ``` 这段代码首先读取 MR-brain.bmp 图像并转换为灰度图像,然后构造了一个 3x3 的矩形结构元素。接着对灰度图像进行了膨胀和腐蚀操作,得到梯度幅值图像。然后对梯度幅值图像进行二值化处理,并进行形态学开运算,去除小的噪点。最后对处理后的二值图像进行连通区域分析,得到皮层区域,并将其用不同颜色标记或分割出来。

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