静息态功能磁共振处理——工具篇

最新推荐文章于 2024-07-24 22:30:40 发布
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版权

1　　matlab官网

2　　spm12

(填写完该链接内容后即可获取下载链接        http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/download/)

(更多扩展包，如AAL,Anatomy,BrainNetViewer,DPABI等       http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/ext/)

3　　DPABI/DPARSF/DPARSFA　　可用于数据预处理，ALFF，ReHo计算等

（http://rfmri.org/dpabi）（http://rfmri.org/DPARSF）

4　　REST　　用于静息态下功能连接的计算

（http://restfmri.net/forum/index.php?q=rest）

5　　BrainNetViewer　　用于大脑图像的绘制（2D，多视角）

（https://www.nitrc.org/projects/bnv/）

6　　MRIcro/MRIcron/xjview　　用于查看图像

（http://www.cabi.gatech.edu/mricro/mricro/）（https://www.nitrc.org/projects/mricron）（http://www.alivelearn.net/xjview/）

 

（备注：提升网址　　http://www.doc88.com/p-2961093693156.html）

 

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脑科学磁共振成像（MRI)初学者必看——功能脑网络、小世界网络、FDR校正、脑电信号频率变换、模板、假设检验、广义线性模型、独立成分分析、影像组学、任务态和静息态方法汇总
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图论分析中从fMRI中提取复杂网络的主要步骤。步骤一： 对采集的功能磁共振成像数据进行许多预处理步骤，包括切片之间的时间校正、重新对准、图像配准、基于分割的归一化和空间平滑。需要注意的是预处理步骤的选择和顺序可能会影响最终图指标测量的范围。预处理步骤可以参考：DPABI详细使用教材——数据准备、预处理流程、数据分析流程步骤二： 为了探索大规模的大脑网络，应用了适当的分割方案，例如解剖学自动标记图谱，将整个大脑划分为几个皮质和皮质下的解剖单元。......
ADNI静息态功能核磁共振成像数据预处理总流程
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茗创：功能磁共振数据处理业务
u011661076的博客
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文章来源于微信公众号（茗创科技），欢迎有兴趣的朋友搜索关注。 01 数据质量检查 好的数据是一切的开始。数据质量检查内容包括：扫描参数的检查，其中有重复时间TR、回波时间TE、扫描视野、空间分辨率、采集时间等；检查图像是否存在伪迹如鬼影、图像变形等；还有诸如检查前n个时间点的的数据质量等。我们会细致地检查您的数据为后续的工作打下基础。 图1.典型伪迹 02 数据预处理 时间层校正（Slice Time Correction），通过插值（Interpolation）等方法来获得多..
DPABI使用教程
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静息态DMN网络相关，基于matlab编写，需要对数据mask改成3d格式
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利用matlab的SPM12功能核磁共振成像数据处理_Auditory fMRI data（三）
qq_27273607的博客
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深度学习在静息态功能磁共振成像中的应用
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对从人脑功能磁共振成像(fMRI)数据中获得的丰富的动态的时空变化特性进行建模是一项具有挑战性的任务。对大脑区域和连接水平进行分析为fMRI数据提供了更直接的生物学解释，并且到目前为止一直有助于描述大脑中的特征。在本文中作者假设，与之前研究广泛使用的预先进行的fMRI时变信息转换以及脑区之间的功能连接特征相比，直接在四维(4D)fMRI体素级别空间中进行时空特征的学习可以增强大脑表征的鉴别性。基于这个目的，作者对最近提出的结构MRI(sMRI)深度学习(DL)方法进行扩展，以额外获得时变信息和在预处理好的f
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个体对疼痛的感知差异在基础和临床研究中引起了关注，因为改变的疼痛敏感性既是许多疼痛病症的特征，也是其风险因素。然而，个体对疼痛的敏感性如何反映在无痛静息状态的大脑活动和功能连接性中，尚不清楚。在这里，我们确定并验证了无痛静息状态的功能性大脑连接组中一个网络模式，该模式可以预测个体间的疼痛敏感性差异。我们的预测性网络签名允许在不应用任何疼痛刺激的情况下评估个体对疼痛的敏感性，这在无法获得可靠行为疼痛报告的患者中可能具有价值。此外，作为超脊髓神经对疼痛敏感性贡献的直接、无创性读出，它可能对转化研究以及镇痛治疗策
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静息状态功能磁共振成像（rs-fMR imaging）显示了在没有明确任务情况下的一系列不同的大脑区域，这些区域表现出低频的、时间上相关的血氧信号的波动，称为静息态网络。通过rs-fMRI，对大脑功能的解剖学理解已经从局部化的角度发展到基于网络的结构。这些网络往往涉及共同激活的区域，并在受试者和扫描周期之间保持一致，这表明了大脑功能组织的一般原则。目前，静息态网络的分析通常使用假定时间平稳性（temporal stationarity）的技术，并计算在整个扫描过程中线性依赖性的度量，以描述跨区域间连接的强度
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