ADNI静息态功能核磁共振成像数据预处理总流程

ADNI静息态功能核磁共振成像数据预处理总流程共如下八步

目录

1. 下载DICOM格式数据

2. DICOM -> NIFTI格式 输出s开头文件

3.  时间层校正Slice Timing 输出as开头文件

4. 头动校正Realignment 输出ras开头文件

5. 归一化Normalize 输出w开头文件

6. 平滑Smooth 输出sw开头文件

7. 配准Co-register reslice

8. 提取ROI

---

word资源：https://download.csdn.net/download/m0_37852937/19053920

1. 下载DICOM格式数据

登陆地址：http://adni.loni.usc.edu/data-samples/access-data/

输入登录账号及密码->ADNI GO->DOWNLOAD IMAGE Collections->Advanced Search(beta)->确定Research Group: EMCI LCMI AD CN Image Description:Resting State fMRI-> Display in result->csv doenload （注：网页加载很慢）

建议单个下，如果all同时下，会出现断网，网中断，下载失败或文件不全。且不好统计哪些是下载过的。

已知下载好的文件格式解压如下（注：文件必须是6720个dicom，如果少了，说明网络中断导致文件没下载全，需要重新下载。）：

事先在每个subject里存好每个步骤对应路径（可以用程序在每个人对应路径下创建以下文件夹）: