最近刚提交博士论文的来答一发。
博士生在读博士的过程中，博士论文的题目大概是经历一到两年的上课和探索在第二/三年确定的，其中要经过一个类似考试的东西，国内似乎叫开题报告？国外叫Qualify Exam。不同学校要求不尽相同，我的学校是在QE上向三位老师展示你在前一年半到两年探索期的初步成果，并探讨未来两三年的研究计划。
之后就在你的博士论文题目下开展研究，由于做博士论文一般耗时都在三年以上，而研究的结果又需要及时的发表公布让同行看到（免得被同行抢发），所以一旦有了足够的阶段性成果，就会写成期刊论文投递给合适的杂志社发表。
当阶段性成果足够多，可以支撑起博士论文的题目的时候，就可以把前面发表过的阶段性成果整理到一起写成毕业论文，答辩毕业啦！
所以说，博士毕业论文是你在读博士的几年间围绕你的博士论文题目开展的研究的集合，章节与章节之间是有逻辑联系的，讲究全面性和连续性；而期刊论文则是一些阶段性成果，讲究时效性。
============割一下=============
拿我自己的论文做个例子，我传到onedrive和ResearchGate上自己开源了（学校开源竟然要掏90刀 = =）（26M，没wifi的就别点了）
OneDrive: Chuyang Cheng_PhD Thesis_Merged_Final Version
ResearchGate: Design and Construction of Artificial Molecular Pumps (PDF Download Available)
我的博士毕业论文题目是”设计和构造人工分子泵“，一共分为六个章节，分别对应六篇期刊论文。
第一章是一篇综述，对应的期刊论文是ChemPhyChem的一篇MiniReview（ Wholly Synthetic Molecular Machines），介绍了分子机器这个研究领域的历史发展，一些基本知识，面临的问题，近期的研究动向和热点，以及未来的挑战等等。
第二章到第五章都是原创的研究结果。
第二章对应JACS的一篇Article（ Relative Unidirectional Translation in an Artificial Molecular Assembly Fueled by Light），这篇文章我是第二作者，第一作者是我师兄，当时师兄毕业了，我接手过来，在做的过程中获得了灵感设计了后续的工作。这个章节中描述的研究结果是我第一次尝试设计和构建人工分子泵，相当于原型机，姑且叫Mark 0吧。从结果中我发现了一些问题在当前的体系（给受体donor-acceptor系统）下难以解决，于是决定换一个新的体系（自由基radical体系）设计Mark I。
第三章对应JACS的一篇Article（ Influence of Constitution and Charge on Radical Pairing Interactions in Trisradical Tricationic Complexes）。这一章里我系统的研究了新的体系，设计了多达18个不同的分子来观察结构对他们物理化学性质的影响，这一章的结果对后面分子泵的设计提供了不少有用信息。
第四章对应JACS的一篇Communication（ Energetically Demanding Transport in a Supramolecular Assembly），这个章节里我把第三章里研究的新体系引入了分子泵Mark I的设计，证明了用新体系可以实现主动运输（active transport）。
第五章对应Nature Nanotechnology的一篇Article（ nature.com 的页面），是整篇博士论文的核心。这个章节里我把前面第二到四章的结果和经验总结起来，经过多次尝试，设计出了一个能连续运转两个循环将溶液中的环番分子主动运输到高能位置的人工分子泵Mark II，呼应了博士论文题目”设计和构造人工分子泵“。
第六章是个总结，对应ACS Nano的一篇Review（ http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acsnano.5b03809），总结前面的工作，提出新的挑战。
各个章节之间有逻辑关系并都为论文题目服务。相关度不大的期刊论文就没有收录进去。
PS. 我当年QE给评审老师开了三个脑洞，我的整篇毕业论文只把第一个脑洞做了一半，深深感到自己给自己挖了个巨大的坑。。。
============再割一下=============
由于六个章节分别对应六篇期刊文章，所以我的博士论文写作其实并没有额外花太多时间。只需要把写好的期刊论文拿来改变一些语句（比如期刊中的”我们怎么怎么样“都要改成”我怎样怎样“），调整部分内容的顺序（SI的一些内容挪到正文里），按毕业论文格式排版（这个花的时间最多 = =）。要是国内博士的话就得重写成中文了，估计要花不少时间呢。
好久都没在知乎上码这么多字了。。。
博士生在读博士的过程中，博士论文的题目大概是经历一到两年的上课和探索在第二/三年确定的，其中要经过一个类似考试的东西，国内似乎叫开题报告？国外叫Qualify Exam。不同学校要求不尽相同，我的学校是在QE上向三位老师展示你在前一年半到两年探索期的初步成果，并探讨未来两三年的研究计划。
之后就在你的博士论文题目下开展研究，由于做博士论文一般耗时都在三年以上，而研究的结果又需要及时的发表公布让同行看到（免得被同行抢发），所以一旦有了足够的阶段性成果，就会写成期刊论文投递给合适的杂志社发表。
当阶段性成果足够多，可以支撑起博士论文的题目的时候，就可以把前面发表过的阶段性成果整理到一起写成毕业论文，答辩毕业啦！
所以说，博士毕业论文是你在读博士的几年间围绕你的博士论文题目开展的研究的集合，章节与章节之间是有逻辑联系的，讲究全面性和连续性；而期刊论文则是一些阶段性成果，讲究时效性。
============割一下=============
拿我自己的论文做个例子，我传到onedrive和ResearchGate上自己开源了（学校开源竟然要掏90刀 = =）（26M，没wifi的就别点了）
OneDrive: Chuyang Cheng_PhD Thesis_Merged_Final Version
ResearchGate: Design and Construction of Artificial Molecular Pumps (PDF Download Available)
我的博士毕业论文题目是”设计和构造人工分子泵“，一共分为六个章节，分别对应六篇期刊论文。
第一章是一篇综述，对应的期刊论文是ChemPhyChem的一篇MiniReview（ Wholly Synthetic Molecular Machines），介绍了分子机器这个研究领域的历史发展，一些基本知识，面临的问题，近期的研究动向和热点，以及未来的挑战等等。
第二章到第五章都是原创的研究结果。
第二章对应JACS的一篇Article（ Relative Unidirectional Translation in an Artificial Molecular Assembly Fueled by Light），这篇文章我是第二作者，第一作者是我师兄，当时师兄毕业了，我接手过来，在做的过程中获得了灵感设计了后续的工作。这个章节中描述的研究结果是我第一次尝试设计和构建人工分子泵，相当于原型机，姑且叫Mark 0吧。从结果中我发现了一些问题在当前的体系（给受体donor-acceptor系统）下难以解决，于是决定换一个新的体系（自由基radical体系）设计Mark I。
第三章对应JACS的一篇Article（ Influence of Constitution and Charge on Radical Pairing Interactions in Trisradical Tricationic Complexes）。这一章里我系统的研究了新的体系，设计了多达18个不同的分子来观察结构对他们物理化学性质的影响，这一章的结果对后面分子泵的设计提供了不少有用信息。
第四章对应JACS的一篇Communication（ Energetically Demanding Transport in a Supramolecular Assembly），这个章节里我把第三章里研究的新体系引入了分子泵Mark I的设计，证明了用新体系可以实现主动运输（active transport）。
第五章对应Nature Nanotechnology的一篇Article（ nature.com 的页面），是整篇博士论文的核心。这个章节里我把前面第二到四章的结果和经验总结起来，经过多次尝试，设计出了一个能连续运转两个循环将溶液中的环番分子主动运输到高能位置的人工分子泵Mark II，呼应了博士论文题目”设计和构造人工分子泵“。
第六章是个总结，对应ACS Nano的一篇Review（ http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acsnano.5b03809），总结前面的工作，提出新的挑战。
各个章节之间有逻辑关系并都为论文题目服务。相关度不大的期刊论文就没有收录进去。
PS. 我当年QE给评审老师开了三个脑洞，我的整篇毕业论文只把第一个脑洞做了一半，深深感到自己给自己挖了个巨大的坑。。。
============再割一下=============
由于六个章节分别对应六篇期刊文章，所以我的博士论文写作其实并没有额外花太多时间。只需要把写好的期刊论文拿来改变一些语句（比如期刊中的”我们怎么怎么样“都要改成”我怎样怎样“），调整部分内容的顺序（SI的一些内容挪到正文里），按毕业论文格式排版（这个花的时间最多 = =）。要是国内博士的话就得重写成中文了，估计要花不少时间呢。
好久都没在知乎上码这么多字了。。。
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反对，不会显示你的姓名
毕业论文是攻读博士学位期间你对所在领域作出贡献的总结，也是你有资格获得博士学位的证明，内容上更系统、全面和完整。感觉很像一本书，起因经过结果什么的你得把故事讲明白。
对于毕业论文、答辩的要求各国各校各专业采取的系统不同。@徐腾飞 老师所说的几篇期刊论文装订在一起的情况，在澳洲这边叫做 thesis by publication：在这种情况下对 published 或者 accepted 的本人为第一作者的 期刊文章数量有较高的要求，我所在的理论生物领域通常是4篇，而实验类的会到6篇左右。这在发表一篇期刊文章前后轻易能耗上一年，而学位总时长尽量不超过四年的体系限制下，是挺不容易做到的。
这边学生通常采取的做法是期刊文章能发多少发多少（当然有时效的考量），但不强求by publication的形式（毕竟按时毕业比较重要）。毕业论文以章节为单位：已发表的自然底气足一点，审的人也不会浪费太多时间在这些章节上；而未发表过的章节可以在交了毕业论文之后慢慢投，我知道的很多人是在之后做博士后期间才腾出精力在期刊上发表之前的成果。
至于完整的毕业论文，大概是印好供一份在学校图书馆，供一份在家里吧......关于发表毕业论文的程序就不大了解了，期待有人解惑。
对于毕业论文、答辩的要求各国各校各专业采取的系统不同。@徐腾飞 老师所说的几篇期刊论文装订在一起的情况，在澳洲这边叫做 thesis by publication：在这种情况下对 published 或者 accepted 的本人为第一作者的 期刊文章数量有较高的要求，我所在的理论生物领域通常是4篇，而实验类的会到6篇左右。这在发表一篇期刊文章前后轻易能耗上一年，而学位总时长尽量不超过四年的体系限制下，是挺不容易做到的。
这边学生通常采取的做法是期刊文章能发多少发多少（当然有时效的考量），但不强求by publication的形式（毕竟按时毕业比较重要）。毕业论文以章节为单位：已发表的自然底气足一点，审的人也不会浪费太多时间在这些章节上；而未发表过的章节可以在交了毕业论文之后慢慢投，我知道的很多人是在之后做博士后期间才腾出精力在期刊上发表之前的成果。
至于完整的毕业论文，大概是印好供一份在学校图书馆，供一份在家里吧......关于发表毕业论文的程序就不大了解了，期待有人解惑。
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反对，不会显示你的姓名
这里不谈抠字眼的概念，只是我的理解。
博士论文也是要发表的，只不过不是在期刊上而已。期刊上发表的文章必然不够全面，这种文章的目的主要还是介绍你的重要实验结果，辅助性的结果陷于篇幅要放在补充材料中或者直接舍弃。除此之外，介绍实验结果的论述结构可能也与实际的探究思路不符，甚至前后颠倒。
毕业论文重在全面详细的介绍你的试验工作，要涵盖你几年的工作，实验思路，实验步骤，实验材料都要求非常详细，一般实验室在实验技术上的传承会依赖于这些博士论文。
除此之外，一篇毕业论文的内容可以包含多篇期刊杂志的实验工作。这可能是最明显的区别。
博士论文也是要发表的，只不过不是在期刊上而已。期刊上发表的文章必然不够全面，这种文章的目的主要还是介绍你的重要实验结果，辅助性的结果陷于篇幅要放在补充材料中或者直接舍弃。除此之外，介绍实验结果的论述结构可能也与实际的探究思路不符，甚至前后颠倒。
毕业论文重在全面详细的介绍你的试验工作，要涵盖你几年的工作，实验思路，实验步骤，实验材料都要求非常详细，一般实验室在实验技术上的传承会依赖于这些博士论文。
除此之外，一篇毕业论文的内容可以包含多篇期刊杂志的实验工作。这可能是最明显的区别。
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1、工作量不一样
我看了不少美国的博士论文，里面就是几篇期刊论文装订在一起就搞定了。（这里说装订夸张了点)
博士论文是要解决谋个一问题
而期刊问题是在解决这个问题中的一些进展。例如围绕这个问题，有很多小问题，每个小问题都可以写一个期刊论文。例如围绕这个问题，发明了什么工具，或者研究了某种新方法。这些都是。
2、时效性
期刊论文发表有时效性的，publish or perish是个永恒的问题。而博士论文3-5年才能整出来，过程的成果必须及时发表，不然别人发表了，你就麻烦了。
3、完整性
这条恐怕更针对国内，国内对期刊论文的页数是有限制的，一篇不超过4-6页，这样在期刊论文里面就有很多东西说不清楚。（我比较反感这点）
在博士论文里面，就可以写得很详细，把来龙去脉说得清楚一些。
4、目的不一样
期刊论文更重要的是发表结果。
而博士论文的最主要目的是申请博士学位。证明自己有独立从事科学研究的能力。
我看了不少美国的博士论文，里面就是几篇期刊论文装订在一起就搞定了。（这里说装订夸张了点)
博士论文是要解决谋个一问题
而期刊问题是在解决这个问题中的一些进展。例如围绕这个问题，有很多小问题，每个小问题都可以写一个期刊论文。例如围绕这个问题，发明了什么工具，或者研究了某种新方法。这些都是。
2、时效性
期刊论文发表有时效性的，publish or perish是个永恒的问题。而博士论文3-5年才能整出来，过程的成果必须及时发表，不然别人发表了，你就麻烦了。
3、完整性
这条恐怕更针对国内，国内对期刊论文的页数是有限制的，一篇不超过4-6页，这样在期刊论文里面就有很多东西说不清楚。（我比较反感这点）
在博士论文里面，就可以写得很详细，把来龙去脉说得清楚一些。
4、目的不一样
期刊论文更重要的是发表结果。
而博士论文的最主要目的是申请博士学位。证明自己有独立从事科学研究的能力。
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--------------------为什么要按各种规范写学位论文---------------------
其实这些 都不必需，
博士论文的唯一要求是： 通过双盲评审。
而格式和写法并不是其中必需的东西，
如果你论文足够牛掰，
随便怎么写也可以三A。
---------------------------为什么（国内）博士论文有各种规范-----------------
------因为 学位论文是要负责扫盲的，
即写给对细分方向并不太了解的人看的。
中文博士论文通常的写法：
1、绪论（讲选题和学科大类的相互关系）
2、国内外研究进展（文献综述，写给师弟师妹们看的，科研入门利器）
3、小论文1、
4、小论文2、
5、小论文3、
6、结语（研究心得、下一步研究计划）
7、引用文献
8、致谢
除了Three essays on XXX (引自 Sean Liu的回答) 的内容，大论文增加了绪论、文献综述、结语等内容。而这些内容都是方便其他人跟进研究用的。
任何一个本科生、硕士生、博士一年级生，选科研方向的时候，最好的方法是去找一个综述。
这个时候找一个相关方向的学位论文看看，是最快最好的方法。
【 相信题主当初也一定看过别人写的中文博士论文，并因此省下的大量时间】
中国总体上是科技落后的国家，按照规范些博士论文，方便后人跟进研究，提高研究效率。
是提升国家研究水平的有效途径。
----------------------最后回答题主第一个问题----------------------
Q：是要留一份母语写的详尽版给自己的学校和祖国么？
------ 是的，这是国内博士的一个天然的义务。
其实这些 都不必需，
博士论文的唯一要求是： 通过双盲评审。
而格式和写法并不是其中必需的东西，
如果你论文足够牛掰，
随便怎么写也可以三A。
---------------------------为什么（国内）博士论文有各种规范-----------------
------因为 学位论文是要负责扫盲的，
即写给对细分方向并不太了解的人看的。
中文博士论文通常的写法：
1、绪论（讲选题和学科大类的相互关系）
2、国内外研究进展（文献综述，写给师弟师妹们看的，科研入门利器）
3、小论文1、
4、小论文2、
5、小论文3、
6、结语（研究心得、下一步研究计划）
7、引用文献
8、致谢
除了Three essays on XXX (引自 Sean Liu的回答) 的内容，大论文增加了绪论、文献综述、结语等内容。而这些内容都是方便其他人跟进研究用的。
任何一个本科生、硕士生、博士一年级生，选科研方向的时候，最好的方法是去找一个综述。
这个时候找一个相关方向的学位论文看看，是最快最好的方法。
【 相信题主当初也一定看过别人写的中文博士论文，并因此省下的大量时间】
中国总体上是科技落后的国家，按照规范些博士论文，方便后人跟进研究，提高研究效率。
是提升国家研究水平的有效途径。
----------------------最后回答题主第一个问题----------------------
Q：是要留一份母语写的详尽版给自己的学校和祖国么？
------ 是的，这是国内博士的一个天然的义务。
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我们系就是三篇论文装订下，取名字叫Three essays on XXX 就行了…论文可以是已发表的，也可以是未发表的，但已发表的根据版权法要取得出版社的授权（发表时另有约定的除外）…隔壁经济系也是这样…
所以至少从鄙校的情况看，两者并没有区别。
至于有的答主说博士论文要更系统，恕不能苟同。如果“更系统”的部分是前人说过的，那么本来就不用再说一次；如果“更系统”的部分前人没说过，那么难道期刊论文就不应该包括？
所以至少从鄙校的情况看，两者并没有区别。
至于有的答主说博士论文要更系统，恕不能苟同。如果“更系统”的部分是前人说过的，那么本来就不用再说一次；如果“更系统”的部分前人没说过，那么难道期刊论文就不应该包括？
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完全是不同滴的东西好么？！
除了极个别专业或者学校允许将发表的论文合订于一本博士论文外，大多数博士论文需要提供一条清晰的逻辑线，而其目的就在于将自己的研究内容完整地，清晰地展示给读者。往往会扩充原有论文的很多知识，以及具体操作等不适合发表在期刊的内容。
于是期刊论文的重点在于，你的新发现，新认识。不求完整，但一定要有独特性和新颖性。而且，期刊论文的展示往往有严格地字数，思路，和格式的要求，于是就无法提供读者一个全面的认知了。
目前而言，国内太重视论文发表而轻视毕业论文有点本末倒置了。其实，怎样的学生才能授予博士学位是个值得大家思考的问题。是发表几遍IF的论文，还是为人类的智慧做出独特的贡献的人？
除了极个别专业或者学校允许将发表的论文合订于一本博士论文外，大多数博士论文需要提供一条清晰的逻辑线，而其目的就在于将自己的研究内容完整地，清晰地展示给读者。往往会扩充原有论文的很多知识，以及具体操作等不适合发表在期刊的内容。
于是期刊论文的重点在于，你的新发现，新认识。不求完整，但一定要有独特性和新颖性。而且，期刊论文的展示往往有严格地字数，思路，和格式的要求，于是就无法提供读者一个全面的认知了。
目前而言，国内太重视论文发表而轻视毕业论文有点本末倒置了。其实，怎样的学生才能授予博士学位是个值得大家思考的问题。是发表几遍IF的论文，还是为人类的智慧做出独特的贡献的人？
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毕业论文想看的是你为什么做了这些东西，他们和前人做过的东西有什么联系，自己相互之间又有什么联系，最后会导出什么结论和方向，在前后更加侧重big picture，同时会照顾一般读者的知识水平来写intro（有些国家的thesis要求是一般大众能读懂的）。中间章节上则会有更多杂志文章上没有的具体数据和细节。
杂志上的article和communication之类的更强调单个project故事讲圆了，背景和结论上更多是写给本方向背景的人看的，很多无关紧要的细节就可以忽略了，数据该概要也得概要因为有排版限制。比如我thesis里放了一个6页长的图，这在任何杂志里都是不可能的。
智障的窝写论文的时候因为做的两块东西差距太远，开了N多脑洞才把它们联系在一个背景下，最后标题巨长……临走老板问我你要不要打印一个烫金本带着，我说还是算了，内心吐槽这坨玩意20年后打开看一定有种谜之羞耻感，跟现在看小学日记一样……
杂志上的article和communication之类的更强调单个project故事讲圆了，背景和结论上更多是写给本方向背景的人看的，很多无关紧要的细节就可以忽略了，数据该概要也得概要因为有排版限制。比如我thesis里放了一个6页长的图，这在任何杂志里都是不可能的。
智障的窝写论文的时候因为做的两块东西差距太远，开了N多脑洞才把它们联系在一个背景下，最后标题巨长……临走老板问我你要不要打印一个烫金本带着，我说还是算了，内心吐槽这坨玩意20年后打开看一定有种谜之羞耻感，跟现在看小学日记一样……
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匿名用户
药物化学的背景，从个人体会来谈：
1.毕业论文和publication相似的是都包含综述、正文、结论、实验、supporting info以及致谢。毕业论文相对更丰富，如果对一个刚入门做这个领域的人，看毕业论文很容易；
2.很多人的毕业论文不止一篇发表的paper；
举个例子：有机化学的方法学。比如一个博士运气很好，花三个月时间就发表了一篇paper，同时达到了规定的毕业要求。但是如果你以为你可以拿这一篇文章去毕业，那就呐衣唔了。博士毕业不仅需要达到学校规定的要求，还要看博士期间的工作量，即使你工作量够了，大部分导师也不会让你提前毕业，因为不管是横向还是纵向，大部分导师都有很多项目可以让你做。
3.很多人发表的论文和毕业论文并不是很相关；
举个例子：比如你做的是药物化学中的一个me too药物，临床前数据特别好，准备发专利，除去你做实验的时间，专利拿去审核公开了，你已经到了毕业的时间了。就算给你时间去写论文，但是这个化合物活性太好，为了竞争需要保密，文章就不能写了。那怎么办呢，你就做了一个相关性不高的东西发表了文章。这个时候，你的论文就十分重要了（当然这种论文一般是申请保密的）
4.很多人的毕业论文是一篇paper的一部分；
举个例子：工作量特别大，可能需要七八年才能完成的一篇大paper，你做了一部分已经很精彩并且可以毕业了，剩下的就交给别人去做了。
1.毕业论文和publication相似的是都包含综述、正文、结论、实验、supporting info以及致谢。毕业论文相对更丰富，如果对一个刚入门做这个领域的人，看毕业论文很容易；
2.很多人的毕业论文不止一篇发表的paper；
举个例子：有机化学的方法学。比如一个博士运气很好，花三个月时间就发表了一篇paper，同时达到了规定的毕业要求。但是如果你以为你可以拿这一篇文章去毕业，那就呐衣唔了。博士毕业不仅需要达到学校规定的要求，还要看博士期间的工作量，即使你工作量够了，大部分导师也不会让你提前毕业，因为不管是横向还是纵向，大部分导师都有很多项目可以让你做。
3.很多人发表的论文和毕业论文并不是很相关；
举个例子：比如你做的是药物化学中的一个me too药物，临床前数据特别好，准备发专利，除去你做实验的时间，专利拿去审核公开了，你已经到了毕业的时间了。就算给你时间去写论文，但是这个化合物活性太好，为了竞争需要保密，文章就不能写了。那怎么办呢，你就做了一个相关性不高的东西发表了文章。这个时候，你的论文就十分重要了（当然这种论文一般是申请保密的）
4.很多人的毕业论文是一篇paper的一部分；
举个例子：工作量特别大，可能需要七八年才能完成的一篇大paper，你做了一部分已经很精彩并且可以毕业了，剩下的就交给别人去做了。
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前面高票答案写的很详细啦，我想在这里写一下我看到的东西。
今年实验室里有一位师兄在6月份博士毕业答辩。作为师弟，在大师兄写博士论文的时候也给他帮了一点忙，之前也接的他的方向，对他之前发表的文章以及做的项目有了一个大致的了解。我感觉，（在我这个微波与天线方向）博士毕业论文可以说是对之前读博期间所做创新工作的总结。
（大师兄的）博士毕业论文大致分成这几部分：前言与文献综述，他的第一个项目（发在了EL上面），第二个项目（发到了MTT上面），第三个项目（PRL在投）以及第四个项目（MTT在投），最后是参考文祥等东西。
他在那些期刊上发表的文章，我也阅读过，期刊上发表的文章，限于篇幅，不可能讲的很详细，只是大致介绍一下所作方向的进展，然后是重点讲自己的进展，即便是自己的贡献，也只是力图用最少的文字，最简洁的公式描述最多的成果。因此， 期刊更偏向于发表 新的成果，讲求实效性，而 并不偏向十分具体地描述成果。
而他写的博士论文，是描述他在这5年以来的成果，是用这篇文章来申请博士学位的。为了能向答辩委员会证明自己有资格获得这个学位，他需要详细描述自己的成果，详细介绍自己的贡献。在博士毕业论文里面同样会包含之前他在期刊上发表的成果，至少是与博士毕业论文主题相关的成果，但在描述上与期刊有着不小的差异。 博士论文倾向详细描述成果，详细到对文献综述的要求要高于期刊上发表的paper，详细到要具体推导成果的关键公式，详细到要具体描述实验流程以及实验成果的分析。大师兄在期刊上最多10页的成果，放在博士论文里面就会扩展到20页，力图尽可能清晰地向答辩委员会说明自己的成果。
而前面高票答案上所提到的 连续性，在大师兄的文章里面，我感觉 有所弱化，这个可能与导师强调的方面有所关系。我们的老板强调工程性，课题组擅长在完成项目中发掘问题，并予以解决，因此做的成果通常会围绕一个大方向，但会分散在不同的小方向上。因而从这个角度出发，连续性就会变得较弱， 这类文章更像是成果集中汇报展示。或许这类文章应该并不少见，我在阅读天线方向的毕业论文的时候，就会时不时发现这类文章：博士期间做了三四个有创新性的天线，而基本原理并不一致。
而对字数上的要求，我们老板其实要求并不高，他强调创新性。他的要求体现在，只要是自己的成果，哪怕硕士毕业论文只有四十页，但这四十页完全都是自己的成果，这也是一篇优秀的硕士论文；博士毕业论文自己的工作如果只写了六十页，但只要这六十页的工作含金量足够高，这也是一篇优秀的博士毕业论文在，比那些堆砌字数的博士毕业论文要强不少。
今年实验室里有一位师兄在6月份博士毕业答辩。作为师弟，在大师兄写博士论文的时候也给他帮了一点忙，之前也接的他的方向，对他之前发表的文章以及做的项目有了一个大致的了解。我感觉，（在我这个微波与天线方向）博士毕业论文可以说是对之前读博期间所做创新工作的总结。
（大师兄的）博士毕业论文大致分成这几部分：前言与文献综述，他的第一个项目（发在了EL上面），第二个项目（发到了MTT上面），第三个项目（PRL在投）以及第四个项目（MTT在投），最后是参考文祥等东西。
他在那些期刊上发表的文章，我也阅读过，期刊上发表的文章，限于篇幅，不可能讲的很详细，只是大致介绍一下所作方向的进展，然后是重点讲自己的进展，即便是自己的贡献，也只是力图用最少的文字，最简洁的公式描述最多的成果。因此， 期刊更偏向于发表 新的成果，讲求实效性，而 并不偏向十分具体地描述成果。
而他写的博士论文，是描述他在这5年以来的成果，是用这篇文章来申请博士学位的。为了能向答辩委员会证明自己有资格获得这个学位，他需要详细描述自己的成果，详细介绍自己的贡献。在博士毕业论文里面同样会包含之前他在期刊上发表的成果，至少是与博士毕业论文主题相关的成果，但在描述上与期刊有着不小的差异。 博士论文倾向详细描述成果，详细到对文献综述的要求要高于期刊上发表的paper，详细到要具体推导成果的关键公式，详细到要具体描述实验流程以及实验成果的分析。大师兄在期刊上最多10页的成果，放在博士论文里面就会扩展到20页，力图尽可能清晰地向答辩委员会说明自己的成果。
而前面高票答案上所提到的 连续性，在大师兄的文章里面，我感觉 有所弱化，这个可能与导师强调的方面有所关系。我们的老板强调工程性，课题组擅长在完成项目中发掘问题，并予以解决，因此做的成果通常会围绕一个大方向，但会分散在不同的小方向上。因而从这个角度出发，连续性就会变得较弱， 这类文章更像是成果集中汇报展示。或许这类文章应该并不少见，我在阅读天线方向的毕业论文的时候，就会时不时发现这类文章：博士期间做了三四个有创新性的天线，而基本原理并不一致。
而对字数上的要求，我们老板其实要求并不高，他强调创新性。他的要求体现在，只要是自己的成果，哪怕硕士毕业论文只有四十页，但这四十页完全都是自己的成果，这也是一篇优秀的硕士论文；博士毕业论文自己的工作如果只写了六十页，但只要这六十页的工作含金量足够高，这也是一篇优秀的博士毕业论文在，比那些堆砌字数的博士毕业论文要强不少。
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首先，我们学校是容许写英文的，不然纯粹把自己的文章翻译成中文，没有啥意思。。。所以，lz最后一点不适用。。。
其次，引言很重要，是要求综述整个领域的发展和进展。我想所有评审的人都会通过这个内容，来进一步了解知道作者的水平了。事实上，有些人可能论文发表得很好，但往往是因为导师的非常厉害下，所以综述是一个PhD最直接的反应。我也帮人审过博士论文，也是主要看综述写得如何，写的全面且透彻的，一般水平不会低。
再者，我们基本都是在已经发表的论文基础上，扩充一些内容。比如正式发表论文，不可能写得非常详细，各种复杂的计算过程，以及繁琐的推倒，都会省去，而这些很重要的内容都可以放到毕业论文里。我们圈里的“潜规则”就是，博士论文要详细的写清楚计算过程（我们是理论物理，对其它方面不敢说），然后，未来有人对你的工作感兴趣时，可以通过阅读你的博士论文，一步步学到你的技术和思想。我想，这才是对整个圈子的贡献。欧洲很多地方，也是如此。
最后，对个人而言，博士论文是一种仪式性的总结，看看这5年到底干了啥，展望一下未来之类的。
其次，引言很重要，是要求综述整个领域的发展和进展。我想所有评审的人都会通过这个内容，来进一步了解知道作者的水平了。事实上，有些人可能论文发表得很好，但往往是因为导师的非常厉害下，所以综述是一个PhD最直接的反应。我也帮人审过博士论文，也是主要看综述写得如何，写的全面且透彻的，一般水平不会低。
再者，我们基本都是在已经发表的论文基础上，扩充一些内容。比如正式发表论文，不可能写得非常详细，各种复杂的计算过程，以及繁琐的推倒，都会省去，而这些很重要的内容都可以放到毕业论文里。我们圈里的“潜规则”就是，博士论文要详细的写清楚计算过程（我们是理论物理，对其它方面不敢说），然后，未来有人对你的工作感兴趣时，可以通过阅读你的博士论文，一步步学到你的技术和思想。我想，这才是对整个圈子的贡献。欧洲很多地方，也是如此。
最后，对个人而言，博士论文是一种仪式性的总结，看看这5年到底干了啥，展望一下未来之类的。
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发表论文只是阶段性的总结，而毕业论文是博士生涯的总结。通过撰写毕业论文，你会对所研究的领域有更加系统的理解，把点连成线，线再形成面，最后自己要成为这一个小小领域里面最熟悉的人。
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