pandas mysql 合并_pandas数据规整:聚合、合并和重塑

在许多应用中,数据可能分散在许多文件或数据库中,存储的形式也不利于分析。本章关注可以聚合、合并、重塑数据的方法。

首先,我会介绍pandas的层次化索引,它广泛用于以上操作。然后,我深入介绍了一些特殊的数据操作。在第14章,你可以看到这些工具的多种应用。

层次化索引

层次化索引(hierarchical indexing)是pandas的一项重要功能,它使你能在一个轴上拥有多个(两个以上)索引级别。抽象点说,它使你能以低维度形式处理高维度数据。我们先来看一个简单的例子:创建一个Series,并用一个由列表或数组组成的列表作为索引:

import pandas as pd

data = pd.Series(np.random.randn(9),

index=[['a', 'a', 'a', 'b', 'b', 'c', 'c', 'd', 'd'],

[1, 2, 3, 1, 3, 1, 2, 2, 3]])

data

a 1 -1.631597

2 0.565528

3 1.349319

b 1 -0.364927

3 -0.069814

c 1 0.866054

2 -0.007507

d 2 -1.166422

3 -1.620899

dtype: float64

看到的结果是经过美化的带有MultiIndex索引的Series的格式。索引之间的“间隔”表示“直接使用上面的标签”:

data.index

MultiIndex(levels=[['a', 'b', 'c', 'd'], [1, 2, 3]],

labels=[[0, 0, 0, 1, 1, 2, 2, 3, 3], [0, 1, 2, 0, 2, 0, 1, 1, 2]])

对于一个层次化索引的对象,可以使用所谓的部分索引,使用它选取数据子集的操作更简单:

data['b']

1 -0.364927

3 -0.069814

dtype: float64

data['b':'c']

b 1 -0.364927

3 -0.069814

c 1 0.866054

2 -0.007507

dtype: float64

data.loc[['b', 'd']]

b 1 -0.364927

3 -0.069814

d 2 -1.166422

3 -1.620899

dtype: float64

有时甚至还可以在“内层”中进行选取

data.loc["a",2]

0.5655279622354669

data.loc[:, 2]

a 0.565528

c -0.007507

d -1.166422

dtype: float64

层次化索引在数据重塑和基于分组的操作(如透视表生成)中扮演着重要的角色。例如,可以通过unstack方法将这段数据重新安排到一个DataFrame中:

data.unstack()

123

a

-1.631597

0.565528

1.349319

b

-0.364927

NaN

-0.069814

c

0.866054

-0.007507

NaN

d

NaN

-1.166422

-1.620899

unstack的逆运算是stack:

data.unstack().stack()

a 1 -1.631597

2 0.565528

3 1.349319

b 1 -0.364927

3 -0.069814

c 1 0.866054

2 -0.007507

d 2 -1.166422

3 -1.620899

dtype: float64

stack和unstack将在本章后面详细讲解。

对于一个DataFrame,每条轴都可以有分层索引

frame = pd.DataFrame(np.arange(12).reshape((4, 3)),

index=[['a', 'a', 'b', 'b'], [1, 2, 1, 2]],

columns=[['Ohio', 'Ohio', 'Colorado'],

['Green', 'Red', 'Green']])

frame

OhioColorado

GreenRedGreen

a1

0

1

2

2

3

4

5

b1

6

7

8

2

9

10

11

各层都可以有名字(可以是字符串,也可以是别的Python对象)。如果指定了名称,它们就会显示在控制台输出中:

frame.index.names = ['key1', 'key2']

frame.columns.names = ['state', 'color']

frame

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

key1key2

a1

0

1

2

2

3

4

5

b1

6

7

8

2

9

10

11

注意:小心区分索引名state、color与行标签。

有了部分列索引,因此可以轻松选取列分组

frame['Ohio']

colorGreenRed

key1key2

a1

0

1

2

3

4

b1

6

7

2

9

10

可以单独创建MultiIndex然后复用。上面那个DataFrame中的(带有分级名称)列可以这样创建:

m_index1 = pd.MultiIndex.from_arrays([['Ohio', 'Ohio', 'Colorado'], ['Green', 'Red', 'Green']],

names=['state', 'color'])

m_index1

MultiIndex(levels=[['Colorado', 'Ohio'], ['Green', 'Red']],

labels=[[1, 1, 0], [0, 1, 0]],

names=['state', 'color'])

df1=pd.DataFrame(np.arange(12).reshape(4,3),columns=m_index1)

df1

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

0

0

1

2

1

3

4

5

2

6

7

8

3

9

10

11

重排与分级排序

有时,你需要重新调整某条轴上各级别的顺序,或根据指定级别上的值对数据进行排序。swaplevel接受两个级别编号或名称,并返回一个互换了级别的新对象(但数据不会发生变化):

frame

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

key1key2

a1

0

1

2

2

3

4

5

b1

6

7

8

2

9

10

11

frame.swaplevel('key1', 'key2')

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

key2key1

1a

0

1

2

2a

3

4

5

1b

6

7

8

2b

9

10

11

而sort_index则根据单个级别中的值对数据进行排序。交换级别时,常常也会用到sort_index,这样最终结果就是按照指定顺序进行字母排序了:

frame.sort_index(level=1)

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

key1key2

a1

0

1

2

b1

6

7

8

a2

3

4

5

b2

9

10

11

frame.swaplevel(0, 1).sort_index(level=0)

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

key2key1

1a

0

1

2

b

6

7

8

2a

3

4

5

b

9

10

11

根据级别汇总统计

许多对DataFrame和Series的描述和汇总统计都有一个level选项,它用于指定在某条轴上求和的级别。再以上面那个DataFrame为例,我们可以根据行或列上的级别来进行求和:

frame.sum(level='key2')

stateOhioColorado

colorGreenRedGreen

key2

1

6

8

10

2

12

14

16

frame.sum(level='color', axis=1)

colorGreenRed

key1key2

a1

2

1

2

8

4

b1

14

7

2

20

10

这其实是利用了pandas的groupby功能,本书稍后将对其进行详细讲解。

使用DataFrame的列进行索引

人们经常想要将DataFrame的一个或多个列当做行索引来用,或者可能希望将行索引变成DataFrame的列。以下面这个DataFrame为例:

frame = pd.DataFrame({'a': range(7), 'b': range(7, 0, -1),

'c': ['one', 'one', 'one', 'two', 'two',

'two', 'two'],

'd': [0, 1, 2, 0, 1, 2, 3]})

frame

abcd

0

0

7

one

0

1

1

6

one

1

2

2

5

one

2

3

3

4

two

0

4

4

3

two

1

5

5

2

two

2

6

6

1

two

3

DataFrame的set_index函数会将其一个或多个列转换为行索引,并创建一个新的DataFrame:

frame2 = frame.set_index(['c', 'd'])

frame2

ab

cd

one0

0

7

1

1

6

2

2

5

two0

3

4

1

4

3

2

5

2

3

6

1

默认情况下,那些列会从DataFrame中移除,但也可以将其保留下来:

frame.set_index(['c', 'd'], drop=False)

abcd

cd

one0

0

7

one

0

1

1

6

one

1

2

2

5

one

2

two0

3

4

two

0

1

4

3

two

1

2

5

2

two

2

3

6

1

two

3

reset_index的功能跟set_index刚好相反,层次化索引的级别会被转移到列里面:

frame2.reset_index()

cdab

0

one

0

0

7

1

one

1

1

6

2

one

2

2

5

3

two

0

3

4

4

two

1

4

3

5

two

2

5

2

6

two

3

6

1

合并数据集

pandas对象中的数据可以通过一些方式进行合并:

pandas.merge可根据一个或多个键将不同DataFrame中的行连接起来。SQL或其他关系型数据库的用户对此应该会比较熟悉,因为它实现的就是数据库的join操作。

pandas.concat可以沿着一条轴将多个对象堆叠到一起。

实例方法combine_first可以将重复数据拼接在一起,用一个对象中的值填充另一个对象中的缺失值。

我将分别对它们进行讲解,并给出一些例子。本书剩余部分的示例中将经常用到它们。

数据库风格的DataFrame合并

数据集的合并(merge)或连接(join)运算是通过一个或多个键将行连接起来的。这些运算是关系型数据库(基于SQL)的核心。pandas的merge函数是对数据应用这些算法的主要切入点。

以一个简单的例子开始:

df1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'a', 'b'],

'data1': range(7)})

df2 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'd'],

'data2': range(3)})

df1

keydata1

0

b

0

1

b

1

2

a

2

3

c

3

4

a

4

5

a

5

6

b

6

df2

keydata2

0

a

0

1

b

1

2

d

2

这是一种多对一的合并。df1中的数据有多个被标记为a和b的行,而df2中key列的每个值则仅对应一行。对这些对象调用merge即可得到

pd.merge(df1, df2)

keydata1data2

0

b

0

1

1

b

1

1

2

b

6

1

3

a

2

0

4

a

4

0

5

a

5

0

注意,我并没有指明要用哪个列进行连接。如果没有指定,merge就会将重叠列的列名当做键。不过,最好明确指定一下:

pd.merge(df1, df2, on='key')

keydata1data2

0

b

0

1

1

b

1

1

2

b

6

1

3

a

2

0

4

a

4

0

5

a

5

0

如果两个对象的列名不同,也可以分别进行指定:

df3 = pd.DataFrame({'lkey': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'a', 'b'],

'data1': range(7)})

df4 = pd.DataFrame({'rkey': ['a', 'b', 'd'],

'data2': range(3)})

pd.merge(df3, df4, left_on='lkey', right_on='rkey')

lkeydata1rkeydata2

0

b

0

b

1

1

b

1

b

1

2

b

6

b

1

3

a

2

a

0

4

a

4

a

0

5

a

5

a

0

可能你已经注意到了,结果里面c和d以及与之相关的数据消失了。默认情况下,merge做的是“内连接”;结果中的键是交集。其他方式还有"left"、“right"以及"outer”。外连接求取的是键的并集,组合了左连接和右连接的效果:

pd.merge(df1, df2, how='outer')

keydata1data2

0

b

0.0

1.0

1

b

1.0

1.0

2

b

6.0

1.0

3

a

2.0

0.0

4

a

4.0

0.0

5

a

5.0

0.0

6

c

3.0

NaN

7

d

NaN

2.0

这些选项进行了总结。

选项说明

inner

使用两个表都有的键

left

使用左表中所有的键

right

使用右表中所有的键

outer

使用两个表中所有的键

多对多的合并有些不直观。看下面的例子:

df1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'b'],

'data1': range(6)})

df2 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'a', 'b', 'd'],

'data2': range(5)})

df1

keydata1

0

b

0

1

b

1

2

a

2

3

c

3

4

a

4

5

b

5

df2

keydata2

0

a

0

1

b

1

2

a

2

3

b

3

4

d

4

pd.merge(df1, df2, on='key', how='left')

keydata1data2

0

b

0

1.0

1

b

0

3.0

2

b

1

1.0

3

b

1

3.0

4

a

2

0.0

5

a

2

2.0

6

c

3

NaN

7

a

4

0.0

8

a

4

2.0

9

b

5

1.0

10

b

5

3.0

多对多连接产生的是行的笛卡尔积。由于左边的DataFrame有3个"b"行,右边的有2个,所以最终结果中就有6个"b"行。连接方式只影响出现在结果中的不同的键的值:

pd.merge(df1, df2, how='inner')

keydata1data2

0

b

0

1

1

b

0

3

2

b

1

1

3

b

1

3

4

b

5

1

5

b

5

3

6

a

2

0

7

a

2

2

8

a

4

0

9

a

4

2

要根据多个键进行合并,传入一个由列名组成的列表即可

left = pd.DataFrame({'key1': ['foo', 'foo', 'bar'],

'key2': ['one', 'two', 'one'],

'lval': [1, 2, 3]})

right = pd.DataFrame({'key1': ['foo', 'foo', 'bar', 'bar'],

'key2': ['one', 'one', 'one', 'two'],

'rval': [4, 5, 6, 7]})

left

key1key2lval

0

foo

one

1

1

foo

two

2

2

bar

one

3

right

key1key2rval

0

foo

one

4

1

foo

one

5

2

bar

one

6

3

bar

two

7

pd.merge(left, right, on=['key1', 'key2'], how='outer')

key1key2lvalrval

0

foo

one

1.0

4.0

1

foo

one

1.0

5.0

2

foo

two

2.0

NaN

3

bar

one

3.0

6.0

4

bar

two

NaN

7.0

结果中会出现哪些键组合取决于所选的合并方式,你可以这样来理解:多个键形成一系列元组,并将其当做单个连接键(当然,实际上并不是这么回事)。

注意:在进行列-列连接时,DataFrame对象中的索引会被丢弃。

对于合并运算需要考虑的最后一个问题是对重复列名的处理。虽然你可以手工处理列名重叠的问题(查看前面介绍的重命名轴标签),但merge有一个更实用的suffixes选项,用于指定附加到左右两个DataFrame对象的重叠列名上的字符串:

pd.merge(left, right, on='key1')

key1key2_xlvalkey2_yrval

0

foo

one

1

one

4

1

foo

one

1

one

5

2

foo

two

2

one

4

3

foo

two

2

one

5

4

bar

one

3

one

6

5

bar

one

3

two

7

pd.merge(left, right, on='key1', suffixes=('_left', '_right'))

key1key2_leftlvalkey2_rightrval

0

foo

one

1

one

4

1

foo

one

1

one

5

2

foo

two

2

one

4

3

foo

two

2

one

5

4

bar

one

3

one

6

5

bar

one

3

two

7

merge的参数请参见表。使用DataFrame的行索引合并是下一节的主题。

参数说明

left

参与合并的左侧DataFrame

right

参与合并的右侧DataFrame

how

“inner”,“outer”.“left”,“right"其中之一,默认"inner”

on

用于连接的列名。必须存在于左右两个DataFrame对象中。如果未指定,则以left和right列名的交集作为连接键

left_on

左侧DtatFrame中用作连接键的列

right_on

右侧DtatFrame中用作连接键的列

left_index

左侧的行索引用作其连接键

right_index

类似于left_index

sort

根据连接键对合并后的数据进行排序,默认True,有时在处理大数集时,禁用该选项可获得更好的性能

suffixes

字符串值元组,用于追加到重叠列名的末尾

copy

设置为False,可以在某些特殊情况下避免将数据复制到结果数组中。默认总是复制

indicator 添加特殊的列_merge,它可以指明每个行的来源,它的值有left_only、right_only或both,根据每行的合并数据的来源。

索引上的合并

有时候,DataFrame中的连接键位于其索引中。在这种情况下,你可以传入left_index=True或right_index=True(或两个都传)以说明索引应该被用作连接键:

left1 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'a', 'a', 'b', 'c'],

'value': range(6)})

right1 = pd.DataFrame({'group_val': [3.5, 7]}, index=['a', 'b'])

left1

keyvalue

0

a

0

1

b

1

2

a

2

3

a

3

4

b

4

5

c

5

right1

group_val

a

3.5

b

7.0

pd.merge(left1, right1, left_on='key', right_index=True)

keyvaluegroup_val

0

a

0

3.5

2

a

2

3.5

3

a

3

3.5

1

b

1

7.0

4

b

4

7.0

由于默认的merge方法是求取连接键的交集,因此你可以通过外连接的方式得到它们的并集:

pd.merge(left1, right1, left_on='key', right_index=True, how='outer')

keyvaluegroup_val

0

a

0

3.5

2

a

2

3.5

3

a

3

3.5

1

b

1

7.0

4

b

4

7.0

5

c

5

NaN

对于层次化索引的数据,事情就有点复杂了,因为索引的合并默认是多键合并:

lefth = pd.DataFrame({'key1': ['Ohio', 'Ohio', 'Ohio',

'Nevada', 'Nevada'],

'key2': [2000, 2001, 2002, 2001, 2002],

'data': np.arange(5.)})

righth = pd.DataFrame(np.arange(12).reshape((6, 2)),

index=[['Nevada', 'Nevada', 'Ohio', 'Ohio',

'Ohio', 'Ohio'],

[2001, 2000, 2000, 2000, 2001, 2002]],

columns=['event1', 'event2'])

lefth

key1key2data

0

Ohio

2000

0.0

1

Ohio

2001

1.0

2

Ohio

2002

2.0

3

Nevada

2001

3.0

4

Nevada

2002

4.0

righth

event1event2

Nevada2001

0

1

2000

2

3

Ohio2000

4

5

2000

6

7

2001

8

9

2002

10

11

这种情况下,你必须以列表的形式指明用作合并键的多个列(注意用how='outer’对重复索引值的处理):

pd.merge(lefth, righth, left_on=['key1', 'key2'], right_index=True)

key1key2dataevent1event2

0

Ohio

2000

0.0

4

5

0

Ohio

2000

0.0

6

7

1

Ohio

2001

1.0

8

9

2

Ohio

2002

2.0

10

11

3

Nevada

2001

3.0

0

1

pd.merge(lefth, righth, left_on=['key1', 'key2'],

right_index=True, how='outer')

key1key2dataevent1event2

0

Ohio

2000

0.0

4.0

5.0

0

Ohio

2000

0.0

6.0

7.0

1

Ohio

2001

1.0

8.0

9.0

2

Ohio

2002

2.0

10.0

11.0

3

Nevada

2001

3.0

0.0

1.0

4

Nevada

2002

4.0

NaN

NaN

4

Nevada

2000

NaN

2.0

3.0

同时使用合并双方的索引也没问题:

left2 = pd.DataFrame([[1., 2.], [3., 4.], [5., 6.]],

index=['a', 'c', 'e'],

columns=['Ohio', 'Nevada'])

right2 = pd.DataFrame([[7., 8.], [9., 10.], [11., 12.], [13, 14]],

index=['b', 'c', 'd', 'e'],

columns=['Missouri', 'Alabama'])

left2

OhioNevada

a

1.0

2.0

c

3.0

4.0

e

5.0

6.0

right2

MissouriAlabama

b

7.0

8.0

c

9.0

10.0

d

11.0

12.0

e

13.0

14.0

pd.merge(left2, right2, how='outer', left_index=True, right_index=True)

OhioNevadaMissouriAlabama

a

1.0

2.0

NaN

NaN

b

NaN

NaN

7.0

8.0

c

3.0

4.0

9.0

10.0

d

NaN

NaN

11.0

12.0

e

5.0

6.0

13.0

14.0

DataFrame还有一个便捷的join实例方法,它能更为方便地实现按索引合并。它还可用于合并多个带有相同或相似索引的DataFrame对象,但要求没有重叠的列。在上面那个例子中,我们可以编写:

left2.join(right2, how='outer')

OhioNevadaMissouriAlabama

a

1.0

2.0

NaN

NaN

b

NaN

NaN

7.0

8.0

c

3.0

4.0

9.0

10.0

d

NaN

NaN

11.0

12.0

e

5.0

6.0

13.0

14.0

因为一些历史版本的遗留原因,DataFrame的join方法默认使用的是左连接,保留左边表的行索引。它还支持在调用的DataFrame的列上,连接传递的DataFrame索引:

left1.join(right1, on='key')

keyvaluegroup_val

0

a

0

3.5

1

b

1

7.0

2

a

2

3.5

3

a

3

3.5

4

b

4

7.0

5

c

5

NaN

最后,对于简单的索引合并,你还可以向join传入一组DataFrame,下一节会介绍更为通用的concat函数,也能实现此功能:

another = pd.DataFrame([[7., 8.], [9., 10.], [11., 12.], [16., 17.]],

index=['a', 'c', 'e', 'f'],

columns=['New York',

'Oregon'])

another

New YorkOregon

a

7.0

8.0

c

9.0

10.0

e

11.0

12.0

f

16.0

17.0

left2.join([right2, another])

OhioNevadaMissouriAlabamaNew YorkOregon

a

1.0

2.0

NaN

NaN

7.0

8.0

c

3.0

4.0

9.0

10.0

9.0

10.0

e

5.0

6.0

13.0

14.0

11.0

12.0

left2.join([right2, another], how='outer')

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/frame.py:6369: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

verify_integrity=True)

OhioNevadaMissouriAlabamaNew YorkOregon

a

1.0

2.0

NaN

NaN

7.0

8.0

b

NaN

NaN

7.0

8.0

NaN

NaN

c

3.0

4.0

9.0

10.0

9.0

10.0

d

NaN

NaN

11.0

12.0

NaN

NaN

e

5.0

6.0

13.0

14.0

11.0

12.0

f

NaN

NaN

NaN

NaN

16.0

17.0

轴向连接

另一种数据合并运算也被称作连接(concatenation)、绑定(binding)或堆叠(stacking)。NumPy的concatenation函数可以用NumPy数组来做:

arr = np.arange(12).reshape((3, 4))

arr

array([[ 0, 1, 2, 3],

[ 4, 5, 6, 7],

[ 8, 9, 10, 11]])

np.concatenate([arr, arr], axis=1)

array([[ 0, 1, 2, 3, 0, 1, 2, 3],

[ 4, 5, 6, 7, 4, 5, 6, 7],

[ 8, 9, 10, 11, 8, 9, 10, 11]])

对于pandas对象(如Series和DataFrame),带有标签的轴使你能够进一步推广数组的连接运算。具体点说,你还需要考虑以下这些东西:

如果对象在其它轴上的索引不同,我们应该合并这些轴的不同元素还是只使用交集?

连接的数据集是否需要在结果对象中可识别?

连接轴中保存的数据是否需要保留?许多情况下,DataFrame默认的整数标签最好在连接时删掉。

pandas的concat函数提供了一种能够解决这些问题的可靠方式。我将给出一些例子来讲解其使用方式。假设有三个没有重叠索引的Series:

s1 = pd.Series([0, 1], index=['a', 'b'])

s2 = pd.Series([2, 3, 4], index=['c', 'd', 'e'])

s3 = pd.Series([5, 6], index=['f', 'g'])

对这些对象调用concat可以将值和索引粘合在一起:

pd.concat([s1, s2, s3])

a 0

b 1

c 2

d 3

e 4

f 5

g 6

dtype: int64

默认情况下,concat是在axis=0上工作的,最终产生一个新的Series。如果传入axis=1,则结果就会变成一个DataFrame(axis=1是列):

pd.concat([s1, s2, s3], axis=1)

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel_launcher.py:1: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

"""Entry point for launching an IPython kernel.

012

a

0.0

NaN

NaN

b

1.0

NaN

NaN

c

NaN

2.0

NaN

d

NaN

3.0

NaN

e

NaN

4.0

NaN

f

NaN

NaN

5.0

g

NaN

NaN

6.0

这种情况下,另外的轴上没有重叠,从索引的有序并集(外连接)上就可以看出来。传入join='inner’即可得到它们的交集:

s4 = pd.concat([s1, s3])

s4

a 0

b 1

f 5

g 6

dtype: int64

pd.concat([s1, s4], axis=1)

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel_launcher.py:1: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

"""Entry point for launching an IPython kernel.

01

a

0.0

0

b

1.0

1

f

NaN

5

g

NaN

6

pd.concat([s1, s4], axis=1, join='inner')

01

a

0

0

b

1

1

在这个例子中,f和g标签消失了,是因为使用的是join='inner’选项。

你可以通过join_axes指定要在其它轴上使用的索引:

pd.concat([s1, s4], axis=1, join_axes=[['a', 'c', 'b', 'e']])

01

a

0.0

0.0

c

NaN

NaN

b

1.0

1.0

e

NaN

NaN

不过有个问题,参与连接的片段在结果中区分不开。假设你想要在连接轴上创建一个层次化索引。使用keys参数即可达到这个目的:

result = pd.concat([s1, s1, s3], keys=['one','two', 'three'])

result

one a 0

b 1

two a 0

b 1

three f 5

g 6

dtype: int64

result.unstack()

abfg

one

0.0

1.0

NaN

NaN

two

0.0

1.0

NaN

NaN

three

NaN

NaN

5.0

6.0

如果沿着axis=1对Series进行合并,则keys就会成为DataFrame的列头:

pd.concat([s1, s2, s3], axis=1, keys=['one','two', 'three'])

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel_launcher.py:1: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

"""Entry point for launching an IPython kernel.

onetwothree

a

0.0

NaN

NaN

b

1.0

NaN

NaN

c

NaN

2.0

NaN

d

NaN

3.0

NaN

e

NaN

4.0

NaN

f

NaN

NaN

5.0

g

NaN

NaN

6.0

同样的逻辑也适用于DataFrame对象:

df1 = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape(3, 2), index=['a', 'b', 'c'],

columns=['one', 'two'])

df2 = pd.DataFrame(5 + np.arange(4).reshape(2, 2), index=['a', 'c'],

columns=['three', 'four'])

df1

onetwo

a

0

1

b

2

3

c

4

5

df2

threefour

a

5

6

c

7

8

pd.concat([df1, df2], axis=1, keys=['level1', 'level2'])

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel_launcher.py:1: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

"""Entry point for launching an IPython kernel.

level1level2

onetwothreefour

a

0

1

5.0

6.0

b

2

3

NaN

NaN

c

4

5

7.0

8.0

如果传入的不是列表而是一个字典,则字典的键就会被当做keys选项的值:

pd.concat({'level1': df1, 'level2': df2}, axis=1)

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel_launcher.py:1: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

"""Entry point for launching an IPython kernel.

level1level2

onetwothreefour

a

0

1

5.0

6.0

b

2

3

NaN

NaN

c

4

5

7.0

8.0

此外还有两个用于管理层次化索引创建方式的参数(参见表)。举个例子,我们可以用names参数命名创建的轴级别:

pd.concat([df1, df2], axis=1, keys=['level1', 'level2'],

names=['upper', 'lower'])

/root/miniconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel_launcher.py:2: FutureWarning: Sorting because non-concatenation axis is not aligned. A future version

of pandas will change to not sort by default.

To accept the future behavior, pass 'sort=False'.

To retain the current behavior and silence the warning, pass 'sort=True'.

upperlevel1level2

loweronetwothreefour

a

0

1

5.0

6.0

b

2

3

NaN

NaN

c

4

5

7.0

8.0

最后一个关于DataFrame的问题是,DataFrame的行索引不包含任何相关数据:

df1 = pd.DataFrame(np.random.randn(3, 4), columns=['a', 'b', 'c', 'd'])

df2 = pd.DataFrame(np.random.randn(2, 3), columns=['b', 'd', 'a'])

df1

abcd

0

0.177684

-0.333667

0.845828

2.385357

1

-1.223687

1.056661

0.900190

0.144737

2

0.004082

0.694430

-0.314125

2.032626

df2

bda

0

1.083106

1.116694

-0.413869

1

-0.671038

0.892496

0.414917

在这种情况下,传入ignore_index=True即可:

pd.concat([df1, df2], ignore_index=True, sort=False)

abcd

0

0.177684

-0.333667

0.845828

2.385357

1

-1.223687

1.056661

0.900190

0.144737

2

0.004082

0.694430

-0.314125

2.032626

3

-0.413869

1.083106

NaN

1.116694

4

0.414917

-0.671038

NaN

0.892496

concat函数的参数

参数说明

objs

参与连接的pandas对象的列表或字典。唯一必需的参数

axis

指明连接的轴向,默认0

join

inner,outer其中之一,默认是outer。指明其他轴上的索引是按交集(inner)还是并集(outer)进行合并

join_axes

指明用于其他n-1条轴的索引,不执行并集/交集运算

keys

与连接对象有关的值,用于形成连接轴上的层次化索引

levels

指定用作层次化索引各级别上的索引,如果设置了keys的话

names

用于创建分层级别的名称,如果设置了keys或(和)levels的话

verify_intergrity

检查结果对象新轴上的重复情况,默认False允许重复

ignore_index

不保留连接轴上的索引,产生一组新索引range(total_length)

合并重叠数据

还有一种数据组合问题不能用简单的合并(merge)或连接(concatenation)运算来处理。比如说,你可能有索引全部或部分重叠的两个数据集。举个有启发性的例子,我们使用NumPy的where函数,它表示一种等价于面向数组的if-else:

a = pd.Series([np.nan, 2.5, np.nan, 3.5, 4.5, np.nan],

index=['f', 'e', 'd', 'c', 'b', 'a'])

b = pd.Series(np.arange(len(a), dtype=np.float64),

index=['f', 'e', 'd', 'c', 'b', 'a'])

b[-1] = np.nan

a

f NaN

e 2.5

d NaN

c 3.5

b 4.5

a NaN

dtype: float64

b

f 0.0

e 1.0

d 2.0

c 3.0

b 4.0

a NaN

dtype: float64

np.where(pd.isnull(a), b, a)

array([0. , 2.5, 2. , 3.5, 4.5, nan])

Series有一个combine_first方法,实现的也是一样的功能,还带有pandas的数据对齐:

b[:-2].combine_first(a[2:])

a NaN

b 4.5

c 3.0

d 2.0

e 1.0

f 0.0

dtype: float64

对于DataFrame,combine_first自然也会在列上做同样的事情,因此你可以将其看做:用传递对象中的数据为调用对象的缺失数据“打补丁”:

df1 = pd.DataFrame({'a': [1., np.nan, 5., np.nan],

'b': [np.nan, 2., np.nan, 6.],

'c': range(2, 18, 4)})

df2 = pd.DataFrame({'a': [5., 4., np.nan, 3., 7.],

'b': [np.nan, 3., 4., 6., 8.]})

df1

abc

0

1.0

NaN

2

1

NaN

2.0

6

2

5.0

NaN

10

3

NaN

6.0

14

df2

ab

0

5.0

NaN

1

4.0

3.0

2

NaN

4.0

3

3.0

6.0

4

7.0

8.0

df1.combine_first(df2)

abc

0

1.0

NaN

2.0

1

4.0

2.0

6.0

2

5.0

4.0

10.0

3

3.0

6.0

14.0

4

7.0

8.0

NaN

重塑和轴向旋转

有许多用于重新排列表格型数据的基础运算。这些函数也称作重塑(reshape)或轴向旋转(pivot)运算。

重塑层次化索引

层次化索引为DataFrame数据的重排任务提供了一种具有良好一致性的方式。主要功能有二:

stack:将数据的列“旋转”为行。

unstack:将数据的行“旋转”为列。

我将通过一系列的范例来讲解这些操作。接下来看一个简单的DataFrame,其中的行列索引均为字符串数组:

data = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape((2, 3)),

index=pd.Index(['Ohio','Colorado'], name='state'),

columns=pd.Index(['one', 'two', 'three'],name='number'))

data

numberonetwothree

state

Ohio

0

1

2

Colorado

3

4

5

对该数据使用stack方法即可将列转换为行,得到一个Series:

result = data.stack()

result

state number

Ohio one 0

two 1

three 2

Colorado one 3

two 4

three 5

dtype: int64

对于一个层次化索引的Series,你可以用unstack将其重排为一个DataFrame:

result.unstack()

numberonetwothree

state

Ohio

0

1

2

Colorado

3

4

5

默认情况下,unstack操作的是最内层(stack也是如此)。传入分层级别的编号或名称即可对其它级别进行unstack操作

result.unstack(0)

stateOhioColorado

number

one

0

3

two

1

4

three

2

5

result.unstack('state')

stateOhioColorado

number

one

0

3

two

1

4

three

2

5

如果不是所有的级别值都能在各分组中找到的话,则unstack操作可能会引入缺失数据:

s1 = pd.Series([0, 1, 2, 3], index=['a', 'b', 'c', 'd'])

s2 = pd.Series([4, 5, 6], index=['c', 'd', 'e'])

data2 = pd.concat([s1, s2], keys=['one', 'two'])

data2

one a 0

b 1

c 2

d 3

two c 4

d 5

e 6

dtype: int64

data2.unstack()

abcde

one

0.0

1.0

2.0

3.0

NaN

two

NaN

NaN

4.0

5.0

6.0

stack默认会滤除缺失数据,因此该运算是可逆的:

data2.unstack()

abcde

one

0.0

1.0

2.0

3.0

NaN

two

NaN

NaN

4.0

5.0

6.0

data2.unstack().stack()

one a 0.0

b 1.0

c 2.0

d 3.0

two c 4.0

d 5.0

e 6.0

dtype: float64

data2.unstack().stack(dropna=False)

one a 0.0

b 1.0

c 2.0

d 3.0

e NaN

two a NaN

b NaN

c 4.0

d 5.0

e 6.0

dtype: float64

在对DataFrame进行unstack操作时,作为旋转轴的级别将会成为结果中的最低级别:

df = pd.DataFrame({'left': result, 'right': result + 5},

columns=pd.Index(['left', 'right'], name='side'))

df

sideleftright

statenumber

Ohioone

0

5

two

1

6

three

2

7

Coloradoone

3

8

two

4

9

three

5

10

df.unstack('state')

sideleftright

stateOhioColoradoOhioColorado

number

one

0

3

5

8

two

1

4

6

9

three

2

5

7

10

当调用stack,我们可以指明轴的名字:

df.unstack('state').stack('side')

stateColoradoOhio

numberside

oneleft

3

0

right

8

5

twoleft

4

1

right

9

6

threeleft

5

2

right

10

7

将“长格式”旋转为“宽格式”

多个时间序列数据通常是以所谓的“长格式”(long)或“堆叠格式”(stacked)存储在数据库和CSV中的。我们先加载一些示例数据,做一些时间序列规整和数据清洗:

data = pd.read_csv('examples/macrodata.csv')

data.head()

yearquarterrealgdprealconsrealinvrealgovtrealdpicpim1tbilrateunemppopinflrealint

0

1959.0

1.0

2710.349

1707.4

286.898

470.045

1886.9

28.98

139.7

2.82

5.8

177.146

0.00

0.00

1

1959.0

2.0

2778.801

1733.7

310.859

481.301

1919.7

29.15

141.7

3.08

5.1

177.830

2.34

0.74

2

1959.0

3.0

2775.488

1751.8

289.226

491.260

1916.4

29.35

140.5

3.82

5.3

178.657

2.74

1.09

3

1959.0

4.0

2785.204

1753.7

299.356

484.052

1931.3

29.37

140.0

4.33

5.6

179.386

0.27

4.06

4

1960.0

1.0

2847.699

1770.5

331.722

462.199

1955.5

29.54

139.6

3.50

5.2

180.007

2.31

1.19

periods = pd.PeriodIndex(year=data.year, quarter=data.quarter,

name='date')

periods

PeriodIndex(['1959Q1', '1959Q2', '1959Q3', '1959Q4', '1960Q1', '1960Q2',

'1960Q3', '1960Q4', '1961Q1', '1961Q2',

...

'2007Q2', '2007Q3', '2007Q4', '2008Q1', '2008Q2', '2008Q3',

'2008Q4', '2009Q1', '2009Q2', '2009Q3'],

dtype='period[Q-DEC]', name='date', length=203, freq='Q-DEC')

columns = pd.Index(['realgdp', 'infl', 'unemp'], name='item')

columns

Index(['realgdp', 'infl', 'unemp'], dtype='object', name='item')

data = data.reindex(columns=columns)

data.head()

itemrealgdpinflunemp

0

2710.349

0.00

5.8

1

2778.801

2.34

5.1

2

2775.488

2.74

5.3

3

2785.204

0.27

5.6

4

2847.699

2.31

5.2

data.index = periods.to_timestamp('D', 'end')

data.head()

itemrealgdpinflunemp

date

1959-03-31

2710.349

0.00

5.8

1959-06-30

2778.801

2.34

5.1

1959-09-30

2775.488

2.74

5.3

1959-12-31

2785.204

0.27

5.6

1960-03-31

2847.699

2.31

5.2

ldata = data.stack().reset_index().rename(columns={0: 'value'})

ldata.head()

dateitemvalue

0

1959-03-31

realgdp

2710.349

1

1959-03-31

infl

0.000

2

1959-03-31

unemp

5.800

3

1959-06-30

realgdp

2778.801

4

1959-06-30

infl

2.340

这就是多个时间序列(或者其它带有两个或多个键的可观察数据,这里,我们的键是date和item)的长格式。表中的每行代表一次观察。

关系型数据库(如MySQL)中的数据经常都是这样存储的,因为固定架构(即列名和数据类型)有一个好处:随着表中数据的添加,item列中的值的种类能够增加。在前面的例子中,date和item通常就是主键(用关系型数据库的说法),不仅提供了关系完整性,而且提供了更为简单的查询支持。有的情况下,使用这样的数据会很麻烦,你可能会更喜欢DataFrame,不同的item值分别形成一列,date列中的时间戳则用作索引。DataFrame的pivot方法完全可以实现这个转换:

pivoted = ldata.pivot('date', 'item', 'value')

pivoted.head()

iteminflrealgdpunemp

date

1959-03-31

0.00

2710.349

5.8

1959-06-30

2.34

2778.801

5.1

1959-09-30

2.74

2775.488

5.3

1959-12-31

0.27

2785.204

5.6

1960-03-31

2.31

2847.699

5.2

前两个传递的值分别用作行和列索引,最后一个可选值则是用于填充DataFrame的数据列。假设有两个需要同时重塑的数据列:

ldata['value2'] = np.random.randn(len(ldata))

ldata.head()

dateitemvaluevalue2

0

1959-03-31

realgdp

2710.349

-0.201684

1

1959-03-31

infl

0.000

-0.821067

2

1959-03-31

unemp

5.800

-0.520952

3

1959-06-30

realgdp

2778.801

1.085979

4

1959-06-30

infl

2.340

0.879421

如果忽略最后一个参数,得到的DataFrame就会带有层次化的列:

pivoted = ldata.pivot('date', 'item')

pivoted[:5]

valuevalue2

iteminflrealgdpunempinflrealgdpunemp

date

1959-03-31

0.00

2710.349

5.8

-0.821067

-0.201684

-0.520952

1959-06-30

2.34

2778.801

5.1

0.879421

1.085979

-0.013487

1959-09-30

2.74

2775.488

5.3

1.103906

0.496249

0.645224

1959-12-31

0.27

2785.204

5.6

-1.825783

-0.190713

1.630975

1960-03-31

2.31

2847.699

5.2

-0.625469

0.529104

-1.600850

pivoted['value'][:5]

iteminflrealgdpunemp

date

1959-03-31

0.00

2710.349

5.8

1959-06-30

2.34

2778.801

5.1

1959-09-30

2.74

2775.488

5.3

1959-12-31

0.27

2785.204

5.6

1960-03-31

2.31

2847.699

5.2

注意,pivot其实就是用set_index创建层次化索引,再用unstack重塑:

ldata.set_index(['date', 'item']).head()

valuevalue2

dateitem

1959-03-31realgdp

2710.349

-0.201684

infl

0.000

-0.821067

unemp

5.800

-0.520952

1959-06-30realgdp

2778.801

1.085979

infl

2.340

0.879421

unstacked = ldata.set_index(['date', 'item']).unstack('item')

unstacked[:7]

valuevalue2

iteminflrealgdpunempinflrealgdpunemp

date

1959-03-31

0.00

2710.349

5.8

-0.821067

-0.201684

-0.520952

1959-06-30

2.34

2778.801

5.1

0.879421

1.085979

-0.013487

1959-09-30

2.74

2775.488

5.3

1.103906

0.496249

0.645224

1959-12-31

0.27

2785.204

5.6

-1.825783

-0.190713

1.630975

1960-03-31

2.31

2847.699

5.2

-0.625469

0.529104

-1.600850

1960-06-30

0.14

2834.390

5.2

-1.478618

-1.189062

0.675593

1960-09-30

2.70

2839.022

5.6

-0.659115

-0.061352

0.118526

将“宽格式”旋转为“长格式”

旋转DataFrame的逆运算是pandas.melt。它不是将一列转换到多个新的DataFrame,而是合并多个列成为一个,产生一个比输入长的DataFrame。看一个例子:

df = pd.DataFrame({'key': ['foo', 'bar', 'baz'],

'A': [1, 2, 3],

'B': [4, 5, 6],

'C': [7, 8, 9]})

df

keyABC

0

foo

1

4

7

1

bar

2

5

8

2

baz

3

6

9

key列可能是分组指标,其它的列是数据值。当使用pandas.melt,我们必须指明哪些列是分组指标。下面使用key作为唯一的分组指标:

melted = pd.melt(df, ['key'])

melted

keyvariablevalue

0

foo

A

1

1

bar

A

2

2

baz

A

3

3

foo

B

4

4

bar

B

5

5

baz

B

6

6

foo

C

7

7

bar

C

8

8

baz

C

9

使用pivot,可以重塑回原来的样子:

reshaped = melted.pivot('key', 'variable', 'value')

reshaped

variableABC

key

bar

2

5

8

baz

3

6

9

foo

1

4

7

因为pivot的结果从列创建了一个索引,用作行标签,我们可以使用reset_index将数据移回列:

reshaped.reset_index()

variablekeyABC

0

bar

2

5

8

1

baz

3

6

9

2

foo

1

4

7

你还可以指定列的子集,作为值的列:

pd.melt(df, id_vars=['key'], value_vars=['A', 'B'])

keyvariablevalue

0

foo

A

1

1

bar

A

2

2

baz

A

3

3

foo

B

4

4

bar

B

5

5

baz

B

6

pandas.melt也可以不用分组指标:

pd.melt(df, value_vars=['A', 'B', 'C'])

variablevalue

0

A

1

1

A

2

2

A

3

3

B

4

4

B

5

5

B

6

6

C

7

7

C

8

8

C

9

pd.melt(df, value_vars=['key', 'A', 'B'])

variablevalue

0

key

foo

1

key

bar

2

key

baz

3

A

1

4

A

2

5

A

3

6

B

4

7

B

5

8

B

6

总结

现在你已经掌握了pandas数据导入、清洗、重塑,我们可以进一步学习matplotlib数据可视化。我们在稍后会回到pandas,学习更高级的分析。

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