欢迎关注”生信修炼手册”!基因组结构元件的可视化有多种方式，比如IGV等基因组浏览器中以track为单位的展示形式，亦或以circos为代表的圈图形式，比如在细胞器基因组组装中，基因元件常用圈图形式展示，示例如下在biopython中，通过BiolGraphics子模块可以对基因组结构进行可视化，支持线性和圈图两种可视化方式。其中，基因组结构信息存储在genebank格式的文件中，首先通过Bio....
欢迎关注”生信修炼手册”!
基因组结构元件的可视化有多种方式，比如IGV等基因组浏览器中以track为单位的展示形式，亦或以circos为代表的圈图形式，比如在细胞器基因组组装中，基因元件常用圈图形式展示，示例如下
在biopython中，通过BiolGraphics子模块可以对基因组结构进行可视化，支持线性和圈图两种可视化方式。其中，基因组结构信息存储在genebank格式的文件中，首先通过Bio.SeqIO读取结构信息，然后通过Bio.Graphics模块进行可视化。
以下列数据为例，先来看下可视化的用法
>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_005816
首先是读取gb文件，代码如下
接下来提取gb文件中的feature信息，构建用于绘图的数据结构，代码如下
最后进行绘图即可，代码如下
输出结果如下
对于圈图，只需要修改简单修改绘图的参数即可，代码如下
输出结果如下
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