ggplot2分面柱状图柱子比例一致_生信代码：密度图、直方图、柱状图 (ggpubr)

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今天我们要分享的R包是 ggpubr 包，它是一款基于ggplot2的可视化包，功能非常强大，能够一行命令绘制出符合出版物要求的图形。ggpubr 包可绘制的图形类型非常多，有密度图、直方图、柱状图、饼图、棒棒糖图、Cleveland 点图、箱线图、小提琴图、点带图、点图、散点图、线图、误差棒图……哈哈，有木有很期待接下来这个 ggpubr 包的学习了呢！别急，这个包的内容实在是有点多哈，接下来我们会分3期进行详细的讲解，记得紧跟我们的学习哦~

先简单介绍一下今天要分享的绘图内容，分别有：密度图、直方图、柱状图、饼图、棒棒糖图、Cleveland 点图。

接下来，先安装 ggpubr 包：

# Install from CRAN：install.packages("ggpubr")library(ggpubr)

密度图

#先构建数据集

set.seed(1234)df1                  weight=c(rnorm(200, 55), rnorm(200, 58)))head(df1)#   sex   weight# 1   F 53.79293# 2   F 55.27743# 3   F 56.08444# 4   F 52.65430# 5   F 55.42912# 6   F 55.50606tail(df1)#     sex   weight# 395   M 58.52875# 396   M 58.78939# 397   M 58.45710# 398   M 58.53883# 399   M 58.01464# 400   M 57.08351

# 基础样式，添加均值线和地毯线，密度图展示不同性别分组下体重的分布，X轴为体重，Y轴为自动累计的密度

ggdensity(df1, x = "weight", fill = "lightgray", add = "mean", rug = TRUE)

 

# 根据分组设置线条颜色和填充

ggdensity(df1, x="weight", add = "mean",           rug = TRUE, color = "sex", fill = "sex",          palette = c("#00AFBB", "#E7B800"))

 

# 更改自定义颜色

ggdensity(df1, x="weight", add = "mean", rug = TRUE,           color = "sex", fill = "sex",          palette = "npg")

 

# 限定x轴取值范围

ggdensity(df1, x="weight", add = "mean", rug = TRUE,          color = "sex", fill = "sex",          palette = "npg") + xlim(53,60)

# 设置分组分面，更改边框线类型

ggdensity(df1, x = "weight", facet.by = "sex", linetype = "dashed",          add = "mean", rug = TRUE,          color = "sex", fill = "sex",          palette = c("#00AFBB", "#E7B800"))

接下来我们详细解读一下用到的 ggdensity 函数：用法：

ggdensity(data, x, y = "..density..", combine = FALSE, merge = FALSE,  color = "black", fill = NA, palette = NULL, size = NULL,  linetype = "solid", alpha = 0.5, title = NULL, xlab = NULL,  ylab = NULL, facet.by = NULL, panel.labs = NULL,  short.panel.labs = TRUE, add = c("none", "mean", "median"),  add.params = list(linetype = "dashed"), rug = FALSE, label = NULL,  font.label = list(size = 11, color = "black"), label.select = NULL,  repel = FALSE, label.rectangle = FALSE, ggtheme = theme_pubr(),  ...)

参数：篇幅有限，没有用到的自行探索~，有的参数在后面的其他图形还会讲解

data	所需的数据框 dataframe
x	进行作图所需的数据
y	设置为密度/数量(density/count)
combine	对于多个变量的数据是否分面
merge	对于多个变量的数据是否合并，默认是FALSE
color, fill	线条颜色与填充色
palette	自定义颜色画板
size	设置点和轮廓的大小
linetype	线条类型
alpha	透明度设置
title	设置标题
xlab	设置x轴标题
ylab	设置y轴标题
facet.by	设置分组分面
panel.labs	设置分面各组的标题
short.panel.labs	是否缩写分面标题，逻辑值，默认是TRUE。
add	添加均值线或中位数线，选项有"mean" or "median"
add.params	给add参数的对象添加其他参数/属性
rug	逻辑值，若为TRUE，在X轴