mysql数据库中本体数据_基于关系型数据库的本体持久化

关系型数据库技术成熟、使用广泛，支持工具丰富而功能强大，数据存储、查询效率高，因此在语义数据存储尚未成熟、无有效工具出现时，很自然地被广泛应用于本体数据的存储。由于本体模型和关系模型的差异，基于关系型数据库的本体存储存在多种模式(李曼等, 2005)：

(1) 水平模式

该模式在数据库中只用一张表来表示本体，表中列为本体的属性，表中的一个记录对应本体中的每个实例。由于在本体的更新、进化过程中，本体属性数量和名称都可能发生变化，且并非所有实例都具有相同属性。因此，此模式数据表列需要经常变化，且存在大量空值，只适用于小规模的静态的本体。

(2) 垂直模式

这种模式只包含一张三元组表，表中每个记录对应一个三元组，用三元组的形式来描述本体全部信息。此模式结构稳定，但是可读性差，难以构造SQL以进行查询，不利于本体应用。

(3) 分解模式

基本思想是将数据库进行模式分解。现有的分解模式的方法中，第一种是基于类的分解模式，即以类名为表名，类的属性为表的列，为本体中的每个类都创建一张单独的表；另外一种是基于属性的分解模式，即以属性名为表名，表中包含两列，分别代表RDF 中的Subject 和Object，为本体中的每个属性创建一张单独的表。此模式需随着本体的更新、修改不断新建、删除数据表，效率低，代价大，也不利于本体的应用。

(4) 其他模式

包括将上述几种模式混合使用的混合模式和将OWL 描述词汇映射为数据表以存储存在此关系的本体资源、提高查询效率的模式等。

语义网开发框架Jena 的SQL 数据库引擎SDB 采用一种混合模式，将本体内容存储到4 个相互关联的数据表中：节点表nodes、前缀表prefixes、四元组表quads 和三元组表triples。SDB 将本体视为图(Graph)的集合，RDF 中的Subject、Predicate 和Object 都是图中的结点，一个数据集可以有多个图。因此，顾名思义，nodes 存储本体中的结点，其列记录结点数据类型、语言等基本的属性；prefiexes 存储本体中定义的前缀；quads 存储命名图(Named Graph)和对应的RDF 记录；triples 存储RDF 三元组，其值为nodes 表中的主键值，实例属性和关系全部采用s-p-o(subject、predicate 和object)形式表达。SDB 模式表结构稳定、以一定的存储空间代价换取较高的数据增删改查效率，是一种较为优秀的本体关系数据库存储模式。

SDB 中存在“layout2/hash”和“layout2/index”两种主要的表模式，其区别是：“layout2/index”模式中的nodes 表以“id”列为主键，以“hash”列为索引；而“layout2/hash”没有“id”列，以“hash”列为主键。SDB 数据库连接信息、布局模式等内容可以在SDB 的配置文件(如下)中进行指定。

# Licensed under the terms of http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0# 前缀定义

@prefix sdb: .

@prefix rdfs: .

@prefix rdf: .

@prefix ja: .

rdf:type sdb:Store; sdb:layout "layout2" ;# "layout2", "layout2/hash" or "layout2/index"

sdb:connection ;.

rdf:type sdb:SDBConnection; sdb:sdbType "postgresql" ;# "oracle", "postgresql", "mysql"

sdb:sdbHost "localhost";#"localhost:1521";# 地址，可加端口 :port

sdb:sdbName "sdb_test"; sdb:sdbUser "user"; sdb:sdbPassword "pw"; sdb:driver "org.postgresql.Driver" ;#"oracle.jdbc.driver.OracleDriver";# 数据库驱动

采用配置文件设置数据库连接信息之后，采用如下方法读取本体文件并存储到数据库相应数据表中。

String file = "src/main/resources/CCS.owl";//本体文件地址//连接数据库，使用配置文件

Store store = SDBFactory.connectStore("src/main/resources/sdb-pgsql.ttl");//创建数据库表

store.getTableFormatter().create();

Model model=SDBFactory.connectDefaultModel(store);//读取owl文件到model中

try{

FileManager.get().readModel(model, file,"OWL");

}catch(Exception e){throw new IllegalArgumentException("文件不存在！");

}//System.out.println(model.size());//关闭连接和储存，释放资源

store.getConnection().close();

store.close();

SDB 中的三元组表只记录结点的hash 或id 值，可读性差，难以直接构造SQL语句进行查询。但实际上SDB 设计目也不在于基于传统SQL 语句的本体查询，而是作为Jena 框架的关系数据库引擎，实现本体持久化存储。本体数据的查询则借助于Jena 的查询组件，使用本体查询语言SPARQL 实现。SDB 中利用SPARQL 语句实现本体查询的具体算法如下所示：

String queryString = "Select * {?s ?p ?o}";

Store store= SDBFactory.connectStore(ttl); //连接数据库，使用配置文件

Query query = QueryFactory.create(queryString); //创建查询

Dataset dataset =DatasetStore.create(store);

QueryExecution qe=QueryExecutionFactory.create(query, dataset);

ResultSet resultSet=qe.execSelect();

ResultSetFormatter.out(resultSet);//控制台格式化输出查询结果

qe.close(); //关闭查询

store.getConnection().close(); //关闭连接

store.close();

——摘自《地学数据时间本体及其在语义检索中的应用——以地质年代本体为例》