conda create -n R3.5
conda search R
#注意修改CONDA本地镜像地址,否则有时候会出现错误。
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --set show_channel_urls yes
#注意要把.condarc文件里面的--default 选项删除否则有时候出错:CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://repo.anaconda.co
#Ubuntu下
vim .condarc #用户根目录下修改
Windows下首先需要找到.condarc文件
如果你不知道在哪的话可以这样
win+R
输入%HOMEPATH%
在这里插入图片描述
然后找到.condarc文件
把里面的内容替换成下面的
channels:
- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
show_channel_urls: true
ssl_verify: false
conda下安装R
conda search R
conda install r=3.5.1
修改国内镜像(非必须)
options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))
#安装开发环境依赖
sudo apt install build-essential libcurl4-gnutls-dev libxml2-dev libssl-dev
#可以安装R包了
install.packages("devtools")
1. 安装包
install.packages("BiocInstaller")
2. 卸载已安装包
remove.packages("BiocInstaller")
3. 查看已加载包
(.packages())
4. 卸除已加载包
detach("package:BiocInstaller")
5. 查看已安装的包
installed.packages()
6. 查看某个安装包提供的函数
help(package="BiocInstaller")
7. 查看某个函数属于哪个包
help("biocLite")