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RSS订阅原创 植物中鉴定直系同源基因
通过转录组学或基因表达芯片等技术，研究候选基因在不同组织、生长发育阶段或受到不同生物或非生物胁迫时的表达模式，以确定其在植物生物学过程中的功能和调控作用。：通过基因沉默（例如RNAi）或基因编辑技术（例如CRISPR/Cas9）等方法，对候选基因进行功能验证，以确定其对植物特定生物学过程的影响。：对已鉴定的直系同源基因进行进化分析，研究其在物种间的保守性和多样性，以了解它们在物种演化中的作用和演化历史。：首先对目标植物的基因组进行测序，并进行基因注释，以确定已知基因的位置和功能。
2024-04-16 17:06:32
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转载 geneHapR做基因单倍型分析
在单倍型分析前，首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型？一般来讲，所谓的单倍型是指同一染色体上不同变异位点的各种线性组合形式。那么基因单倍型自然就是指同一基因上（启动子、外显子、内含子、终止子）的不同变异位点的显性组合形式。说明：基因组或染色体水平的单倍型分析不在本文范畴之内，请您参考“https://www.jianshu.com/p/4de7762aa81e”。
2024-02-26 23:13:33
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原创 解决报错 Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again
gatk报错
2023-11-13 10:44:54
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转载 常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)
6. CIGAR CIGAR 字符串，即比对的详细情况，简要比对信息表达式（Compact Idiosyncratic Gapped Alignment Report），其以参考序列为基础，使用数字加字母表示比对结果，比如3S6M1P1I4M，前三个碱基被剪切去除了，然后6个比对上了，然后打开了一 个缺口，有一个碱基插入，最后是4个比对上了，是按照顺序的；则对应的测序质量分数为0，表示测序质量低。bam格式中的b是binary的意思，是sam格式的二进制表示方式，为什么要用二进制表示呢？
2023-10-16 16:41:37
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原创 CNVnator软件的安装
结果报错，显示samtools不是一个目录，由于自己 samtools 是利用conda自动安装的。点击其release，下载最新版本v0.4.1(CNVnator_v0.4.1.zip)CNVvator软件比较难安装，其依赖root软件等。首先下载Samtools和hislib软件。, 选择下列Ubuntu 20版本。##安装依赖包samtools。root 的下载地址。
2023-07-12 16:45:59
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原创 运行lumpyexpress时报错：can‘t open file ‘/opt/python27/lumpy_sv/scripts/bamkit/bam
lumpy-sv
2023-07-11 17:29:47
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原创 解决samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file
通过细读报错，发现可能是libcrypto出现了问题问题成功解决！
2023-07-07 17:16:32
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原创 重新安装conda时报错
由于删除了旧版本的conda，但是 bashrc文件中miniconda/ll/bin仍然配置在环境中，所以会报错，故需将.conda和。condarc文件删除，重新配置镜像。显示 miniconda3 文件夹已存在 （因为安装时会默认安装至此目录，如果此目录已经存在则会冲突报错），此时需将此文件夹重命名或者删除。报错，环境创建不成功。
2023-07-05 23:12:53
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原创 MobaXterm（终端工具）下载&安装&使用教程
选择免费版下载,免费版不仅提供了安装版，还提供了免安装的绿色版。5、点击YES,保存登录密码，下次登录就不需要再输入登录密码了。2、选中需要上传的文件后，点击“打开”即可上传文件到服务器。3、输入服务器ip、用户名、端口号，点击ok连接。4、更改安装路径后，选择next。6、点击finish完成软件安装。2、点击使用SSH方式连接服务器。5、点击install进行安装。4、输入服务器登录密码，回车。6、输入密码后，记录并保存。3、选择同意、next。1、点击Session。
2023-07-05 17:30:54
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原创 picard安装时报错“Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError”
picard
2023-07-05 16:50:06
2319
原创 R报错：WARNING: Rtools is required to build R packages, but is not currently installed.
出现报错：将程序包安装入‘C:/Users/86150/AppData/Local/R/win-library/4.2’(因为‘lib’没有被指定)
2023-07-03 11:01:37
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空空如也
空空如也
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