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原创 利用ascp下载SRA Explorer中转录组数据

ascp

2024-07-22 21:25:01 332

转载 conda创建、查看、删除虚拟环境(anaconda命令集)

conda

2024-07-22 12:33:09 57

原创 如何根据同一行的ID利用R语言对值进行求和

R

2024-07-20 00:55:15 409

原创 研究生学习必备神器

科研小工具

2024-06-05 16:05:18 1056

原创 利用conda进行R的安装

Linux系统中R的安装

2024-06-04 22:12:39 879

原创 利用R包“Phenotype”对表型值进行检查

GWAS之表型值统计

2024-06-04 16:59:24 1117

原创 如何构建基因单倍型网络

单倍型分析

2024-05-18 11:04:16 928 2

转载 LD衰减图怎么理解

LD衰减图

2024-05-17 17:51:29 85

原创 亚洲分为6个区

亚洲分区

2024-05-17 12:04:51 1839

原创 PCA主成分分析之R语言

PCA

2024-05-16 20:03:02 537

原创 如何利用R包进行主成分分析和可视化

PCA

2024-05-15 16:20:05 1348

原创 植物中鉴定直系同源基因

通过转录组学或基因表达芯片等技术,研究候选基因在不同组织、生长发育阶段或受到不同生物或非生物胁迫时的表达模式,以确定其在植物生物学过程中的功能和调控作用。:通过基因沉默(例如RNAi)或基因编辑技术(例如CRISPR/Cas9)等方法,对候选基因进行功能验证,以确定其对植物特定生物学过程的影响。:对已鉴定的直系同源基因进行进化分析,研究其在物种间的保守性和多样性,以了解它们在物种演化中的作用和演化历史。:首先对目标植物的基因组进行测序,并进行基因注释,以确定已知基因的位置和功能。

2024-04-16 17:06:32 591

原创 如何利用R语言获取worldclim30s的气候数据

R

2024-04-15 22:04:46 1297

转载 Worldclim(v1.4、v2.1)数据集使用介绍

WorldClim

2024-04-15 17:46:33 242

原创 WGCNA分析

WGCNA

2024-04-15 17:14:28 723

转载 geneHapR做基因单倍型分析

在单倍型分析前,首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型?一般来讲,所谓的单倍型是指同一染色体上不同变异位点的各种线性组合形式。那么基因单倍型自然就是指同一基因上(启动子、外显子、内含子、终止子)的不同变异位点的显性组合形式。说明:基因组或染色体水平的单倍型分析不在本文范畴之内,请您参考“https://www.jianshu.com/p/4de7762aa81e”。

2024-02-26 23:13:33 874 1

原创 DNA甲基化的相关知识

DNA甲基化

2023-11-14 23:30:40 304

原创 解决报错 Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again

gatk报错

2023-11-13 10:44:54 382

原创 转座子的鉴定

TE的鉴定

2023-11-08 17:20:18 744

原创 转座子的简介

转座子

2023-11-05 23:48:52 3715

原创 基因组WGD的鉴定与分化时间

WGD

2023-11-03 22:28:10 1058

原创 CSS的基本知识

换而言之,CSS就是用来修饰装扮HTML,使得HTML更加美观。

2023-11-02 23:20:59 93

原创 Circos图绘制

circos

2023-11-02 22:09:11 479

原创 基因家族扩张与收缩分析-CAFE5

基因家族收缩与扩张

2023-10-31 21:36:01 2862 3

原创 基因组注释-重复序列的屏蔽

重复序列的鉴定

2023-10-18 21:12:41 521

原创 基因组的Phasing原理

phasing haplotype

2023-10-18 14:29:30 328

转载 常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)

6. CIGAR CIGAR 字符串,即比对的详细情况,简要比对信息表达式(Compact Idiosyncratic Gapped Alignment Report),其以参考序列为基础,使用数字加字母表示比对结果,比如3S6M1P1I4M,前三个碱基被剪切去除了,然后6个比对上了,然后打开了一 个缺口,有一个碱基插入,最后是4个比对上了,是按照顺序的;则对应的测序质量分数为0,表示测序质量低。bam格式中的b是binary的意思,是sam格式的二进制表示方式,为什么要用二进制表示呢?

2023-10-16 16:41:37 3085

原创 ncbi-genome-download批量下载基因组数据

ncbi-genome-download

2023-10-11 13:28:50 5867 1

原创 HTML的相关知识

web就是网站开发。

2023-09-26 20:20:06 736

原创 利用不同类型数据构建系统发育树

构树

2023-09-25 22:06:54 852

原创 群体遗传学-选择消除分析

群体选择清除

2023-09-24 21:07:14 498

原创 基因组注释(Annotation)

Annotation

2023-09-23 20:30:07 1661

转载 基因组组装(assembly)

Genome assembly

2023-09-21 23:09:35 4106

原创 利用细胞流式术测定基因组大小和倍性

流式细胞术

2023-09-06 16:50:30 1561

原创 excel中单行换成多行

转置

2023-07-21 21:42:48 644

原创 linux中常见命令(1)

linux

2023-07-16 02:30:00 215

原创 snpEff注释结果解读

snpEff软件

2023-07-15 22:15:00 2075

原创 运行软件plotsr时报错:“ImportError: Incomplete genomic information”

plotsr

2023-07-14 22:28:47 361

原创 syri软件的安装

syri plotsr

2023-07-13 21:59:40 1063

原创 linux中configure命令的作用

configure

2023-07-13 17:47:43 1559

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