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原创 植物中鉴定直系同源基因
通过转录组学或基因表达芯片等技术,研究候选基因在不同组织、生长发育阶段或受到不同生物或非生物胁迫时的表达模式,以确定其在植物生物学过程中的功能和调控作用。:通过基因沉默(例如RNAi)或基因编辑技术(例如CRISPR/Cas9)等方法,对候选基因进行功能验证,以确定其对植物特定生物学过程的影响。:对已鉴定的直系同源基因进行进化分析,研究其在物种间的保守性和多样性,以了解它们在物种演化中的作用和演化历史。:首先对目标植物的基因组进行测序,并进行基因注释,以确定已知基因的位置和功能。
2024-04-16 17:06:32 591
转载 geneHapR做基因单倍型分析
在单倍型分析前,首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型?一般来讲,所谓的单倍型是指同一染色体上不同变异位点的各种线性组合形式。那么基因单倍型自然就是指同一基因上(启动子、外显子、内含子、终止子)的不同变异位点的显性组合形式。说明:基因组或染色体水平的单倍型分析不在本文范畴之内,请您参考“https://www.jianshu.com/p/4de7762aa81e”。
2024-02-26 23:13:33 874 1
原创 解决报错 Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again
gatk报错
2023-11-13 10:44:54 382
转载 常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3、bed、sam、bam、vcf)
6. CIGAR CIGAR 字符串,即比对的详细情况,简要比对信息表达式(Compact Idiosyncratic Gapped Alignment Report),其以参考序列为基础,使用数字加字母表示比对结果,比如3S6M1P1I4M,前三个碱基被剪切去除了,然后6个比对上了,然后打开了一 个缺口,有一个碱基插入,最后是4个比对上了,是按照顺序的;则对应的测序质量分数为0,表示测序质量低。bam格式中的b是binary的意思,是sam格式的二进制表示方式,为什么要用二进制表示呢?
2023-10-16 16:41:37 3085
空空如也
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