matlab silhouette函数,相当于Matlab的聚类质量函数?

本文介绍了如何在MATLAB和Python中实现聚类质量评估的silhouette函数,用于计算每个样本的轮廓系数。通过示例代码展示了如何计算并可视化这些值,以及如何在Python中利用scikit-learn库的silhouette_samples函数得到相同结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

我在下面展示了一个在MATLAB和Python/Numpy中的示例silhouette实现(请记住,我对MATLAB比较流利):

1) MATLAB语言function s = mySilhouette(X, IDX)

%# X : matrix of size N-by-p, data where rows are instances

%# IDX: vector of size N, cluster index of each instance (starting from 1)

%# s : vector of size N, silhouette score value of each instance

N = size(X,1); %# number of instances

K = numel(unique(IDX)); %# number of clusters

%# compute pairwise distance matrix

D = squareform( pdist(X,'euclidean').^2 );

%# indices belonging to each cluster

kIndices = accumarray(IDX, 1:N, [K 1], @(x){sort(x)});

%# compute a,b,s for each instance

%# a(i): average distance from i to all other data within the same cluster.

%# b(i): lowest average dist from i to the data of another single cluster

a = zeros(N,1);

b = zeros(

### 回答1: matlab中的silhouette函数是用于计算聚类结果的轮廓系数的函数。轮廓系数是一种用于评估聚类结果的指标,它反映了聚类结果的紧密度和分离度。silhouette函数可以帮助用户快速计算聚类结果的轮廓系数,并且可以根据轮廓系数的大小来评估聚类结果的好坏。 ### 回答2: silhouetteMATLAB中一个计算轮廓系数(silhouette coefficient)的函数。轮廓系数是一个用于评估聚类结果好坏的指标,它是对聚类结果中各个样本间距离越来越小,组内相似度越来越高,组间差异越来越大这一特点的量化表达。 silhouette函数的使用方法为:[S,h] = silhouette(X, idx),其中X为样本数据,idx为聚类结果,S为轮廓系数向量,h为轮廓系数图表句柄。轮廓系数向量中每个元素是对应样本的轮廓系数,其值越接近于1表示该样本越合适属于当前类别,越接近于-1表示该样本越应该划归于其它类别,而越接近于0则表明该样本在两个聚类中均没有明显优势,需要权衡。 silhouette函数除此之外还支持其它参数的设置,例如“distance”表示距离计算方法,“algorithm”表示聚类算法,“Replicates”表示重复聚类次数等等。通过这些参数的设置,可以进一步调整聚类结果以及轮廓系数的计算方式来达到更好的聚类效果。 在实际应用中,可以通过轮廓系数来确定最优聚类数,一般情况下,轮廓系数较高的聚类结果更可靠,但需要注意的是,该指标仅适用于欧几里得距离下平面数据的聚类,对于高维数据的聚类以及非欧氏距离下的聚类,可能需要采用其它指标来评估聚类效果。 ### 回答3: matlabsilhouette函数是一种用于计算聚类质量的算法,它可以帮助我们判断聚类结果的好坏,通过silhouette函数计算的值可以帮助我们确定最佳聚类数。 核心思想是对于每个数据点,通过计算其与同簇其他点的距离(dissimilarities)和与其他簇的距离(dissimilarities),得到其轮廓系数(silhouette coefficient)。 它涉及的基本公式是: s(i)=\frac{b(i)-a(i)}{max(a(i),b(i))} 其中,a(i)表示同簇其他点的平均距离(歧义度),b(i)表示与其他簇的最小平均距离(紧密度)。 轮廓系数与1接近,则说明聚类结果较好; 轮廓系数越接近-1,说明聚类结果较差。 通过silhouette函数的输出结果,我们可以有对象的可视化工具,例如silhouette plot,来比较不同算法、不同参数的效果。这样可以为我们的聚类分析选择最合适的参数,从而得到高质量聚类结果,为数据分析提供有效的支持。
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