稀疏矩阵存储格式总结+存储效率对比:COO,CSR,DIA,ELL,HYB

稀疏矩阵是指矩阵中的元素大部分是0的矩阵，事实上，实际问题中大规模矩阵基本上都是稀疏矩阵，很多稀疏度在90%甚至99%以上。因此我们需要有高效的稀疏矩阵存储格式。本文总结几种典型的格式：COO,CSR,DIA,ELL,HYB。

 

（1）Coordinate（COO）

这是最简单的一种格式，每一个元素需要用一个三元组来表示，分别是（行号，列号，数值），对应上图右边的一列。这种方式简单，但是记录单信息多（行列），每个三元组自己可以定位，因此空间不是最优。

 

（2）Compressed Sparse Row (CSR)

CSR是比较标准的一种，也需要三类数据来表达：数值，列号，以及行偏移。CSR不是三元组，而是整体的编码方式。数值和列号与COO一致，表示一个元素以及其列号，行偏移表示某一行的第一个元素在values里面的起始偏移位置。如上图中，第一行元素1是0偏移，第二行元素2是2偏移，第三行元素5是4偏移，第4行元素6是7偏移。在行偏移的最后补上矩阵总的元素个数，本例中是9。

 

CSC是和CSR相对应的一种方式，即按列压缩的意思。

以上图中矩阵为例：

Values：        [1 5 7 2 6 8 3 9 4]

Row Indices：[0 2 0 1 3 1 2 2 3]

Column Offsets：[0 2 5 7 9]

 

再来看一个CSR的例子[4]：

 

（3）ELLPACK (ELL)

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