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原创 PHDF5 并行hdf5 按列读写 (Columns )
PHDF5并行写入数据是发起多个进程,被发起进程按照某一规则 写入数据到指定位置。用C语言编写一个连续的hyperlab.在本例中,有一个8(行)x 6(列)的数据集,每个进程向数据集写入相同数量的列。
2022-11-27 11:41:01 958
原创 PHDF5(并行hdf5) 按行(rows)写入/读出
PHDF5并行写入数据是发起多个进程,被发起进程按照某一规则 写入数据到指定位置。用C语言编写一个连续的hyperlab。在本例中,您有一个8(行)x 5(列)的数据集,每个进程向数据集写入相同数量的行。
2022-11-27 11:28:20 971
原创 Parallel HDF5 简介
HDF5是HDF的最新版本,是最高层次的I/O库,提供并行应用程序之间的接口和并行MPI-IO操作,支持文件级并行I/O数据压缩,子集访问等高效存储机制,提供高效灵活的并行IO机制,并支持IO方式的数据集读写,采用二进制格式存储科学数据基元数据,文件格式统一。此篇介绍HDF5 并行工作原理。
2022-11-20 17:21:59 1291
原创 稀疏矩阵存储方式总结
讲解稀疏举证的三种存储方式。压缩存储稀疏矩阵的方法是:只存储矩阵中的非 0 元素,与前面的存储方法不同,稀疏矩阵非 0 元素的存储需同时存储该元素所在矩阵中的行标和列标。
2022-11-18 17:39:17 2708 2
原创 Plot3d 网格数据格式
PLOT3D是一个计算机图形程序,旨在可视化计算流体力学的网格和解决方案。PLOT3D文件可以是ASCII, 也可是Fortran unformatted 或 C binary形式。PLOT3D文件分为网格文件(XYZ 文件), 空气动力学结果文件 (Q 文件)和通用结果文件(函数文件 + 函数名称文件)。网格文件中可加入所谓的IBlank参数。
2022-10-11 11:47:43 2540 2
原创 结构化网格与非结构化网格 学习记录
从总体上来说,数值仿真计算中采用的网格可以大致分为结构化网格和非结构化网格两大类。本篇博客简单记录学习结构化网格与非结构化网格的定义及优缺点
2022-10-11 10:10:53 6330
原创 HDF5 学习总结1
HDF5 官网学习记录 HDF5 层次结构数据格式 实现了一个用于管理和存储数据的模型。是一种常见的跨平台数据储存文件,可以存储不同类型的图像和数码数据,并且可以在不同类型的机器上传输,同时还有统一处理这种文件格式的函数库。该模型包括一个抽象数据模型和一个抽象存储模型(数据格式),以及用于实现抽象模型并将存储模型映射到不同的存储机制的库。学习HDF5层次结构数据格式,利用其格式优点实现高效率并行存储、读取数据。此文档主要介绍HDF5的相关背景,及其抽象数据模型。
2022-10-09 18:45:40 1688
原创 linux sbatch 提交作业
linux sbatch提交作业使用sbatch提交作业方法可良好解决在登录端运行程序,避免程序运行中用较大较多资源时被kill。使用sbatch作业提交的方法能很好的解决这个问题。 sbatch提交作业时可以选择 串行(SRUN),并行(MPIRUN)运行可执行文件。...
2022-07-20 20:15:00 17912 2
原创 linux bsub提交作业
linux系统编写程序时无可避免要把源文件编译成可执行文件,在进行运行得出结果。但在登录超级计算机等端口(linux系统),若执行文件较大可能会被软件后台查杀,无法执行得到结果。使用bsub提交作业方法可良好解决在登录端运行程序,避免程序运行中用较大较多资源时被kill。使用bsub作业提交的方法能很好的解决这个问题。...
2022-07-19 22:02:10 4708
原创 linpack学习记录
linpack学习记录 基准测试程序(Benchmark)用来测量机器的硬件最高实际运行性能,以及软件优化的性能提升效果,可分为微基准测试程序(Microbenchmark)和宏基准测试程序(Macrobenchmark)
2022-01-12 16:21:26 702
Hdf5 总结.docx
2022-10-09
空空如也
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