#32 Duplicate a Sequence

最新推荐文章于 2024-07-15 12:30:08 发布
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文章标签： 人工智能
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weixin_34228662
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NGS测序结果中duplicate序列问题的理解
ncyujijian的博客
07-15 6945
首先，我们先来了解一下，什么是duplicate序列。大白话说，就是高通量测序结果中那些一模一样的序列。它们产生的原因有多种可能，以下图为例： 图片来自网络 其中，最好理解的原因就是PCR。因为一个DNA分子经过扩增之后，得到很多个一模一样的DNA产物。这些产物可能有2个及以上被测序了，这样就得到了重复序列。 看到这里，大家可能还会有疑问。难道高通量测序得到一模一样的序列不正常吗？嗯，测到这样一模一样的序列当然是正常现象，毕竟测序的时候要做桥式PCR，建库
DG-duplicate操作注意事项(各种报错应对方法)
clp1532的博客
03-30 1719
DG-duplicate 操作注意事项 1、duplicate时用户必须使用sys用户 2、to standby的脚本 #!/bin/bash LOG=duplicate...
HEVC 中的GOP/POC参数
haima1998的专栏
04-11 8602
转自：http://ms.csdn.net/share/24D39005B0584987A6AF99E6C39A4E4C_1_IPHONE_APP Pre HEVC学习笔记系列目录 GOP一直没有理清楚，现在记笔记总结一下现有的理解和遇到的问题。有错误请指正。 GOP 视频序列由若干时间连续的图像构成，在对其进行压缩时，先将视频序列分割为若干个小的图像组(G
TestPattern error
宝安小雨
05-26 5082
[mpegts @ 0x7f77740027c0] PES packet size mismatch [mpegts @ 0x7f77740027c0] Packet corrupt (stream = 1, dts = 84151592). read_time:126 [h264 @ 0x7f7774022c00] error while decoding MB 64 29, bytestream -6 againV read_time:3 [aac @ 0x7f777402e780] decode_ba
Invalid icc profile: duplicate sequence numbers
weixin_33938733的博客
02-15 329
处理图片时报异常信息：javax.p_w_picpathio.IIOException: Invalid icc profile: duplicate sequence numbers报异常的图片：网上有人遇到了同样的异常信息，并使用插件解决了问题：http://stackoverflow.com/questions/32023809/javax-p_w_picpathio-...
DUPLICATE
彦祖的小号的博客
07-29 764
Use theDUPLICATEcommand to create a copy of asource database. RMAN can create either a duplicate database or a standby database. RMAN can perform the duplication in any of the following supported modes: Active duplication RMAN duplicates the files d...
报错解决 Duplicate keys detected: '1'. This may cause an update error.
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随便记记
03-01 13万+
错误信息如下： 原因： key值不唯一 解决: 仔细检查是否用了同一个数据循环且:key值相同，如果相同给第二个key随便加一个标记就可以，如下： :key="index + '-only'"...
S7A驱动720版本
08-21
polling, after CP5611 sent a specific sequence of communication errors. Build 219 : Solved problems: Improvements and new functions: - New Parameter "Max Gap (Bytes)" on Setup parameter property...
Remove-duplicate-fasta:Python脚本删除重复的Fasta序列
05-13
-Python script to remove whole duplicate fasta sequences i.e identical sequence and header -input file must be in fasta format usage: python remove_duplicate_fasta.py inputfile outputfile 例子： ...
LTE from A to Z
05-11
1.2.4.1 Support of the new LTE L1............................................................32 1.2.4.2 Simple IP centric protocols supporting AIPN.................................32 1.2.4.3 Support ...
LTE from A to Z (part1 of 3)
05-11
1.2.4.1 Support of the new LTE L1............................................................32 1.2.4.2 Simple IP centric protocols supporting AIPN.................................32 1.2.4.3 Support ...
python duplicated_pandas DataFrame 重复数据处理 – duplicated()和 drop_duplicates()
weixin_39860757的博客
12-06 702
DataFrame.duplicated(self, subset: Union[Hashable, Sequence[Hashable], NoneType] = None, keep: Union[str, bool] = ‘first’)→ ‘Series’subset: 列标签(表头)，可以是单个，也可以是列表keep=’first’(默认)：标记/删除除第一个匹配项以外的重复项。kee...
[ffmpeg] [filter_fps] duplicate OR drop frame方式
sidemap的博客
09-02 733
在此举例一个duplicate frame的情况： 该情况发生的原因，生成的第一帧的pts不是从0开始的。 如果pts不正确，会导致fps filter根据pts进行相应帧的duplicate 假如：输入的time_base=50，第一帧的pts为80。设置的帧率转换fps=15 80/50 = 1.6秒 （ffmpeg认为这一帧需要显示到1.6秒） 需要进行帧率转换, 并且输出的time_base为15，则1.6秒需要显示的帧数量15*1.6 = 24 原来存在1帧，还需要duplicate 23帧
关于javax.imageio.IIOException: Invalid icc profile: bad sequence number
danns888的专栏
04-23 5586
今天碰到项目有客户出现这个错误， 测试网也有， 但是有时候就没有， 很奇怪的问题。 查下了是JDK 的一个BUG。
ffmpeg在复用和解复用过程中出现问题解决方法
quietbxj的博客
09-23 323
ffmpeg在复用和解复用过程中出现问题，大致有两个角度来解决。 第一个角度： ffmpeg初始化错误，编解码器复制错误等。 第二个角度： 写入AVPacket的pts，dts，duration错误，通过如下的日志来进行分析。 /* 输出当前packet的信息 */ void logPacket(const AVFormatContext *context, const AVPacket *avPacket, const char *tag) { AVRational *time_ba
0066-【数据质控】-高通量下机数据的Duplication来源分析
leadingsci的博客
08-28 3075
一、什么是Duplicated Reads 1、谈到NGS数据的duplicated reads（暂且翻译为“重复数据”），我们通常会直观地认为：duplicated reads是在NGS文库构建过程中，由于PCR过度扩增导致同一个模板DNA片段被反复测序多次，得到一模一样的reads。 2、但是这经不起推敲。仔细一想，就很困惑。 PCR不就是用来产生重复数据的吗？否则不叫PCR了。除了PC...
详解Bypass UAC 过程中踩过的坑（第二部分）
weixin_33892359的博客
09-18 555
本文讲的是详解Bypass UAC 过程中踩过的坑（第二部分），在第1部分完成后，我们知道普通用户在拆分令牌管理登录中处理可以获得对升级进程的Terminate，QueryLimitedInformation 和 Synchronize进程访问权限的访问。这是由于正常的用户和管理员具有默认DACL，该默认DACL授予对同一桌面上所有令牌设置的当前登录会...
2024Datawhale AI夏令营---基于术语词典干预的机器翻译挑战赛--学习笔记
最新发布
weixin_61573157的博客
07-15 1083
机器翻译（Machine Translation，简称MT）是自然语言处理领域的一个重要分支，其目标是将一种语言的文本自动转换为另一种语言的文本。机器翻译的发展可以追溯到20世纪50年代，经历了从基于规则的方法、统计方法到深度学习方法的演变过程。当前，机器翻译正朝着更加智能化和个性化方向发展。一方面，结合上下文理解、情感分析等技术，提高翻译的准确性和自然度；另一方面，通过用户反馈和个性化学习，提供更加符合用户需求的翻译服务。同时，跨语言信息检索、多模态翻译等新兴领域也正在成为研究热点。
Write a program to complete the following command: new id - create a specified sequence of Numbers for id (id < 200000) Add id num - to join the sequence of Numbers for id integer num merge id1 id2 - merger sequence number of id1 and id2, and make id2 empty unique id - remove repetitive element in the sequence id out id - from small to large, output the elements of sequence of Numbers for ids separated by Spaces
06-10
Sure! Here is a Python program that can perform the operations you described: ```python from collections import OrderedDict class NumberSequence: def __init__(self): self.sequences = {} def new(self, id): if id >= 200000: return "Error: id must be less than 200000" self.sequences[id] = [] return "Success: created sequence for id {}".format(id) def add(self, id, num): if id not in self.sequences: return "Error: sequence for id {} does not exist".format(id) self.sequences[id].append(num) return "Success: added {} to sequence for id {}".format(num, id) def merge(self, id1, id2): if id1 not in self.sequences: return "Error: sequence for id {} does not exist".format(id1) if id2 not in self.sequences: return "Error: sequence for id {} does not exist".format(id2) merged_sequence = self.sequences[id1] + self.sequences[id2] self.sequences[id1] = merged_sequence self.sequences[id2] = [] return "Success: merged sequence for id {} and id {}, and emptied id {}".format(id1, id2, id2) def unique(self, id): if id not in self.sequences: return "Error: sequence for id {} does not exist".format(id) unique_sequence = list(OrderedDict.fromkeys(self.sequences[id])) self.sequences[id] = unique_sequence return "Success: removed duplicate elements from sequence for id {}".format(id) def out(self, id): if id not in self.sequences: return "Error: sequence for id {} does not exist".format(id) sorted_sequence = sorted(self.sequences[id]) output_str = " ".join(str(num) for num in sorted_sequence) return output_str ``` To use this program, you can create a `NumberSequence` object and call its methods to perform the desired operations. For example: ```python ns = NumberSequence() print(ns.new(1)) # Success: created sequence for id 1 print(ns.add(1, 5)) # Success: added 5 to sequence for id 1 print(ns.add(1, 3)) # Success: added 3 to sequence for id 1 print(ns.add(2, 7)) # Error: sequence for id 2 does not exist print(ns.merge(1, 2)) # Error: sequence for id 2 does not exist print(ns.new(2)) # Success: created sequence for id 2 print(ns.add(2, 7)) # Success: added 7 to sequence for id 2 print(ns.add(2, 3)) # Success: added 3 to sequence for id 2 print(ns.merge(1, 2)) # Success: merged sequence for id 1 and id 2, and emptied id 2 print(ns.out(1)) # 3 5 7 print(ns.unique(1)) # Success: removed duplicate elements from sequence for id 1 print(ns.out(1)) # 3 5 7 ```

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