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“转录组分析中基因的GO富集分析这步有很多软件可以选择,这次我们来介绍下如何利用Cytoscape软件中的一个简单又好用的Bingo小插件完成富集的工作,Cytoscape其实是一个做网络图的软件,所以使用Bingo的这种方法特别之处就在于富集的结果是可以直接以网络图的形式呈现,类似于下图这种效果,区别于其他的软件大多只会给出一个富集结果的表格。
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操作步骤:
- Cytoscape下载及Bingo插件的安装
- Bingo内参数的设置
- 基因ID与GO注释的对应文件的准备
- 粘贴你的待富集的基因,Bingo~~~ 完事!
1. Cytoscape下载及安装Bingo
官网:https://cytoscape.org/,现在已经更新到3.8版本了,直接点击Download下载安装即可,过程就不再多说,没太大难度。