linux pbs 安装包,【Linux】单计算机安装PBS系统(Torque)与运维

0、写在前面:此文是我刚读开始读硕士时练习使用实验室集群调度系统pbs写下的文字,其实写的很粗糙,忽略了很多细节。后来发现网络上有很多朋友对pbs系统的安装和运维感兴趣,但是能找到的资料比较少。我个人参考的是实验室内部wiki网站上的详细教程,此次导出成pdf放在:

如果有朋友对pbs非常感兴趣,可以参考这个pdf文档。

yum install libtool-devel libxml2-devel openssl-devel gcc gcc-c++ boost-devel

2、cd命令进入解压后的文件夹torque-5.0.0-1_43d8f09a,切换为root用户,逐次运行下列四条命令:

./configure

make

sudo make install

make packages

最后一条命令会在文件夹内产生下面这些.sh脚本:

torque-package-clients-linux-x86_64.sh

torque-package-devel-linux-x86_64.sh

torque-package-doc-linux-x86_64.sh

torque-package-mom-linux-x86_64.sh

torque-package-server-linux-x86_64.sh

在本机安装脚本:

./torque-package-clients-linux-x86_64.sh --install

./torque-package-mom-linux-x86_64.sh --install

在目录即/tmp/torque-5.0.0-1_43d8f09a下执行:

cp contrib/init.d/pbs_server /etc/init.d/pbs_server

chkconfig--add pbs_server

cp contrib/init.d/pbs_server /etc/init.d/pbs_sched

chkconfig--add pbs_sched

cp contrib/init.d/pbs_server /etc/init.d/trqauthd

chkconfig--add trqauthd

本机即是管理节点也是计算节点:

cp ./contrib/init.d/pbs_mom /etc/init.d/chkconfig--add pbs_mom

service pbs_mom start

./torque.setup root

qterm-t quick

pbs_server

qstat-q

3、返回linux根目录:

cd /

进入路径:/var/spool/torque/server_priv/

创建nodes文件:

vi nodes

往里面写入内容:localhost.localdomain np=1

保存此文件,再reboot命令重启操作系统。

4、Torque主要是由三个主要部件组成:

(1)pbs_server:PBS服务守护进程,负责接收作业提交,位于服务节点上

(2)pbs_sched:PBS调度守护进程,负责调度作业,位于服务节点上

(3)pbs_mom:PBS守护进程, 负责监控本机并执行作业,位于所有计算节点上

在单计算机环境下,以上三者均运行在本机。

5、明白了4的意思之后就启动torque了:

pbs_server

pbs_sched

pbs_mom

trqauthd

6、启动服务后可以写个脚本run.sh测试一下:

#!/bin/sh

g++ -o test1 test1.cpp

sleep60./test1

可以在本地随便写一个c++代码test1.cpp,然后命令提交脚本至pbs:

qsub ./run.sh

再使用命令qstat查看:

qstat -a

b6e54eef8a3d4f370dc94550c0d13d77.png

7、pbs常用命令汇总:

qsub提交作业、qstat查看已投运作业的情况、qdel删除作业、pnodes查看计算节点资源;

交互模式提交作业,qsub -I;在交互模式中转发图形界面,适用于画图、有图形界面的软件,qsub -I -X;

查看作业运行的节点,qstat -n;查看系统作业队列划分情况(每个队列包含的节点、用户控制),qstat -Qf;

pbs作业脚本常用格式:

#PBS -N python_cos_work

#PBS-l nodes=1:ppn=2#PBS-l mem=2G

#PBS-l walltime=7200:00:00#PBS-q batch

#PBS-V

cd/home/tuzhuo/code/git/pycode/rs

python cos.py

pnodes命令查看系统资源,根据系统可用的CPU资源,为自己的作业合理申请资源。

tz@croplab, HZAU

2019/7/26

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