oracle prepare耗时,毫秒级检测!你见过带GPU加速的树莓派吗?

树莓派3B+英特尔神经计算棒进行高速目标检测转载请注明作者梦里茶

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NCS PiStar是一种美德。

Background

最近在做一个项目,要在树莓派上分析视频中的图片,检测目标,统计目标个数,这是一张样例图片:

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Cattle Counting

Motivation

当下效果最好的目标检测都是基于神经网络来做的,包括faster rcnn, ssd, yolo2等等,要在树莓派这种资源紧张的设备上运行检测模型,首先想到的就是用最轻量的MobileNet SSD,使用Tensorflow object detection api实现的MobileNet SSD虽然已经非常轻,但在树莓派上推导一张1280x720的图仍然需要2秒,有兴趣的同学可以参考这两个项目:

具体的操作在Tensorflow文档里都说的很清楚了,在树莓派上的操作也是一样的,有问题可以评论区讨论

Hardware

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Intel Movidius Neural Computing Stick

处理器Intel Movidius VPU支持框架TensorFlow, Caffe

连接方式USB 3.0 Type-A

尺寸USB stick (72.5mm X 27mm X 14mm)

工作温度0° - 40° C

x86_64 Ubuntu 16.04主机

Raspberry Pi 3B  Stretch desktop

Ubuntu 16.04 虚拟机

系统要求USB 2.0 以上 (推荐 USB 3.0)

1GB 内存

4GB 存储

实际上这不是一个GPU,而是一个专用计算芯片,但能起到类似GPU对神经网络运算的加速作用。

京东上搜名字可以买到,只要500元左右,想想一块GPU都要几千块钱,就会觉得很值了。

虽然目前NCSDK支持的框架包含Tensorflow和Caffe,但并不是支持所有的模型,目前已支持的模型列表可以在这里查到:https://github.com/movidius/ncsdk/releases

截止到2018年3月15日,NCSDK还没有支持Tensorflow版的MobileNet SSD(比如tf.cast这个操作还未被支持),所以我们需要用Caffe来训练模型,部署到树莓派上。

Environment

ncsdk的环境分为两部分,训练端和测试端。训练端通常是一个Ubuntu 带GPU主机,训练Caffe或TensorFlow模型,编译成NCS可以执行的graph;

测试端则面向ncs python mvnc api编程,可以运行在树莓派上raspbian stretch版本,也可以运行在训练端这种机器上。

训练端

安装

安装这个过程,说难不难,也就几行命令的事情,但也有很多坑

在训练端主机上,插入神经计算棒,然后:git clone https://github.com/movidius/ncsdkcd ncsdk

make install

其中,make install干的是这些事情:检查安装Tensorflow

检查安装Caffe(SSD-caffe)

编译安装ncsdk(不包含inference模块,只包含mvNCCompile相关模块,用来将Caffe或Tensorflow模型转成NCS graph的)

注意,这些库都是安装到/opt/movidius/这个目录下,并关联到系统python3里边的(/usr/bin/python3),如果你电脑里原来有tf或caffe,也不会被关联上去

NCSDK mvNCCompile模块目前只兼容python3,我尝试过将安装完的SDK改成兼容python2的版本,可以将模型编译出来,但是在运行时会报错,所以暂时放弃兼容python2了,也建议大家用默认的python3版本

这个步骤主要的坑来自万恶的Caffe,如果你装过python3版的caffe,大概会有经验一些,这里有几个小坑提示一下:最好在ncsdk目录中的ncsdk.conf中,开启caffe的cuda支持,即设置CAFFE_USE_CUDA=yes,这样你之后也能用这个caffe来训练模型

caffe的依赖会在脚本中安装,但有些Debian兼容问题要解决

开启CUDA支持后,编译caffe会找不到libboost-python3,因为在Ubuntu16.04里,它叫libboost-python3.5,所以要软链接一下:cd /usr/lib/x86_64-linux-gnu/

sudo ln -s libboost_python-py35.so libboost_python3.so其他可能出现的caffe的坑,可以在我博客找找答案,如果没有的话,就去caffe的GitHub issue搜吧

测试

一波操作之后,我们装好了ncsdk编译模块,可以下载我训练的caffe模型,尝试编译成ncs graphgit clone https://github.com/ahangchen/MobileNetSSD

mvNCCompile example/MobileNetSSD_deploy.prototxt -w MobileNetSSD_deploy.caffemodel -s 12 -is 300 300 -o ncs_mobilenet_ssd_graph

这里其实是调用python3去执行/usr/local/bin/ncsdk/mvNCCompile.py这个文件, 不出意外在当前版本(1.12.00)你会遇到这个错误:[Error 17] Toolkit Error: Internal Error: Could not build graph. Missing link: conv11_mbox_conf

这是因为NCSDK在处理caffe模型的时候,会把conv11_mbox_conf_new节点叫做conv11_mbox_conf,所以build graph的时候就会找不着。因此需要为这种节点起一个别名,即,将conv11_mbox_conf_new起别名为conv11_mbox_conf,修改SDK代码中的/usr/local/bin/ncsdk/Models/NetworkStage.py,在第85行后面添加:if ''_new' in name:

self.alias.append(name[:-4])

于是就能编译生成graph了,你会看到一个名为ncs_mobilenet_ssd_graph的文件。

上边这个bug我已经跟NCSDK的工程师讲了,他们在跟进修这个bug:

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NCS bug

测试端

NCSDK

测试端要安装ncsdk python api,用于inference,实际上测试端能做的操作,训练端也都能做git clone https://github.com/movidius/ncsdkcd api/src

make install

从输出日志可以发现,将ncsdk的lib和include文件分别和系统的python2(/usr/bin/python2)和python3(/usr/bin/python3)做了关联。

然后你可以下一个GitHub工程来跑一些测试:git clone https://github.com/movidius/ncappzoocd ncappzoo/apps/hello_ncs_py

python3 hello_ncs.py

python2 hello_ncs.py

没报错就是装好了,测试端很简单。

OpenCV

看pyimagesearch这个教程

Caffe模型训练

就是正常的用caffe训练MobileNet-SSD,主要参考这个仓库:

README里将步骤讲得很清楚了下载SSD-caffe(这个我们已经在NCSDK里装了)

下载chuanqi在VOC0712上预训练的模型

把MobileNet-SSD这个项目放到SSD-Caffe的examples目录下,这一步可以不做,但是要对应修改train.sh里的caffe目录位置

创建你自己的labelmap.prototxt,放到MobileNet-SSD目录下,比如说,你是在coco预训练模型上训练的话,可以把coco的标签文件复制过来,将其中与你的目标类(比如我的目标类是Cattle)相近的类(比如Coco中是Cow)改成对应的名字,并用它的label作为你的目标类的label。(比如我用21这个类代表Cattle)

用你自己的数据训练MobileNet-SSD,参考SSD-caffe的wiki,主要思路还是把你的数据转换成类似VOC或者COCO的格式,然后生成lmdb,坑也挺多的:假设你的打的标签是这样一个文件raw_label.txt,假装我们数据集只有两张图片:data/strange_animal/1017.jpg 0.487500   0.320675    0.670000    0.433193

data/strange_animal/1018.jpg 0.215000   0.293952    0.617500    0.481013我们的目标是将标签中涉及的图片和位置信息转成这样一个目录(在ssd-caffe/data/coco目录基础上生成的):coco_cattle├── all # 存放全部图片和xml标签文件

│   ├── 1017.jpg│   ├── 1017.xml│   ├── 1018.jpg│   └── 1018.xml├── Annotations # 存放全部标签xml│   ├── 1017.xml│   └── 1018.xml├── create_data.sh # 将图片转为lmdb的脚本

├── create_list.py # 根据ImageSets里的数据集划分文件,生成jpg和xml的对应关系文件到coco_cattle目录下,但我发现这个对应关系文件用不上

├── images  # 存放全部图片

│   ├── 1017.jpg│   └── 1018.jpg├── ImageSets # 划分训练集,验证集和测试集等,如果只想分训练和验证的话,可以把minival.txt,testdev.txt,test.txt内容改成一样的

│   ├── minival.txt │   ├── testdev.txt│   ├── test.txt│   └── train.txt├── labelmap_coco.prototxt # 如前所述的标签文件,改一下可以放到MobileNet-SSD目录下

├── labels.txt├── lmdb # 手动创建这个目录

│   ├── coco_cattle_minival_lmdb # 自动创建的,由图片和标签转换来的LMDB文件

│   ├── coco_cattle_testdev_lmdb│   ├── coco_cattle_test_lmdb│   └── coco_cattle_train_lmdb├── minival.log├── README.md├── testdev.log├── test.log└── train.log其中,标签xml的格式如下:

train

86

coco_cattle

720

1280

3

0

21

Unspecified

0

0

169

388

372

559

21

Unspecified

0

0

169

388

372

559

代表一张图中多个对象所在位置(bndbox节点表示),以及类别(name)。一开始,all, Annotations, images, ImageSets,lmdb四个目录都是空的,你可以把自己的图片放到随便哪个地方,只要在raw_label.txt里写好图片路径就行

读取raw_label.txt,利用lxml构造一棵dom tree,然后写到Annotations对应的xml里,并将对应的图片移动到image目录里,可以参考这份代码。并根据我们设置的train or not标志符将当前这张图片分配到训练集或测试集中(也就是往ImageSet/train.txt中写对应的图片名)

这样一波操作之后,我们的images和Annotations目录里都会有数据了,接下来我们需要把它们一块复制到all目录下cp images/* all/

cp Annotations/* all/然后用create_data.sh将all中的数据,根据ImageSet中的数据集划分,创建训练集和测试集的lmdb,这里对coco的create_data.sh做了一点修改:cur_dir=$(cd $( dirname ${BASH_SOURCE[0]} ) && pwd )

root_dir=$cur_dir/../..cd $root_dirredo=true# 这里改成all目录data_root_dir="$cur_dir/all"# 这里改成自己的数据集名,也是我们这个目录的名字dataset_name="coco_cattle"# 指定标签文件mapfile="$root_dir/data/$dataset_name/labelmap_coco.prototxt"anno_type="detection"label_type="xml"db="lmdb"min_dim=0

max_dim=0

width=0

height=0

extra_cmd="--encode-type=jpg --encoded"if $redothen

extra_cmd="$extra_cmd --redo"fifor subset in minival testdev train testdo

python3 $root_dir/scripts/create_annoset.py --anno-type=$anno_type --label-type=$label_type --label-map-file=$mapfile --min-dim=$min_dim --max-dim=$max_dim --resize-width=$width --resize-height=$height --check-label $extra_cmd $data_root_dir $root_dir/data/$dataset_name/ImageSets/$subset.txt $data_root_dir/../$db/$dataset_name"_"$subset"_"$db examples/$dataset_name 2>&1 | tee $root_dir/data/$dataset_name/$subset.logdone

于是会lmdb目录下会为每个划分集合创建一个目录,存放数据├── lmdb│   ├── coco_cattle_minival_lmdb│   │   ├── data.mdb│   │   └── lock.mdb│   ├── coco_cattle_testdev_lmdb│   │   ├── data.mdb│   │   └── lock.mdb│   ├── coco_cattle_test_lmdb│   │   ├── data.mdb│   │   └── lock.mdb│   └── coco_cattle_train_lmdb│       ├── data.mdb│       └── lock.mdb将5生成的lmdb链接到MobileNet-SSD的目录下:cd MobileNet-SSD

ln -s PATH_TO_YOUR_TRAIN_LMDB trainval_lmdb

ln -s PATH_TO_YOUR_TEST_LMDB test_lmdb运行gen_model.sh生成三个prototxt(train, test, deploy)# 默认clone下来的目录是没有example这个目录的,而gen_model.sh又会把文件生成到example目录mkdir example

./gen_model.sh训练./train.sh

这里如果爆显存了,可以到example/MobileNetSSD_train.prototxt修改batch size,假如你batch size改到20,刚好可以吃满GTX1060的6G显存,但是跑到一定步数(设置在solver_test.prototxt里的test_interval变量),会执行另一个小batch的test(这个batch size定义在example/MobileNetSSD_test.prototxt里),这样就会再爆显存,所以如果你的train_batch_size + test_batch_size <= 20的话才可以保证你在6G显存上能顺利完成训练,我的设置是train_batch_size=16, test_batch_size=4

一开始的training loss可能比较大,30左右,等到loss下降到2.x一段时间就可以ctrl+c退出训练了,模型权重会自动保存在snapshot目录下运行merge_bn.py将训练得到的模型去除bn层,得到可部署的Caffe模型,这样你就能得到一个名为MobileNetSSD_deploy.caffemodel的权重文件,对应的prototxt为example/MobileNetSSD_deploy.prototxt

离题那么久,终于来到主题,我们要把这个caffemodel编译成NCS可运行的graph,这个操作之前在搭环境的部分也提过:mvNCCompile example/MobileNetSSD_deploy.prototxt -w MobileNetSSD_deploy.caffemodel -s 12 -is 300 300 -o ncs_mobilenet_ssd_graph

参数格式:mvNCCompile prototxt路径 -w 权重文件路径 -s 最大支持的NCS数目 -is 输入图片宽度 输入图片高度 -o 输出graph路径

其实训练端相对于chuanqi的MobileNet-SSD没啥改动,甚至训练参数也不用怎么改动,主要工作还是在数据预处理上,可以参考我的预处理代码

树莓派NCS模型测试

现在我们要用ncs版的ssd模型在树莓派上进行对图片做检测,这个目标一旦达成我们自然也能对视频或摄像头数据进行检测了。

仓库结构ncs_detection├── data # 标签文件

│   └── mscoco_label_map.pbtxt├── file_helper.py # 文件操作辅助函数

├── model # 训练好的模型放在这里

│   ├── ncs_mobilenet_ssd_graph│   └── README.md├── ncs_detection.py # 主入口

├── object_detection # 改了一下TF的Object detection包中的工具类来用

│   ├── __init__.py│   ├── protos│   │   ├── __init__.py│   │   ├── string_int_label_map_pb2.py│   │   └── string_int_label_map.proto│   └── utils│       ├── __init__.py│       ├── label_map_util.py│       └── visualization_utils.py├── r10 # 图片数据

│   ├── 00000120.jpg│   ├── 00000133.jpg│   ├── 00000160.jpg│   ├── 00000172.jpg│   ├── 00000192.jpg│   ├── 00000204.jpg│   ├── 00000220.jpg│   └── 00000236.jpg├── README.md└── total_cnt.txt由于这个工程一开始是用Tensorflow Object Detection API做的,所以改了其中的几个文件来读标签和画检测框,将其中跟tf相关的代码去掉。

TF的图片IO是用pillow做的,在树莓派上速度奇慢,对一张1280x720的图使用Image的get_data这个函数获取数据需要7秒,所以我改成了OpenCV来做IO。

任务目标

检测r10目录中的图片中的对象,标记出来,存到r10_tmp目录里

流程准备目标目录def config_init(dataset_pref):

os.system('mkdir %s_tmp' % dataset_pref)

os.system('rm %s_tmp/*' % dataset_pref)指定模型路径,标签位置,类别总数,测试图片路径PATH_TO_CKPT = 'model/ncs_mobilenet_ssd_graph'PATH_TO_LABELS = os.path.join('data', 'mscoco_label_map.pbtxt')

NUM_CLASSES = 81TEST_IMAGE_PATHS = [os.path.join(img_dir, '%08d.jpg' % i) for i in range(start_index, end_index)]发现并尝试打开神经计算棒def ncs_prepare():

print("[INFO] finding NCS devices...")

devices = mvnc.EnumerateDevices()    if len(devices) == 0:

print("[INFO] No devices found. Please plug in a NCS")

quit()

print("[INFO] found {} devices. device0 will be used. "

"opening device0...".format(len(devices)))

device = mvnc.Device(devices[0])

device.OpenDevice()    return device将NCS模型加载到NCS中def graph_prepare(PATH_TO_CKPT, device):

print("[INFO] loading the graph file into RPi memory...")    with open(PATH_TO_CKPT, mode="rb") as f:

graph_in_memory = f.read()    # load the graph into the NCS

print("[INFO] allocating the graph on the NCS...")

detection_graph = device.AllocateGraph(graph_in_memory)    return detection_graph准备好标签与类名对应关系category_index = label_prepare(PATH_TO_LABELS, NUM_CLASSES)读取图片,由于Caffe训练图片采用的通道顺序是RGB,而OpenCV模型通道顺序是BGR,需要转换一下image_np = cv2.imread(image_path)

image_np = cv2.cvtColor(image_np, cv2.COLOR_BGR2RGB)使用NCS模型为输入图片推断目标位置def predict(image, graph):

image = preprocess_image(image)

graph.LoadTensor(image, None)

(output, _) = graph.GetResult()

num_valid_boxes = output[0]

predictions = []    for box_index in range(num_valid_boxes):

base_index = 7 + box_index * 7

if (not np.isfinite(output[base_index]) or

not np.isfinite(output[base_index + 1]) or

not np.isfinite(output[base_index + 2]) or

not np.isfinite(output[base_index + 3]) or

not np.isfinite(output[base_index + 4]) or

not np.isfinite(output[base_index + 5]) or

not np.isfinite(output[base_index + 6])):            continue

(h, w) = image.shape[:2]

x1 = max(0, output[base_index + 3])

y1 = max(0, output[base_index + 4])

x2 = min(w, output[base_index + 5])

y2 = min(h, output[base_index + 6])

pred_class = int(output[base_index + 1]) + 1

pred_conf = output[base_index + 2]

pred_boxpts = (y1, x1, y2, x2)

prediction = (pred_class, pred_conf, pred_boxpts)

predictions.append(prediction)    return predictions

其中,首先将图片处理为Caffe输入格式,缩放到300x300,减均值,缩放到0-1范围,转浮点数def preprocess_image(input_image):

PREPROCESS_DIMS = (300, 300)

preprocessed = cv2.resize(input_image, PREPROCESS_DIMS)

preprocessed = preprocessed - 127.5

preprocessed = preprocessed * 0.007843

preprocessed = preprocessed.astype(np.float16)    return preprocessed

graph推断得到目标位置,类别,分数graph.LoadTensor(image, None)

(output, _) = graph.GetResult()

其中的output格式为,[

目标数量,

class,score,xmin, ymin, xmax, ymax,

class,score,xmin, ymin, xmax, ymax,

...

]根据我们感兴趣的类别和分数进行过滤def predict_filter(predictions, score_thresh):

num = 0

boxes = list()

scores = list()

classes = list()    for (i, pred) in enumerate(predictions):

(cl, score, box) = pred        if cl == 21 or cl == 45 or cl == 19 or cl == 76 or cl == 546 or cl == 32:            if score > score_thresh:

boxes.append(box)

scores.append(score)

classes.append(cl)

num += 1

return num, boxes, classes, scores用OpenCV将当前图片的对象数量写到图片右上角,用pillow(tf库中的实现)将当前图片的对象位置和类别在图中标出def add_str_on_img(image, total_cnt):

cv2.putText(image, '%d' % total_cnt, (image.shape[1] - 100, 50), cv2.FONT_HERSHEY_SIMPLEX, 1, (0, 255, 0), 2)result = vis_util.visualize_boxes_and_labels_on_image_array(

image_np,

np.squeeze(valid_boxes).reshape(num, 4),

np.squeeze(valid_classes).astype(np.int32).reshape(num, ),

np.squeeze(valid_scores).reshape(num, ),

category_index,

use_normalized_coordinates=True,

min_score_thresh=score_thresh,

line_thickness=8)保存图片cv2.imwrite('%s_tmp/%s' % (dataset_pref, image_path.split('/')[-1]),

cv2.cvtColor(result, cv2.COLOR_RGB2BGR))释放神经计算棒def ncs_clean(detection_graph, device):

detection_graph.DeallocateGraph()

device.CloseDevice()

运行

python2 ncs_detection.py

结果框架图片数量/张耗时TensorFlow180060min

NCS180010min

TensorFlow12sec

NCS10.3sec

性能提升6倍!单张图300毫秒,可以说是毫秒级检测了。在论坛上有霓虹国的同行尝试后,甚至评价其为“超爆速”。

扩展

单根NCS一次只能运行一个模型,但是我们可以用多根NCS,多线程做检测,达到更高的速度,具体可以看Reference第二条。

Reference

看了这么久,还不快去给我的GitHub点star!

作者:梦里茶

链接:https://www.jianshu.com/p/3e9862a55e43

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