linux集群中mpi的并行计算环境简单配置,linux集群中MPI的并行计算环境简单配置...

MPI有多种实现版本，如MPICH， CHIMP以及OPENMPI。其中MPICH是一种最重要的MPI实现，它可以从网上免费获得Linux和Windows版本。它的开发和MPI规范的制定是同步的，因此最能反映MPI的变化和发展，MPICH由此成为实现MPI的最成熟和最广泛使用的版本。本文安装的MPI软版本为MPICH-1.2.6。

安装步骤：

1、从网上下载MPICH压缩包(mpich.tar.gz)

2、解压：# tar zxvf mpich.tar.gz

3、进入解压后的目录： # cd mpich-1.2.6

4、配置： # ./configure –prefix=/usr/local/mpich

其中/usr/local/mpich为软件所安装的目录

5、编译 # make

6、安装 # make install

7、配置该软件的用户搜索路径

Root 用户下：修改/etc/profile 加入

PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin

MANPATH=$MANPATH:/usr/local/mpich/man

Export PATH MANPATH

普通用户下：修改~/.bash_profile 加入

export PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin

8、修改/usr/local/mpich/share/machines.LINUX文件，加入集群中可以用来做并行计算的主机名(八节点集群为例)

加入的内容为：

Local:4

Node11:4

Node22:4

(注：冒号后为节点的CPU数或者内核数)

9、MPI环境的简单测试

在服务器节点上，以mpich 自带的计算PI值的并行计算程序cpi对所搭建的集群环境做简单的测试。

步骤：

在/usr/local/mpich/example目录下

(1) 编译 # make cpi

(2) 启动并行计算 # mpirun –np N cpi (其中N 为节点机的个数)

可以看到PI值及误差和计算时间，说明环境搭建基本成功。至此，所组建的MPI集群基本成。