linux 如何运行r脚本,从linux shell脚本调用Rscript

以下似乎适用于我的Ubuntu机器：

#!/bin/bash

setsid Rscript example.R > logfile.txt &

tail -f logfile.txt

以下是将SIGINT发送到wrapper.sh之前的一些相关过程：

5361 pts/10 00:00:00 bash

6994 ? 00:00:02 update-notifier

8519 pts/4 00:00:00 wrapper.sh

8520 ? 00:00:00 R

8521 pts/4 00:00:00 tail

在Ctrl C之后,您可以看到R仍然在运行,但是wrapper.sh和tail已被杀死：

5361 pts/10 00:00:00 bash

6994 ? 00:00:02 update-notifier

8520 ? 00:00:00 R

虽然附上你的Rscript […]命令&将它发送到后台,它仍然是同一个进程组的一部分,因此也接收SIGINT.

我不确定这是不是你的意图,但是因为你正在调用tail -f,如果没有用Ctrl c中断,运行wrapper.sh的shell即使在R进程完成后也会继续挂起.如果你想避免这种情况,以下应该可行,

#!/bin/bash

setsid Rscript example.R > logfile.txt &

tail --pid="$!" -f logfile.txt

“$！”是执行的最后一个后台进程的进程ID(Rscript […]调用).