前言
在光谱方法中,最有名和应用最广泛的手性分子光学性质为旋光(OR)和圆二色谱(circular dichroism,CD)。 组成平面偏振光的左旋和右旋圆偏光在通过手性介质时吸收系数不同(εR≠εL),吸收系数之差∆ε随波长变化即可获得圆二色谱(CD)。对映异构体的CD谱图呈现正负相反。传统的圆二色谱是指波长在200~400 nm之间的吸收谱,20世纪70年代,由于“八区律”、“激子手性法”等方法的发现和发展,圆二色谱得到了广泛应用。
然而传统的圆二色谱要求手性分子必须有紫外吸收,这一点成为限制其应用的重大问题。由此人们提出:如何在红外光区频率下测定圆二色谱? 20世纪70年代,Holzwart,Nafie和Stephens等先后成功测定了红外光区频率下的圆二色谱,即振动圆二色谱(vibrational circular dichroism, VCD)。此后,随着傅立叶变换红外光谱等新技术的发展,VCD的测量范围逐渐扩大为4000~750 cm−1 ,测量精度不断提高,信噪比不断升高。
本文以α-pinene为例,演示VCD的计算,并与实验结果对比,参考文献:Theor Chem Account (2008) 119:245–263。
计算过程的输入、输出文件下载(请点击)
计算参数设置
创建分子模型、结构优化(得到和真实情况最接近的分子结构)的过程此处略过,详细教程参考:建模:ADF模块分子的基本建模功能演示(视频下载)、建模:创建1000原子左右的球形团簇、如何优化分子的几何结构、如何有效地对大分子进行结构优化、如何进行限制性结构优化,以及ADF知识库中其他操作教程。并参考下载的文件。
这里演示VCD的计算过程的参数设置。分子结构采用结构优化之后得到的分子结构,参数设置如下:
点击File > Save as保存任务,并运行,提交任务的方式,参考:下载、安装、提交作业、版本升级安装[目录]
结果查看
点击ADFinput窗口左上角的SCM LOGO > Spectra,弹出谱图(实际上包含多种谱图)窗口,点击该窗口的Spectra > VCD,即显示谱图如下:
调整横坐标范围,与文献一致之后:
主要的峰的位置和强度与文献的结果符合的很好:
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