不少科研工作者,包括在读的博士生、硕士生等可能都有这样的体会:千辛万苦得来的实验结果,不知道该如何展现给别人?
曾经有位论文审稿人在自己的博文中就写道:「我审稿时看稿件的顺序是题目、摘要、图表、前言、参考文献和正文」。可见论文中图片的质量是非常重要的,处理一张图可能会花费大量的时间,图片质量的好坏一定程度上决定了论文能否被录用。
而反过来,仔细分析大牛们的文章,不难发现,这些高水平论文的图表质量也高人一筹。那么,这些高颜值的 SCI 论文配图是如何来的?有什么秘籍吗?这里,特别汇总了 SCI 论文配图过程中可能遇到的各种需求。
SCI 论文之作图四大原则
原则一:分辨率
多数期刊对不一样的图也会有不一样的要求,一般来说有三种要求:1. line artwork(纯纯的黑白图,没有中间颜色)。是要求最高的,1200dpi 以上。
2. combiantion artwork(halftone artwork 与 line artwork 的组合,或彩色图与 line artwork 的组合)。属于中间档,600dpi 以上。3. halftone artwork(颜色深浅有差别的灰度图,也就是我们最常用的形式)。要求最低,300dpi 以上就 OK 了;大家可以从实验阶段就留心保存高分辨率的原始图,一般来说 600dpi 就完全够用了(line artwork 是极少数的情况,特殊对待),当然也不能一味追求高分辨率,分辨率太高会导致图片很大,投稿时上传容易出现困难。
原则二:图片格式多数期刊要求图片为 TIFF 格式或 EPS 矢量图,并且要形成独立文件。好多同学就会冒出来说:「我好钟意 bmp 或者 jpg 的。」绝不能纵容这类习惯的养成,因为这两种格式包含的信息量相对较少,即便是可以转换为 TIFF,质量也会因此而下降(部分图像信息也会丢失哦)。
原则三:物理大小
关于这方面要强调:这是不容忽视的。虽然在投稿阶段并没有做出严格的要求,可在印刷排版时就会变得格外讲究起来。但是大家也不要过于担心,一般情况只会规定一下宽度,半幅(单栏)在 7.5cm 左右,全幅(双栏)在 15cm 左右,不同期刊的要求会略有差异。
原则四:色彩要求 - 仅针对彩色图
关于这个问题大家很少会注意,一般情况分为 2 种:RGB 用于数码设备上;CMYK 为印刷业通用标准,这两种对图片色彩的要求也是不尽相同的,多数期刊在 Manuscripts Accepted for Publication 阶段会要求图片为 CMYK 色彩。
但现在很多期刊都是有网络版的,且 RGB 图比 CMYK 图表现出的效果好,色彩亮丽,更适合出现在网络上。而由 RGB 转变为 CMYK 模式容易,但是由 CMYK 模式转变为 RGB 模式,图象的表现力却会下降。所以有些期刊开始要求提供 RGB 的图。建议大家平时也留心保存 RGB 的图,不管是为了发表论文还是制作 PPT 报告,RGB 的图都要更加合适哦。简单总结一下:会议文章对图片质量的要求比较低,一般投了后基本都没有修改的机会,而杂志文章对图片质量的要求相当高,可能来回改几次才能满足要求。如果论文投稿前就达到了较高的质量,相信修改时会轻松很多。复制与粘贴的小技巧图片:如果图片的来源是 origin、visio、autocad 等软件,且图片以后不需要再次修改,建议粘贴时采用 「选择性粘贴」,选择 「windows 图元文件」 或 「增强型图元文件」;文字:如果文字的来源是网络、pdf 文件或者其他文档(格式不同),建议粘贴时采用 「无文本格式」 粘贴。作图软件的利器
1.EXCEL
这个不用多说,小伙伴们都比较熟悉,不少小伙伴也习惯用 excel 来整理数据。不过需要注意的是,excel 虽然在处理图表时功能强大,在作数据图方面,也毫不逊色,但是,它生成的图,分辨率有限。
一般小文章要求不高(300dpi)没问题,但是一些要求严格的期刊,如 1200dpi,它就无能为力了。而且,图片的导出只能通过复制、截图或者用 VBA,前两者分辨率可能不满足要求,后者要装 VBA,操作也非常麻烦。此外,有些特殊的图,excel 也显得有心无力,比如纵坐标分段,又比如临床研究中的生存曲线。
2.Origin 和 Originpro
这两个都是 OriginLab 公司研发的专业制图和数据分析软件,简单易学、功能齐全、操作也很灵活,大部分科学研究的统计、作图、函数拟合等要求都可以满足,尤其适合曲线、曲面的图。
它还提供了几十种二维和三维绘图模板,而且允许用户自己定制模板。Originpro 是 Origin 的专业版,增加了峰值拟合、表明拟合、统计、信号处理等功能。生成的图片可以很方便地导出为 TIFF/bmp/eps 等十多种格式。
3.Prism
一个简单易用的医学绘图软件,功能非常强大,几乎能搞定所有医学研究所需的统计与作图。除了作图之外,它还能帮你把不同的图组合之后导出。
4.Statistical Product and Service Solutions(SPSS)
SPSS 是世界上最早的统计分析软件,它的主打功能是数据统计分析(据说在国际学术界有条不成文的规定,即在国际学术交流中,凡是用 SPSS 软件完成的计算和统计分析,可以不必说明算法,由此可见其影响之大和信誉之高),但是它的作图功能也算齐全,而且很多 excel 无法做的统计型结果图(如误差线图),在它这里就轻而易举。
5.MATLAB
这个绝对是灰机中的战斗机。其强大的数据处理能力加上出色的显示能力,几乎能做所有的图片处理,传说只有你想不到,没有它做不到!但是使用它首先得学会 MATLAB 的编程。
6. 图片的导出
上面提到的软件,除了 excel 外,本身都有强大的图片导出功能。而事实上,我们除了数据统计作图后需要导出图外,还有一些图片,是实验过程中拍摄的照片,如荧光显微镜拍的显微照片。
一般这些仪器配套的拍摄软件都会有比较齐全的图片导出功能。但是有些小伙伴觉得截图更方便,又不想损失分辨率。这里给大家推荐两款截图软件:ACDsee、Snagit。这两款操作简便,功能也非常强大,Snagit 甚至可以捕获活动的画面。
共聚焦图片处理
1. 拍照时要保留大中小三个倍数的图,且图片分辨率不能太低(我们用 1024*1024),能大则大,我们是因为机器限制。用的时候要进行裁减,比如文章上放的是 200 倍和 400 倍的图,实际上 200 倍的图来自拍照时 100 倍的图,400 倍的图来自拍照时 200 倍的图。这样有利于准确地形成系列图片。2. 图片对比度、中间色之类可以(或者是必须)在保证趋势的基础上进行适当调整。 3. 荧光图片不提倡定量,定量要配合 western。4. 应该是 tif 格式。5. 拍照时一般不要把对比度调节得太大,尽量保存细节。拍的太强了后期是不好调弱的,或者背底太暗了也会丢失细节的。这些后期都可以通过软件调节。6. 低倍 - 高倍的顺序。反之会形成暗区,特别是在高倍加 zoom 放大层扫之后特别明显。这是教训,不能看见高倍下面比较好的结果,就欣喜若狂,先高倍后低倍。7. 一定要保留你的 oib 格式,不能因为省空间,只存留 tif 格式。有些杂志会要求伪色,比如,红色的用粉色显示,要是有 oib 格式就很好调整,重新出图就是。没有 oib,用其他软件转换也可以。
8. 层扫的图片叠加或出 2D 的 tif 图,建议不要用 「输出所见」 这个选项,这样出来的 1024-1024 的会变成 512-512,这时候还是选择一般 tif,1024-1024,后期再用其他软件合成会比较好。9. 结果好,拍照好,才是最基本的,一定要杜绝对结果的修改。
对于形态学的图片来说,用一些二进制的软件打开后可以明显看出修改过程。除了上述的一些基本技巧之外,我们还为各位准备了进阶版的科研论文配图软件和技巧!
一篇好的文章往往是图文并茂的,有时一张清晰、直观、正确的图片会让文章显得更加优美、舒服、更有说服力,远远胜过一大段文字描述,这也是 CNS 的标配。
下图是 Cell 的一篇文章中的信号通路图,是不是顿时心生崇拜之情,要是也能做出如此高大上的图片,投稿的文章岂不是就离 CNS 这些高端杂志更近一步了呢?
![87b4917603174601e4f10865dbcd58b6.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/7b808156967b39b04fb221afe3922498.jpeg)
看到如此精美的图片,绝大多数科研狗恐怕在心中膜拜感叹的同时,也在想这肯定是用专业的画图软件(如 photoshop、AI)做出来吧?我等凡人怕是做不到吧?NO! 我们给大家推荐四款作图神器,让你分分钟搞定高逼格的信号通路图、各种模型图、流程图。
Scienceslide
首先第一个就是 Scienceslide,这是一款专门做医学图片的 ppt 插件。
安装后,会在 PPT 界面出现一个工作条(如下图所示),包括了常用元件、信号通路、方法学、生物化学、分子生物学等几千种素材。
它做出来的信号通路图可以是这样的:
![9f9793061bb69c4d533375451237be43.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/cca37f57a45b61cfc9dbeced7c36d415.jpeg)
想要什么图,只需要选择相应的模板,就可以在此基础上进行文字及分子形状的修改,而后可以做成精致无比、赏心悦目的示意图。有了这个 PPT 插件,足以满足你对任何信号通路图的要求。Pathwaytool
另一个软件 pathwaytool,也是一款作图神器哦。它几乎自带了分子生物学会用到的所有元素,如不同的细胞、细胞器、分子、老鼠模型、器官模型以及经典的信号通路图。安装该软件后,它的界面是这样的:
![5220065d1c149851bdf9b3ace0d220de.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/0e07eafd983564cea9c5c68c33a146ab.jpeg)
在选择一个理想的模型后,可直接进行修饰和改动,非常简单方便,3 分钟内即能上手,做出来的通路图是这样的!
![584fce6142d27f4cd2d81b480ecba3ff.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/9012ae416e847509e612778949fbdd8f.jpeg)
GraphPad Prism
GraphPad Prism 是一款非常棒的医学绘图软件,他基于生物统计,曲线拟合和科学绘图于一体,可以制作出非常专业的医学表,如果你是医学相关专业的人士,一定不要错过!
![cdfc0c109c7356ae2f3b45e967df7d7b.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/3a16a35ae1d6cf552176f1b7139168af.jpeg)
SmartDraw 2013
看到下面的数据图,是不是顿时感觉文章的质量上了一个档次呢?
![641234d742962f57f89e8a0496e08b22.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/cc952290ee0ee897584ca60d9bb3baf9.png)
SmartDraw 2013 是一款非常专业的绘图软件,可以用来快速建立流程图、组织图、柱形统计图和馅饼图、表格和其他更多图表。在绘图、图表制作领域,SmartDraw 绝对是行业的佼佼者,它的出现让图表制作变得如此简单。
SmartDraw 2013 最大的特点就是支持多种图形,采用模板的方式在线扩充,它可以预测你的需求,从而给你预先制定模板,自动设计,并且可以很容易地快速把你的信息变成鲜明的插图。