HED 代码调试 ＆ modified caffe编译

重新编译之前的笔记，后悔之前没有好好记下来

72   INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial/

73   LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial

strings /usr/local/MATLAB/R2016b/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 | grep GLIBC

重新编译过程（18.6.1上午）：

为了解决/matlab/demo文件夹中classification_demo一跑matlab就崩的问题，加上第一次编译caffe,pycaffe,matcaffe虽然算是成功了但是还有很多不明白的东西，而且我做的项目本身是matlab写的，所以想弄好matcaffe接口，所以一激动就make clean了。这下好了，本来python下可以跑hed的例子了，做项目够用了，一脑残什么都没有了，又忙活了一晚上加一上午，而最后的结果是一开始的classification_demo问题还没有解决！！！放弃了,耗不起了。

为了修改环境变量，给/etc/profile的末尾，添加了下面两句话，结果可能就是这个原因，显卡驱动又崩掉了，循环登录进不去ubuntu系统，又重装了显卡驱动，因祸得福，自己熟悉了一下安装显卡驱动。以后不能瞎改profile了。

exportLD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_imgproc.so.2.4:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_core.so.2.4:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfreetype.so.6:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/

１重新编译的好处，安装caffe前需要的依赖都不用重新安装了。

２总的来说，根据官方提示和不记得哪儿的提示，在一个全新的hed-master下载下来之后，根据多种需要，最好补充以下一些文件。

/hed-master：models文件夹

/hed-master/models/bvlc_reference_caffenet：bvlc_reference_caffenet.caffemodel模型文件

/home/minmin/视频/hed-master/examples/hed：5stage-vgg.caffemodel、　hed_pretrained_bsds.caffemodel两个模型文件

/home/minmin/视频/hed-master/examples：images文件夹

３接下来很重要的一部分是对　Makefile.config 和　Makefile 所做的修改

既然是重新编译，肯定Makefile.config已经有了，之前就是从Makefile.config.example复制出来的

对Makefile.config做的修改：

3.1 line23   去掉　-gencode arch=compute_20,code=sm_20 　　-gencode arch=compute_20,code=sm_21

　　必要性：０

　　目的：避免编译时nvcc烦人的warning

3.2 line47 添加matlab路径：MATLAB_DIR := /usr/local/MATLAB/R2016b

　　必要性：１

3.3 添加hdf5路径

　　line72 INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial/

         line73 LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial

         必要性：１

3.4 由于自定义安装了opencv－2.4.13，安装过程找不到opencv的库，需要以下操作（我的opencv安装位置/home/minmin/opencv-2.4.13）

　　line81 取消注释。应该是让程序能找到自定义安装的lib，小白不太懂，强行按照自己的理解解释

　　这是个大坑，基本上第二次编译就是在解决这个问题，然而一开始并没有查到是opencv的问题。主目录下make all,总是报错，基本上是带有img等字眼。每次查到一种办法，make clean,make all还是一样的错误，后来有个博客说到进到make出来的build文件夹里面去编译，这下opencv的问题暴露出来了。

报错：

.build_release/tools/convert_imageset.o：在函数‘std::string* google::MakeCheckOpString<unsigned long, int>(unsigned long const&, int const&, char const*)’中： convert_imageset.cpp:(.text._ZN6google17MakeCheckOpStringImiEEPSsRKT_RKT0_PKc[_ZN6google17MakeCheckOpStringImiEEPSsRKT_RKT0_PKc]+0x50)：对‘google::base::CheckOpMessageBuilder::NewString()’未定义的引用

　　操作是：

　　cd build

         cmake..

         make all

         为了这个错误尝试过两种方法，都不work:

          1)在Makefile.config line73 给LIBRARIES加上/usr/bin/x86_64_linux_gnu,因为根据提示感觉是找不到opencv的库，而libopencv*.so*等文件就在这个文件夹下，所以就自己琢磨着加了,然而不没有用啊啊啊。

　　 2)Makefile第174行，添加opencv_imgcodecs，结果会报错说找不到这个，所以立即删了，试别的方法。

对Makefile做的修改：

3.5 line348下面添加 CXXFLAGS += -std=c++11

    这个忘记是因为什么问题添加的了。

参考博客：

1、解决nvcc warning : The 'compute_20', 'sm_20', and 'sm_21' architectures are deprecated问题