Echarts-实现结直肠癌知识图谱可视化

最新推荐文章于 2024-07-31 09:25:57 发布
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分类专栏： 知识图谱
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_37665090/article/details/99415102
版权

- 知识图谱可视化的方法
在这里插入图片描述

- Echarts下载

下载地址：https://echarts.baidu.com/download.html
这里选择下载最新的github版本，zip格式
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
- 零基础使用Echarts
1.解压以上下载好的文件；
2.在dist文件夹中新建一个HTML；
这里使用sublime text 3 新建HTML文件（sublime text 3下载，安装插件，新建html）
3.技巧：拷贝Echarts实例（example）开源代码
在Echarts的主页，选择“文档—教程”，就可以看到《5 分钟上手 ECharts》，把示例代码复制到HTML中保存，再用浏览器打开即可看到图表，其基本代码如下：

<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
    <meta charset="utf-8">
    <title>ECharts</title>
    <!-- 引入 echarts.js -->
    <script src="echarts.min.js"></script>
</head>
<body>
    <!-- 为ECharts准备一个具备大小（宽高）的Dom -->
    <div id="main" style="width: 600px;height:400px;"></div>
    <script type="text/javascript">
        // 基于准备好的dom，初始化echarts实例
        var myChart = echarts.init(document.getElementById('main'));

        // 指定图表的配置项和数据
        var option = {
            title: {
                text: 'ECharts 入门示例'
            },
            tooltip: {},
            legend: {
                data:['销量']
            },
            xAxis: {
                data: ["衬衫","羊毛衫","雪纺衫","裤子","高跟鞋","袜子"]
            },
            yAxis: {},
            series: [{
                name: '销量',
                type: 'bar',
                data: [5, 20, 36, 10, 10, 20]
            }]
        };

        // 使用刚指定的配置项和数据显示图表。
        myChart.setOption(option);
    </script>
</body>
</html>

这里，参考ECharts 实现人民的名义关系图谱，作者：Emrys ，出处：http://www.cnblogs.com/emrys5/

- 构建结直肠癌本体
参考资料：
1.中国结直肠癌诊疗规范；
2.结直肠癌ICD-10疾病分类；
3.结直肠癌标准数据集。
这里，未将具体的疾病，症状，检验，检查，治疗等关联起来，只实现展示主要的本体层概念。

- 利用Echarts实现结直肠癌知识图谱可视化

  1. 配置关系图
    首先配置series的type为graph，layout为force，即采用力引导布局。layout可以选择none、circular和force。详见官方文档，设置节点、边、文本标签等。

  2. 设置鼠标移动到节点处显示节点简介tooltip

tooltip: {
                formatter: function (x) {
                    return x.data.des;
                }
            },
  1. 鼠标移到节点上的时候突出显示节点以及节点的边和邻接节点
focusNodeAdjacency : true
  1. 数据
                          {
                            name: '结直肠癌',
                            des: '胃肠道中常见的一种恶性肿瘤',
                            symbolSize: 80,
                            itemStyle: {
                                normal: {
                                    color: '#ef5350'
                                }
                            }
                        }
  1. 关系
                       {
                            source: '临床表现',target: '结直肠癌'
                        },
  1. 全部代码
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
    <meta name="viewport" content="width=device-width,initial-scale=1,  minimum-scale=1, maximum-scale=1,user-scalable=no" />
    <title>结直肠癌知识图谱</title>
    <meta name="viewport" content="width=1250" /> 
    <script src="jquery-1.10.2.min.js"></script>
    <script src="echarts.min.js"></script>
    <style type="text/css">
        html, body, #main { height: 100%; width: 100%; margin: 0; padding: 0 }
        .nav{margin-left: auto; margin-right: auto; width:64px background-color: gray }
    </style>
</head>
<body>
	<div id="header" style=" background-color: #7986cb !important; color: #fff;">
		<img class="logo" src="./logo.png" style="max-height: 31px; float:left;padding: 12px 30px; ">
	<h1 style="margin:0;font-size: 23px; padding: 10px 150px;font-family:  ">
	结直肠癌知识图谱 </h1></div>
    <div id="main" style="margin: 10px auto; width: 1050px; height: calc( 100vh - 100px ); overflow: hidden; border: 1px solid #CCC; border-radius: 10px;"></div>
    <script type="text/javascript">
        var myChart = echarts.init(document.getElementById('main'));
        option = {
            
            tooltip: {
                formatter: function (x) {
                    return x.data.des;
                }
            },


            series: [
                {
                    type: 'graph',
                    layout: 'force',
                    symbolSize: 65,
                    roam: true,
                    
                    edgeSymbolSize: [4, 10],
                    edgeLabel: {
                        normal: {
                            textStyle: {
                                fontSize: 20
                            }
                        }
                    },
                    force: {
                        repulsion: 1550,
                        gravity : 0.95,
                        edgeLength: [10, 50]
                    },
                    draggable: true,
                    focusNodeAdjacency : true,
                    itemStyle: {
                        normal: {
                            color: '#4b565b',
                            borderColor : 'rgba(255,215,0,0.5)',
                            borderWidth : 2,
                            opacity : 0.99 
                        }
                    },
                    lineStyle: {
                        normal: {
                            width: 2
                        }
                    },
                    edgeLabel: {
                        normal: {
                            show: false,
                            formatter: function (x) {
                                return x.data.name;
                            }
                        }
                    },
                    label: {
                        normal: {
                            show: true,
                            position : 'inside',
                            textStyle: {
                            	color : '#4b565b', 
                            	fontSize: 12
                            }
                        }
                    },

                    data: [
                        {
                            name: '结直肠癌',
                            des: '胃肠道中常见的一种恶性肿瘤',
                            symbolSize: 80,
                            itemStyle: {
                                normal: {
                                    color: '#ef5350'
                                }
                            }
                        }, {
                            name: '临床表现',
                            symbolSize: 65,
                            itemStyle: {
                                normal: {
                                    color: 'orange'
                                }
                            }
                        }, {
                            name: '排便习惯改变',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '大便性状改变',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '腹痛或腹部不适',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '腹部肿块',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '肠梗阻相关症状',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '贫血',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '消瘦',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '低热',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        }, {
                            name: '乏力',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#82b1ff'}}
                        },{
                            name: '体格检查',
                            symbolSize: 65,
                            itemStyle: {
                                normal: {
                                    color: 'orange'
                                }
                            }
                        }, {name: '身高',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: '体重',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: '体重指数',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: '体表面积',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: '脉压',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: 'KPS评分',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: 'ECOG评分',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: '收缩压',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {name: '舒张压',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#80cbc4'}}
                        }, {
                            name: '专科检查',
                            symbolSize: 65,
                            itemStyle: {
                                normal: {
                                    color: 'orange'
                                }
                            }
                        }, {name: '腹部肿块 ',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#90a4ae'}}
                        }, {name: '腹部压痛',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#90a4ae'}}
                        }, {name: '移动性浊音标志',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#90a4ae'}}
                        }, {name: '是否有结肠直诊标志',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#90a4ae'}}
                        }, {name: '肿块肠腔内位置',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#90a4ae'}}
                        }, {name: '肿块环绕周径比例',
                            symbolSize: 50,
                            itemStyle: {normal: {color: '#90a4ae'}}
                        }, {name: '肿块上缘距肛距离',
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                        }, {name: '肿块下缘距肛距离',
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                        }, {name: '肿块活动度',
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                        }, {name: '指套染血标志',
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                        }, {name: '盆底结节',
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                        }, {
                            name: '实验室检验',
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                            }
                        }, {name: '血常规',
                            des: '了解有无贫血',
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                        }, {name: '白细胞计数',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
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                        }, {name: '淋巴细胞比率',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '单核细胞比率',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '红细胞计数',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '血红蛋白',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '平均血红蛋白浓度',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '血小板比率',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '血小板平均体积',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '血小板分布宽度',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}

                        }, {name: '尿常规',
                            des: '观察有无血尿，结合泌尿系影像学检查了解肿瘤是否侵犯泌尿系统',
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                        }, {name: '尿糖',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '尿胆红素',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '尿酮体',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '尿蛋白',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '尿胆原',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '上皮细胞',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        

                        }, {name: '便常规',
                            des: '注意有无红细胞、白细胞',
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                        }, {name: '粪便隐血试验',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '颜色',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '性状',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '外观',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '红细胞-粪便',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '白细胞-粪便',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}


                        }, {name: '生化检查',
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                        }, {name: '血尿素氮',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '丙氨酸氨基转移酶',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '天门冬氨酸氨基转移酶',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '总胆红素',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '直接胆红素',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '间接胆红素',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}


                        }, {name: '凝血',
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                        }, {name: '凝血酶原时间',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '活化部分凝血活酶时间',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '凝血酶时间',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}


                        }, {name: '病毒相关检查',
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                        }, {name: 'EB病毒VCA-IgA的抗体',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '乙型肝炎表面抗原定性',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '乙型肝炎表面抗原定量',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}


                        }, {name: '肿瘤标志物',
                            des: '结直肠癌患者在诊断、治疗前、评价疗效、随访时必须检测癌胚抗原、肿瘤标志物',
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                        }, {name: '甲胎蛋白',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '糖类抗原199',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '糖类抗原125',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '糖类抗原153',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '癌胚抗原',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}
                        }, {name: '糖类抗原724',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#f48fb1'}}


                        }, {
                            name: '内镜检查',
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                            }
                        }, {name: '直肠镜',
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                        }, {name: '乙状结肠镜',
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                        }, {name: '全结肠镜',
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                        }, {name: '肿瘤大小',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '息肉数目',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '肿瘤下缘距肛缘距离',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '肿瘤占肠壁',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '肿瘤与周围组织分界',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '是否有息肉标志',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '肠镜能否通过标记',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {name: '肿瘤位置',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#bdbdbd'}}
                        }, {
                            name: '影像学检查',
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                            }
                        }, {name: 'CT',
                            des:'推荐行胸部/全腹/盆腔CT增强扫描检查',
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                        }, {name: '检查部位',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '检查方法',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '影像所见',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '初步诊断',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                            
                        }, {name: 'MR',
                            des: '推荐MR作为直肠癌常规检查项目',
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                        }, {name: 'PET-CT',
                            des: '不推荐常规使用，但对于病情复杂、常规检查无法明确诊断的患者可作为有效的辅助检查。术前检查提示为Ⅲ期以上肿瘤，为推荐使用',
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                        }, {name: '超声',
                            des: '推荐直肠腔内超声用于早期直肠癌（T2期及以下）分期诊断',
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                        }, {name: '主要测值',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}

                        }, {name: '骨扫描',
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                        }, {name: '经直肠超声',
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                        }, {name: '超声描述',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '超声提示',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '上消化道造影',
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                        }, {name: '病变性质',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '病变大小',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}
                        }, {name: '病变位置',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#8c9eff'}}

                        }, {name: 'X线',
                            des: '推荐气钡双重X线造影作为筛查及诊断结直肠癌的检查方法，但不能应用于结直肠癌分期诊断',
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                        }, {
                            name: '病理及免疫组化',
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                            itemStyle: {
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                        }, {name: '阳性淋巴结数目',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '组织学类型',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '转移部位',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '病理标本类型',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '浸润深度',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '血管侵犯标志',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '神经侵犯标志',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}
                        }, {name: '分化程度',symbolSize: 50,itemStyle: {normal: {color: '#4dd0e1'}}


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牛小冲
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