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RSS订阅原创 Linux系统下，去除文件名中的回车符
v 显示修改成功的文件-n 不执行任何操作，用来测试rename过程，可查看测试效果-f 强制修改已经存在的文件perlexpr。
2024-03-11 16:40:53
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原创 Office中ppt保存为高清图像和PDF
前提：安装PDF软件，如 Adobe PDF等PDF阅读器，这里使用的是Adobe Acrobat DC软件，其他软件大概一样的思路。Office软件 在自我保存时和另存为PDF或图片时，默认自动压缩图像，使得原本高分辨的图像在保存后变得模糊。更改只针对该ppt文档，以后新建的ppt也须每次修改，无法应用到全局。里面还有很多设置，可以自行尝试，这里只是举例，不作深入研究。1、默认设置 下拉已有几个默认选项，可以直接选择。保存后可以在默认设置下看到该方案，然后选择。确定后会提示保存方案，
2023-08-04 17:30:09
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原创 【二进制文件】MRC stack文件 转成 多个独立的MRC文件
MRC文件 是冷冻电镜电子显微图像中常用于数据处理的一种图像文件（二进制文件）可以存储二维和三维的图像。需要特殊的解码软件可以显示，如chimera，EMAN等软件。MRC文件一般用.mrc和.mrcs后缀表示，其中.mrcs代表MRC Stack文件。MRC stack文件 和MRC文件的唯一区别就是文件名的后缀不一样，实际上就是MRC文件。后缀名加S的原因是为了将一系列的二维的MRC文件 集合存成一个MRC文件时，区别一般的MRC文件。
2023-03-29 16:44:10
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原创 DELL服务器 ubuntu系统 全新硬盘识别不到问题解决及对硬盘做GPT分区
将全新的SAS硬盘（品牌：DELL）加装好在机架服务器上后，硬盘指示灯为 稳定的绿色。进入系统后输入命令```fdisk -l```查看，却始终没有发现新硬盘设备，识别不到硬盘。
2022-11-25 10:39:55
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原创 ubuntu16.04 安装Relion4.0时 编译报错：error ‘isnan‘ was not declared in this scope
在已安装成功Relion3.1.1版本的Ubuntu系统环境下，尝试升级版本为Relion4.0 beta版。按照官方教程安装时，出现编译问题，即make阶段时 报错 “/src/jaz/tomography/local_particle_refinement.cpp，error ‘isnan’ was not declared in this scope”等类似信息。一直卡在make阶段。
2022-08-19 17:36:58
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原创 Linux系统下某个进程杀不掉，会自动重启
ubuntu服务器下，使用``nvidia-smi``查看GPU使用情况，发现一直存在一个未知的python程序在长期使用GPU，使用``kill``命令杀进程和关机重启都无法解决，该程序会自动重启。
2022-08-11 10:13:32
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原创 python格式化读取解析PDB文件 字符串指定宽度格式化分割
在处理蛋白质模型pdb文件时，遇到字符串中 随机两列数据连着（如下 字符串中的`249.2491515.330`实为两列），使用`split()`函数无法处理，所以想以文件本身的格式来格式化输出。
2022-03-24 08:58:40
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原创 报错：mpirun has detected an attempt to run as root.
问题描述：ubuntu 16.04服务器下安装好openmpi-1.6.5后，测试 mpirun -np 4 hello_c成功；又安装了eman2（依赖conda环境），再进行测试时，未成功报错信息如下：mpirun has detected an attempt to run as root.Running as root is strongly discouraged as any mistake (e.g., in defining >TMPDIR) or bug can resul
2022-02-10 18:23:48
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原创 RELION *.star坐标文件 与 EMAN1.9版本的 *.box文件 格式互转换
基于RELION 3.1.0中star坐标文件格式编写RELION 和EMAN 中图像的坐标原点不同：relion是图像的中心为原点，而eman是以图像的左上角为原点，所以转换时要注意变换关系（相差 boxsize/2）。
2021-08-30 12:23:00
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原创 python format 字符格式化输出
python format格式化输出指定文本长度,对齐,填充my_list = ['123', '456']print("{0[0]:>5}{0[1]:>6}".format(my_list)) 输出结果：> 123 4562.保留小数位a=1.00af=format(a,".3f")print(af)输出结果：>1.000
2021-06-29 10:08:02
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ctffind-4.1.14-linux64-compat.tar.gz
2023-06-14
MotionCor2-1.6.3
2023-03-29
WinCoot-0.9.4.1.exe
2021-06-29
空空如也
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