表达数量性状位点(eQTL)的概念及其相关分析原理
第三个是基因型数据,同样地,除开第一列,其它列都代表不同的样本,每一行代表的是不同的基因型(SNP),一般基因型数据用0,1,2这三个数字编码,代表的是效应等位基因剂量。这里gene1(因变量)一般就是一个基因的表达量,snp1(自变量)就是一个SNP的基因型,两者拟合,矫正相关干扰项(如sex和age等),error_term是指回归模型的误差项。第二个是基因表达量信息,同样地,除开第一列,其它列都代表不同的样本,每一行代表的是不同的基因(一般来说基因表达数据需要先进行标准化转换)。
原创
2023-03-30 10:20:43 ·
1505 阅读 ·
0 评论