在conda中安装python_python – 无法导入在新Conda环境中安装的软件包

我试图在HPC服务器上创建自己的conda python环境,并且发生了一些非常奇怪的事情.

问题

在创建一个新的conda环境后,似乎python没有在这个环境中看到自己,并且使用基础环境…因此我不能使用在新环境中安装的软件包,但我可以看到基础环境中的软件包. .

这就是我做的

我按如下方式安装我的环境：

$conda create -n niml pip python=3.6.5

$source activate niml

(niml) $conda install -c conda-forge luigi

然后我检查我安装的包：

(niml) $conda list

这是我得到的,非常基本的环境：

# Name Version Build Channel

botocore 1.10.61 py_0 conda-forge

ca-certificates 2018.4.16 0 conda-forge

certifi 2018.4.16 py36_0 conda-forge

docutils 0.14 py36_0 conda-forge

jmespath 0.9.3 py_1 conda-forge

libedit 3.1.20170329 h6b74fdf_2

libffi 3.2.1 hd88cf55_4

libgcc-ng 7.2.0 hdf63c60_3

libstdcxx-ng 7.2.0 hdf63c60_3

lockfile 0.12.2 py_1 conda-forge

luigi 2.7.6 py36_0 conda-forge

ncurses 6.1 hf484d3e_0

openssl 1.0.2o 0 conda-forge

pip 10.0.1 py36_0

pyparsing 2.2.0 py_1 conda-forge

python 3.6.5 hc3d631a_2

python-daemon 2.1.2 py36_0

python-dateutil 2.7.3 py_0 conda-forge

readline 7.0 ha6073c6_4

setuptools 39.2.0 py36_0

six 1.11.0 py36_1 conda-forge

sqlite 3.24.0 h84994c4_0

tk 8.6.7 hc745277_3

tornado 4.5.3 py36_0 conda-forge

wheel 0.31.1 py36_0

xz 5.2.4 h14c3975_4

zlib 1.2.11 ha838bed_2

然后我尝试运行python并导入我安装luigi的软件包,它没有发现它出错.

(niml) $python

>>> import luigi

Traceback (most recent call last):

File "", line 1, in

ModuleNotFoundError: No module named 'luigi'

我还尝试导入基本环境中的numpy而不是新环境中的numpy,它可以工作.

>>> import numpy

上面的工作,这意味着python认为它在基础环境中运行.

正在运行我自己环境中的Python

我检查了哪个python正在执行,它确实是新环境niml中的一个：

>>> import sys

>>> sys.executable

'~/.conda/envs/niml/bin/python'

还从命令行检查,它是envrinment中的python可执行文件：

(niml) $which python

~/.conda/envs/niml/bin/python

我在HPC上运行

我之前已经创建了数百次anaconda环境,从未遇到过这个问题.唯一的区别是我使用HPC服务器,因此我不得不做这样的事情：

module load python/anaconda3

这是我从通常的工作流程中看到的唯一区别,可能会产生这个问题……

其他人之前已经看过这个问题并且能够解决它吗？