微信公众号:生信小知识
关注可了解更多的教程及生信知识。问题或建议,请公众号留言;
R语言 PCA主成分分析
前言统计学背景知识协方差相关系数函数总结实例讲解1.载入原始数据2.作主成分分析3.结果解读4.画主成分的碎石图并预测5.PCA结果绘制后记
前言
PCA分析大家肯定经常看到,但是你真的懂PCA分析的结果吗?
图我也会看,我只是不是很清楚PCA背后输出结果的解读而已。正好看到一篇不错的博客,就把主要的知识点记录下 。
reference:
http://www.cnblogs.com/longzhongren/p/4300593.html
https://www.zhihu.com/question/20852004
223.主成分分析PCA
统计学背景知识
协方差
可以通俗的理解为:两个变量在变化过程中是同方向变化?还是反方向变化?同向或反向程度如何?
你变大,同时我也变大,说明两个变量是同向变化的,这时协方差就是正的。
你变大,同时我变小,说明两个变量是反向变化的,这时协方差就是负的。
从数值来看,协方差的数值越大,两个变量同向程度也就越大。反之亦然。
从公式出发来理解一下:
公式简单翻译一下是&