sklearn 绘制roc曲线_GraphPad Prism绘制ROC曲线具体操作步骤 「杏花开生物医药统计」...

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在前期的文章中,我们详细讲解了用GraphPad Prism绘制柱状图和箱式图以及生存曲线图,请大家详细观看下方文章:

《GraphPad Prism科研统计绘图教程之Prism绘制柱状图》

《GraphPad Prism绘制生存曲线详细教程》

今天,我们就来详细讲解一下如何在GraphPad Prism中绘制ROC曲线图。

案例数据:以下是67位患者的阳性淋巴结总个数的数据以及对应的某疾病的病理情况,0表示未病发,1表示病发,显然这里就需要分析绘制阳性淋巴结总个数对此病理的ROC曲线了(图1)

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图1

在GraphPad Prism中绘制ROC曲线的操作步骤:

①打开GraphPad Prism软件,新建一个“Column”的表单,准备录入数据。(图2)

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好的,我可以回答您的问题。您可以按照以下步骤在sklearn绘制ROC曲线: 1. 准备数据:首先,您需要准备测试数据集和训练数据集。您还需要使用训练数据集来训练逻辑回归模型。 2. 训练模型:使用训练数据集训练逻辑回归模型。您可以使用以下代码: ``` from sklearn.linear_model import LogisticRegression # 创建逻辑回归对象 lr = LogisticRegression() # 使用训练数据集来训练模型 lr.fit(X_train, y_train) ``` 3. 预测概率:使用测试数据集来预测类别概率。您可以使用以下代码: ``` # 预测测试数据集的类别概率 y_pred_proba = lr.predict_proba(X_test)[:,1] ``` 4. 计算ROC曲线数据:计算真阳性率(TPR)和假阳性率(FPR)。您可以使用以下代码: ``` from sklearn.metrics import roc_curve, auc # 计算ROC曲线数据 fpr,tpr,thresholds = roc_curve(y_test, y_pred_proba) roc_auc = auc(fpr,tpr) ``` 5. 绘制ROC曲线:使用Matplotlib库绘制ROC曲线。您可以使用以下代码: ``` import matplotlib.pyplot as plt # 绘制ROC曲线 plt.title('Receiver Operating Characteristic') plt.plot(fpr, tpr, 'b', label = 'AUC = %0.2f' % roc_auc) plt.legend(loc = 'lower right') plt.plot([0, 1], [0, 1],'r--') plt.xlim([0, 1]) plt.ylim([0, 1]) plt.ylabel('True Positive Rate') plt.xlabel('False Positive Rate') plt.show() ``` 这是在sklearn绘制ROC曲线的简单步骤。同时,您还可以使用KS曲线来评估模型性能。
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