计算机模拟与生物学,刘海燕——中国科学技术大学——生物大分子的计算机模拟与蛋白质空间结构的生物信息学。目前研究内容包括在原子运动层次描述大分子和溶液体系中化学反应、构象变化、蛋白与多肽折叠等活化过程的...

导师姓名：刘海燕　　       导师类别：硕士生导师

姓名：

刘海燕

性别：

男

出生年月：

1969-01

所在院校：

中国科学技术大学

所在院系：

生命科学学院

职称：

教授

招生专业：

生物化学与分子生物学

研究领域：

生物大分子的计算机模拟与蛋白质空间结构的生物信息学。目前研究内容包括在原子运动层次描述大分子和溶液体系中化学反应、构象变化、蛋白与多肽折叠等活化过程的模型与计算方法；上述模型与方法在阐明生物学结构功能关系和分子设计中的应用；结构基因组研究中生物信息学方法的应用。中长期研究兴趣包括在日趋系统的、从整体角度出发的生命科学研究中计算生物学和生物信息学工具的发展与应用。

联系方式

E-Mail：

电话：

邮编：

230026

地址：

安徽合肥中国科学技术大学生命科学学院

个人简介

刘海燕，男，教授，博士生导师。“国家杰出青年基金”、中科院“百人计划”获得者。

1969年出生，籍贯：四川。1996年毕业于中国科学技术大学生物系，获博士学位。曾于1993-1995年作为联合培养研究生在瑞士苏黎世高等理工学院物理化学实验室学习，1998-2000年在杜克大学和北卡罗来纳大学作博士后研究。现为我校生命科学学院教授、博士生导师;分子生物学与细胞生物学系系主任。在J. Am. Chem. Soc.、J. Mol. Biol.、J. Chem. Phys.等杂志发表研究论文四十余篇。2000年入选中国科学院“引进国外杰出人才”项目。2001年获“国家杰出青年基金”资助。

获得奖项

2000年入选中国科学院“引进国外杰出人才”项目。2001年获“国家杰出青年基金”资助。

著作及论文

1. Jun Wang; Haiyan Liu*; Determination of conformational free energies of peptides by multidimensional adaptive umbrella sampling, J.Chem.Phys., 2006, 125 (9): Art. No. 094907

2. Sanmei Cheng；Yuedong Yang; Wenrui Wang; Haiyan Liu* Transition State Ensemble for the Folding of B Domain of Protein A: A Comparison of Distributed Molecular Dynamics Simulations with Experiments; J．Phys. Chem. B.109(49)2005,23645-23654.

3. Li Xie, Haiyan Liu*, Yang Weitao; Adapting the nudged elastic band method for determining minimum-energy paths of chemical reactions in enzymes, J. Chem. Phys., 2004, 120,8039.

4. Zhiyong Zhang, Yunyu Shi*, and Haiyan Liu*, Molecular dynamics simulations of peptides and proteins with amplified collective motions. Biophys. J., 2003,84,3583.

5. Jiang Zhu, Yunyu Shi*, and Haiyan Liu*; Parametrization of a Generalized Born/Solvent-Accessible Surface Area Model and Applications to the Simulation of Protein Dynamics; J. Phys. Chem. B 2002, 106, 4844-4853.

承担项目

“863”课题,“院创新重点”课题“国家自然科学基金重大研究计划“面上课题